68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6477 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6477  protein of unknown function DUF932  100 
 
 		 123 aa  254  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0251  protein of unknown function DUF932  84.55 
 
 		 123 aa  225  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2571  putative F plasmid gene 32-like protein  78.86 
 
 		 277 aa  206  9e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1782  putative F plasmid gene 32-like protein  78.86 
 
 		 277 aa  206  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0478  hypothetical protein  82.41 
 
 		 277 aa  197  6e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.724029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7323  protein of unknown function DUF932  72.58 
 
 		 124 aa  192  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000418502  hitchhiker  0.000715809 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1869  protein of unknown function DUF932  70.73 
 
 		 274 aa  183  7e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4210  hypothetical protein  70.73 
 
 		 274 aa  183  8e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.0000000592317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31200  hypothetical protein  69.92 
 
 		 274 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000120267  unclonable  1.6824e-22 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1244  hypothetical protein  69.92 
 
 		 274 aa  180  7e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0562318 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1276  protein of unknown function DUF932  69.92 
 
 		 274 aa  179  8.000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0679  hypothetical protein  69.11 
 
 		 274 aa  179  9.000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0664  protein of unknown function DUF932  69.92 
 
 		 275 aa  179  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.865139 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2835  protein of unknown function DUF932  68.29 
 
 		 275 aa  177  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.254935  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3034  hypothetical protein  69.92 
 
 		 275 aa  177  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.195535 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2734  hypothetical protein  69.92 
 
 		 275 aa  177  4e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2321  hypothetical protein  69.92 
 
 		 275 aa  177  4e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.555725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2639  hypothetical protein  68.29 
 
 		 274 aa  176  9e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.562022  normal  0.0586282 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1973  hypothetical protein  67.48 
 
 		 274 aa  175  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2944  hypothetical protein  69.11 
 
 		 275 aa  174  3e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.410202  normal  0.63653 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1477  hypothetical protein  69.11 
 
 		 276 aa  173  8e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2611  protein of unknown function DUF932  68.6 
 
 		 274 aa  168  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.30719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3741  hypothetical protein  66.67 
 
 		 276 aa  167  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4156  hypothetical protein  66.67 
 
 		 275 aa  167  4e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418419  normal  0.860751 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4158  hypothetical protein  65.85 
 
 		 275 aa  167  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0629718 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3535  protein of unknown function DUF932  66.67 
 
 		 276 aa  167  5e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2618  homologue to gene 32 protein of F plasmid  66.67 
 
 		 276 aa  167  5e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2321  hypothetical protein  63.41 
 
 		 275 aa  164  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000877089  hitchhiker  0.0000215746 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0468  hypothetical protein  66.94 
 
 		 274 aa  164  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6929  hypothetical protein  61.79 
 
 		 275 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.247635  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2041  hypothetical protein  60.98 
 
 		 273 aa  158  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00582058  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5400  protein of unknown function DUF932  66.04 
 
 		 275 aa  152  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4995  protein of unknown function DUF932  65.09 
 
 		 275 aa  151  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0426401  normal  0.148352 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1665  putative F plasmid protein  57.38 
 
 		 287 aa  147  4e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0729576  normal  0.601822 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7557  hypothetical protein  64.86 
 
 		 274 aa  145  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0368604 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0025  hypothetical protein  57.26 
 
 		 278 aa  144  5e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000725071  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0030  hypothetical protein  56.45 
 
 		 278 aa  143  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0366118  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0045  hypothetical protein  55.65 
 
 		 273 aa  142  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0034  hypothetical protein  55.65 
 
 		 273 aa  142  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2853  hypothetical protein  55.28 
 
 		 273 aa  140  5e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0666809 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1400  hypothetical protein  56.1 
 
 		 272 aa  140  7e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.188272 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0781  hypothetical protein  52.38 
 
 		 295 aa  139  9e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000001098 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1064  hypothetical protein  55.28 
 
 		 273 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0274991 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1123  hypothetical protein  55.37 
 
 		 315 aa  138  3e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4802  hypothetical protein  55.28 
 
 		 272 aa  138  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.722196 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3354  protein of unknown function DUF932  57.39 
 
 		 273 aa  137  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1042  protein of unknown function DUF932  57.39 
 
 		 273 aa  137  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.995076  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4682  hypothetical protein  55.28 
 
 		 272 aa  135  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4894  hypothetical protein  53.66 
 
 		 272 aa  134  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0931  protein of unknown function DUF932  56.52 
 
 		 273 aa  134  4e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3207  hypothetical protein  54.47 
 
 		 272 aa  133  7.000000000000001e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2248  hypothetical protein  53.66 
 
 		 272 aa  133  7.000000000000001e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3408  hypothetical protein  53.66 
 
 		 272 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3134  hypothetical protein  54.78 
 
 		 273 aa  132  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.112064  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3441  hypothetical protein  51.61 
 
 		 272 aa  131  3e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2883  hypothetical protein  52.07 
 
 		 273 aa  128  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3348  hypothetical protein  52.03 
 
 		 272 aa  128  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4279  hypothetical protein  53.04 
 
 		 273 aa  127  4.0000000000000003e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0754  hypothetical protein  53.21 
 
 		 273 aa  125  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3899  hypothetical protein  46.09 
 
 		 287 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3678  hypothetical protein  42.62 
 
 		 281 aa  105  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6201  protein of unknown function DUF932  44.17 
 
 		 295 aa  103  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.571939  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4386  hypothetical protein  43.48 
 
 		 316 aa  99.4  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00134743  normal  0.817249 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7306  hypothetical protein  38.84 
 
 		 312 aa  95.5  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0001  hypothetical protein  42.42 
 
 		 266 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000235069  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4460  hypothetical protein  37.5 
 
 		 288 aa  71.2  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.629717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1214  hypothetical protein  38.54 
 
 		 281 aa  63.2  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.839406 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4368  hypothetical protein  37.89 
 
 		 283 aa  62.8  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>