71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6201 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6201  protein of unknown function DUF932  100 
 
 		 295 aa  601  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.571939  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2321  hypothetical protein  45.39 
 
 		 275 aa  249  5e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000877089  hitchhiker  0.0000215746 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1665  putative F plasmid protein  46.69 
 
 		 287 aa  248  8e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0729576  normal  0.601822 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1782  putative F plasmid gene 32-like protein  47 
 
 		 277 aa  246  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0781  hypothetical protein  46.18 
 
 		 295 aa  245  8e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000001098 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0468  hypothetical protein  46.62 
 
 		 274 aa  241  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2835  protein of unknown function DUF932  43.82 
 
 		 275 aa  240  2e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.254935  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2571  putative F plasmid gene 32-like protein  45.94 
 
 		 277 aa  240  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2611  protein of unknown function DUF932  46.62 
 
 		 274 aa  239  5e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.30719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2944  hypothetical protein  45.55 
 
 		 275 aa  239  5e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.410202  normal  0.63653 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2734  hypothetical protein  45.23 
 
 		 275 aa  238  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4158  hypothetical protein  45.2 
 
 		 275 aa  238  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0629718 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3034  hypothetical protein  45.23 
 
 		 275 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.195535 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2321  hypothetical protein  45.2 
 
 		 275 aa  237  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.555725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1477  hypothetical protein  45.04 
 
 		 276 aa  236  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0664  protein of unknown function DUF932  43.42 
 
 		 275 aa  236  3e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.865139 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1973  hypothetical protein  44.48 
 
 		 274 aa  235  8e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2041  hypothetical protein  45.22 
 
 		 273 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00582058  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0679  hypothetical protein  44.48 
 
 		 274 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3741  hypothetical protein  45.04 
 
 		 276 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6929  hypothetical protein  43.93 
 
 		 275 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.247635  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3134  hypothetical protein  43.82 
 
 		 273 aa  233  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.112064  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1042  protein of unknown function DUF932  45.29 
 
 		 273 aa  231  8.000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.995076  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4210  hypothetical protein  45.1 
 
 		 274 aa  231  8.000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.0000000592317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3535  protein of unknown function DUF932  44.68 
 
 		 276 aa  230  2e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2639  hypothetical protein  44.48 
 
 		 274 aa  229  4e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.562022  normal  0.0586282 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2618  homologue to gene 32 protein of F plasmid  45.04 
 
 		 276 aa  229  4e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4156  hypothetical protein  46.26 
 
 		 275 aa  228  8e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418419  normal  0.860751 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0478  hypothetical protein  42.05 
 
 		 277 aa  228  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.724029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1244  hypothetical protein  44.13 
 
 		 274 aa  226  4e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0562318 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31200  hypothetical protein  44.13 
 
 		 274 aa  225  9e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000120267  unclonable  1.6824e-22 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1869  protein of unknown function DUF932  44.13 
 
 		 274 aa  224  1e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0045  hypothetical protein  41.9 
 
 		 273 aa  224  1e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3441  hypothetical protein  43.49 
 
 		 272 aa  223  2e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1276  protein of unknown function DUF932  43.77 
 
 		 274 aa  222  4.9999999999999996e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0001  hypothetical protein  45.59 
 
 		 266 aa  222  4.9999999999999996e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000235069  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0034  hypothetical protein  41.55 
 
 		 273 aa  222  6e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0931  protein of unknown function DUF932  43.88 
 
 		 273 aa  221  9.999999999999999e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4279  hypothetical protein  44.16 
 
 		 273 aa  219  3.9999999999999997e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219978  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5400  protein of unknown function DUF932  48 
 
 		 275 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3354  protein of unknown function DUF932  45.79 
 
 		 273 aa  219  6e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0030  hypothetical protein  44.2 
 
 		 278 aa  219  6e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0366118  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4995  protein of unknown function DUF932  46.74 
 
 		 275 aa  218  8.999999999999998e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0426401  normal  0.148352 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7306  hypothetical protein  42.76 
 
 		 312 aa  217  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481789  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2883  hypothetical protein  44.96 
 
 		 273 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1123  hypothetical protein  42.09 
 
 		 315 aa  216  4e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0025  hypothetical protein  44.57 
 
 		 278 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000725071  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1064  hypothetical protein  42.14 
 
 		 273 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0274991 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2853  hypothetical protein  41.73 
 
 		 273 aa  211  7.999999999999999e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0666809 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4802  hypothetical protein  41.79 
 
 		 272 aa  209  5e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.722196 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3207  hypothetical protein  41.37 
 
 		 272 aa  207  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4894  hypothetical protein  41.01 
 
 		 272 aa  207  2e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3348  hypothetical protein  41.43 
 
 		 272 aa  207  2e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3408  hypothetical protein  42.14 
 
 		 272 aa  207  2e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2248  hypothetical protein  41.07 
 
 		 272 aa  206  4e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4682  hypothetical protein  41.01 
 
 		 272 aa  205  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1400  hypothetical protein  41.37 
 
 		 272 aa  205  8e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.188272 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0754  hypothetical protein  43.77 
 
 		 273 aa  205  8e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3899  hypothetical protein  41.94 
 
 		 287 aa  204  1e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7557  hypothetical protein  43.26 
 
 		 274 aa  203  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0368604 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4386  hypothetical protein  40.93 
 
 		 316 aa  200  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00134743  normal  0.817249 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3678  hypothetical protein  37.72 
 
 		 281 aa  194  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4368  hypothetical protein  34.48 
 
 		 283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4460  hypothetical protein  35.58 
 
 		 288 aa  147  3e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.629717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6482  protein of unknown function DUF932  43.09 
 
 		 196 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7328  protein of unknown function DUF932  42.22 
 
 		 197 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.792728  hitchhiker  0.00281621 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1214  hypothetical protein  33.59 
 
 		 281 aa  138  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.839406 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0246  protein of unknown function DUF932  39.78 
 
 		 196 aa  136  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6477  protein of unknown function DUF932  44.17 
 
 		 123 aa  103  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0251  protein of unknown function DUF932  42.5 
 
 		 123 aa  103  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7323  protein of unknown function DUF932  44.63 
 
 		 124 aa  100  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000418502  hitchhiker  0.000715809 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>