71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2883 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2883  hypothetical protein  100 
 
 		 273 aa  564  1e-160  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1042  protein of unknown function DUF932  83.52 
 
 		 273 aa  488  1e-137  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.995076  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0931  protein of unknown function DUF932  84.01 
 
 		 273 aa  477  1e-134  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3134  hypothetical protein  82.53 
 
 		 273 aa  478  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.112064  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3354  protein of unknown function DUF932  83.88 
 
 		 273 aa  471  1e-132  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3441  hypothetical protein  75.28 
 
 		 272 aa  435  1e-121  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4682  hypothetical protein  71.85 
 
 		 272 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1400  hypothetical protein  71.48 
 
 		 272 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.188272 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3207  hypothetical protein  71.11 
 
 		 272 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3348  hypothetical protein  70.74 
 
 		 272 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1064  hypothetical protein  71.22 
 
 		 273 aa  396  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0274991 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4894  hypothetical protein  70.37 
 
 		 272 aa  397  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3408  hypothetical protein  70.74 
 
 		 272 aa  396  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4802  hypothetical protein  70.37 
 
 		 272 aa  395  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.722196 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1123  hypothetical protein  71.38 
 
 		 315 aa  395  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2248  hypothetical protein  69.63 
 
 		 272 aa  394  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0754  hypothetical protein  70.52 
 
 		 273 aa  393  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2853  hypothetical protein  70.85 
 
 		 273 aa  394  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0666809 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0034  hypothetical protein  63.81 
 
 		 273 aa  378  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0045  hypothetical protein  64.29 
 
 		 273 aa  374  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4279  hypothetical protein  59.4 
 
 		 273 aa  345  5e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4210  hypothetical protein  58.36 
 
 		 274 aa  318  7.999999999999999e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.0000000592317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2835  protein of unknown function DUF932  54.44 
 
 		 275 aa  314  9.999999999999999e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.254935  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2321  hypothetical protein  54.1 
 
 		 275 aa  314  9.999999999999999e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000877089  hitchhiker  0.0000215746 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2734  hypothetical protein  54.41 
 
 		 275 aa  311  7.999999999999999e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3034  hypothetical protein  54.41 
 
 		 275 aa  311  7.999999999999999e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.195535 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1477  hypothetical protein  53.87 
 
 		 276 aa  310  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3741  hypothetical protein  53.87 
 
 		 276 aa  310  1e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2944  hypothetical protein  54.04 
 
 		 275 aa  310  2e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.410202  normal  0.63653 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2611  protein of unknown function DUF932  55.19 
 
 		 274 aa  309  2.9999999999999997e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.30719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0468  hypothetical protein  54.85 
 
 		 274 aa  309  4e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2618  homologue to gene 32 protein of F plasmid  53.87 
 
 		 276 aa  308  5e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2571  putative F plasmid gene 32-like protein  54.04 
 
 		 277 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1973  hypothetical protein  53.16 
 
 		 274 aa  306  3e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3535  protein of unknown function DUF932  53.51 
 
 		 276 aa  306  3e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0664  protein of unknown function DUF932  52.96 
 
 		 275 aa  305  5.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.865139 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0679  hypothetical protein  53.9 
 
 		 274 aa  304  1.0000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0478  hypothetical protein  53.31 
 
 		 277 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.724029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1782  putative F plasmid gene 32-like protein  53.68 
 
 		 277 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6929  hypothetical protein  54.81 
 
 		 275 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.247635  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2041  hypothetical protein  53.56 
 
 		 273 aa  302  5.000000000000001e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00582058  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0030  hypothetical protein  56.09 
 
 		 278 aa  301  8.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0366118  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0025  hypothetical protein  56.09 
 
 		 278 aa  300  1e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000725071  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2321  hypothetical protein  52.22 
 
 		 275 aa  300  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.555725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4158  hypothetical protein  54.48 
 
 		 275 aa  300  2e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0629718 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4156  hypothetical protein  54.07 
 
 		 275 aa  298  9e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418419  normal  0.860751 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31200  hypothetical protein  53.9 
 
 		 274 aa  296  2e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000120267  unclonable  1.6824e-22 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1869  protein of unknown function DUF932  53.53 
 
 		 274 aa  294  1e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1244  hypothetical protein  52.79 
 
 		 274 aa  291  6e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0562318 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4995  protein of unknown function DUF932  55.34 
 
 		 275 aa  289  3e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0426401  normal  0.148352 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2639  hypothetical protein  52.42 
 
 		 274 aa  288  5.0000000000000004e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.562022  normal  0.0586282 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1276  protein of unknown function DUF932  52.79 
 
 		 274 aa  288  7e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1665  putative F plasmid protein  52.54 
 
 		 287 aa  287  1e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0729576  normal  0.601822 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5400  protein of unknown function DUF932  54.2 
 
 		 275 aa  285  8e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7557  hypothetical protein  53.7 
 
 		 274 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0368604 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0781  hypothetical protein  50.36 
 
 		 295 aa  270  2.9999999999999997e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000001098 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7306  hypothetical protein  46.67 
 
 		 312 aa  247  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3899  hypothetical protein  47.04 
 
 		 287 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3678  hypothetical protein  45.56 
 
 		 281 aa  242  5e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6201  protein of unknown function DUF932  44.96 
 
 		 295 aa  227  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.571939  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0001  hypothetical protein  44.31 
 
 		 266 aa  227  2e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000235069  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4386  hypothetical protein  44.4 
 
 		 316 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00134743  normal  0.817249 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0246  protein of unknown function DUF932  52.66 
 
 		 196 aa  189  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6482  protein of unknown function DUF932  50.89 
 
 		 196 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7328  protein of unknown function DUF932  49.12 
 
 		 197 aa  178  8e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.792728  hitchhiker  0.00281621 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4460  hypothetical protein  35.06 
 
 		 288 aa  133  3.9999999999999996e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.629717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6477  protein of unknown function DUF932  52.07 
 
 		 123 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1214  hypothetical protein  32.58 
 
 		 281 aa  127  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.839406 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7323  protein of unknown function DUF932  50.82 
 
 		 124 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000418502  hitchhiker  0.000715809 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0251  protein of unknown function DUF932  50.41 
 
 		 123 aa  123  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4368  hypothetical protein  32.06 
 
 		 283 aa  122  8e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>