68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0251 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0251  protein of unknown function DUF932  100 
 
 
123 aa  254  4e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6477  protein of unknown function DUF932  84.55 
 
 
123 aa  225  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0478  hypothetical protein  100 
 
 
277 aa  225  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.724029  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1782  putative F plasmid gene 32-like protein  74.8 
 
 
277 aa  197  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2571  putative F plasmid gene 32-like protein  73.17 
 
 
277 aa  194  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7323  protein of unknown function DUF932  73.39 
 
 
124 aa  188  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000418502  hitchhiker  0.000715809 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4210  hypothetical protein  66.67 
 
 
274 aa  169  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.0000000592317  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1869  protein of unknown function DUF932  65.04 
 
 
274 aa  166  7e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31200  hypothetical protein  64.23 
 
 
274 aa  166  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000120267  unclonable  1.6824e-22 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1973  hypothetical protein  64.23 
 
 
274 aa  165  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0664  protein of unknown function DUF932  63.41 
 
 
275 aa  164  5e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.865139 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2944  hypothetical protein  64.23 
 
 
275 aa  164  5e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.410202  normal  0.63653 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0679  hypothetical protein  63.41 
 
 
274 aa  163  5.9999999999999996e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1276  protein of unknown function DUF932  64.23 
 
 
274 aa  163  6.9999999999999995e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1244  hypothetical protein  64.23 
 
 
274 aa  163  6.9999999999999995e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0562318 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3034  hypothetical protein  64.23 
 
 
275 aa  162  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.195535 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2734  hypothetical protein  64.23 
 
 
275 aa  162  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2835  protein of unknown function DUF932  62.6 
 
 
275 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.254935  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1477  hypothetical protein  64.23 
 
 
276 aa  160  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2639  hypothetical protein  62.6 
 
 
274 aa  160  6e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.562022  normal  0.0586282 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2321  hypothetical protein  62.6 
 
 
275 aa  159  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000877089  hitchhiker  0.0000215746 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4158  hypothetical protein  62.6 
 
 
275 aa  158  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0629718 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2321  hypothetical protein  60.98 
 
 
275 aa  157  6e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.555725  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4156  hypothetical protein  62.6 
 
 
275 aa  156  7e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418419  normal  0.860751 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6929  hypothetical protein  60.16 
 
 
275 aa  156  8e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.247635  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3741  hypothetical protein  62.6 
 
 
276 aa  156  9e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2618  homologue to gene 32 protein of F plasmid  62.6 
 
 
276 aa  156  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3535  protein of unknown function DUF932  62.6 
 
 
276 aa  156  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2611  protein of unknown function DUF932  62.81 
 
 
274 aa  155  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.30719  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2041  hypothetical protein  58.54 
 
 
273 aa  153  6e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00582058  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0468  hypothetical protein  61.98 
 
 
274 aa  153  9e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4995  protein of unknown function DUF932  66.04 
 
 
275 aa  148  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0426401  normal  0.148352 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5400  protein of unknown function DUF932  65.09 
 
 
275 aa  147  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1665  putative F plasmid protein  56.56 
 
 
287 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0729576  normal  0.601822 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0781  hypothetical protein  52.38 
 
 
295 aa  140  7e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000001098 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0030  hypothetical protein  56.1 
 
 
278 aa  140  8e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0366118  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0025  hypothetical protein  55.28 
 
 
278 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000725071  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7557  hypothetical protein  62.16 
 
 
274 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0368604 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1400  hypothetical protein  52.03 
 
 
272 aa  136  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.188272 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2853  hypothetical protein  52.03 
 
 
273 aa  136  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0666809 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1064  hypothetical protein  52.03 
 
 
273 aa  135  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0274991 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0045  hypothetical protein  50.81 
 
 
273 aa  134  4e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0034  hypothetical protein  50.81 
 
 
273 aa  134  4e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4802  hypothetical protein  52.03 
 
 
272 aa  134  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.722196 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1123  hypothetical protein  52.07 
 
 
315 aa  133  6.0000000000000005e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3207  hypothetical protein  52.03 
 
 
272 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3441  hypothetical protein  51.61 
 
 
272 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4894  hypothetical protein  51.22 
 
 
272 aa  130  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4682  hypothetical protein  51.22 
 
 
272 aa  130  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3134  hypothetical protein  54.62 
 
 
273 aa  130  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.112064  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3354  protein of unknown function DUF932  52.5 
 
 
273 aa  130  7.999999999999999e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2248  hypothetical protein  51.22 
 
 
272 aa  130  7.999999999999999e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1042  protein of unknown function DUF932  52.94 
 
 
273 aa  130  7.999999999999999e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.995076  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3408  hypothetical protein  51.22 
 
 
272 aa  128  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0931  protein of unknown function DUF932  51.67 
 
 
273 aa  127  4.0000000000000003e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3348  hypothetical protein  48.78 
 
 
272 aa  124  5e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2883  hypothetical protein  50.41 
 
 
273 aa  123  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0754  hypothetical protein  50.41 
 
 
273 aa  121  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4279  hypothetical protein  48.7 
 
 
273 aa  119  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219978  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6201  protein of unknown function DUF932  42.5 
 
 
295 aa  103  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.571939  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3899  hypothetical protein  40.87 
 
 
287 aa  100  7e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3678  hypothetical protein  37.7 
 
 
281 aa  92.4  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4386  hypothetical protein  38.26 
 
 
316 aa  91.3  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00134743  normal  0.817249 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7306  hypothetical protein  34.43 
 
 
312 aa  85.5  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481789  normal 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0001  hypothetical protein  39.39 
 
 
266 aa  75.5  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000235069  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4460  hypothetical protein  38.46 
 
 
288 aa  68.2  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.629717  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1214  hypothetical protein  37.89 
 
 
281 aa  61.2  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.839406 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4368  hypothetical protein  34.74 
 
 
283 aa  59.3  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>