71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2041 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2041  hypothetical protein  100 
 
 
273 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00582058  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4210  hypothetical protein  68.86 
 
 
274 aa  385  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.0000000592317  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1782  putative F plasmid gene 32-like protein  63.04 
 
 
277 aa  380  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2944  hypothetical protein  63.27 
 
 
275 aa  367  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.410202  normal  0.63653 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2321  hypothetical protein  62.91 
 
 
275 aa  369  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.555725  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2835  protein of unknown function DUF932  63.5 
 
 
275 aa  366  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.254935  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0664  protein of unknown function DUF932  63.14 
 
 
275 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.865139 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2571  putative F plasmid gene 32-like protein  60.87 
 
 
277 aa  365  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0478  hypothetical protein  60.51 
 
 
277 aa  364  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.724029  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0468  hypothetical protein  63.37 
 
 
274 aa  365  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2321  hypothetical protein  62.18 
 
 
275 aa  366  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000877089  hitchhiker  0.0000215746 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2734  hypothetical protein  62.18 
 
 
275 aa  364  1e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3034  hypothetical protein  62.18 
 
 
275 aa  364  1e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.195535 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2611  protein of unknown function DUF932  62.27 
 
 
274 aa  363  2e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.30719  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6929  hypothetical protein  63.87 
 
 
275 aa  362  3e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.247635  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4158  hypothetical protein  62.91 
 
 
275 aa  360  1e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0629718 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3741  hypothetical protein  61.96 
 
 
276 aa  359  3e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3535  protein of unknown function DUF932  61.96 
 
 
276 aa  357  9e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1477  hypothetical protein  61.59 
 
 
276 aa  357  9.999999999999999e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0025  hypothetical protein  62.5 
 
 
278 aa  355  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000725071  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2618  homologue to gene 32 protein of F plasmid  61.23 
 
 
276 aa  355  5e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0679  hypothetical protein  61.68 
 
 
274 aa  353  1e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1973  hypothetical protein  60.95 
 
 
274 aa  353  2e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0030  hypothetical protein  62.36 
 
 
278 aa  353  2e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0366118  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7557  hypothetical protein  64.47 
 
 
274 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0368604 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4156  hypothetical protein  60.95 
 
 
275 aa  346  3e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418419  normal  0.860751 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31200  hypothetical protein  62.18 
 
 
274 aa  346  3e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000120267  unclonable  1.6824e-22 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2639  hypothetical protein  62.04 
 
 
274 aa  345  4e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.562022  normal  0.0586282 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1869  protein of unknown function DUF932  61.82 
 
 
274 aa  345  4e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5400  protein of unknown function DUF932  63.26 
 
 
275 aa  343  1e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4995  protein of unknown function DUF932  62.12 
 
 
275 aa  342  4e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0426401  normal  0.148352 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1244  hypothetical protein  61.82 
 
 
274 aa  342  5e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0562318 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1276  protein of unknown function DUF932  61.45 
 
 
274 aa  338  5.9999999999999996e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0045  hypothetical protein  55.68 
 
 
273 aa  328  8e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0034  hypothetical protein  55.31 
 
 
273 aa  325  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0781  hypothetical protein  55.76 
 
 
295 aa  317  2e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000001098 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1665  putative F plasmid protein  54.8 
 
 
287 aa  312  2.9999999999999996e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0729576  normal  0.601822 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3441  hypothetical protein  53.51 
 
 
272 aa  307  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1042  protein of unknown function DUF932  54.68 
 
 
273 aa  307  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.995076  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0931  protein of unknown function DUF932  53.18 
 
 
273 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3134  hypothetical protein  52.81 
 
 
273 aa  301  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.112064  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3354  protein of unknown function DUF932  54.31 
 
 
273 aa  294  1e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0754  hypothetical protein  53.7 
 
 
273 aa  293  2e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3207  hypothetical protein  53.16 
 
 
272 aa  291  6e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4682  hypothetical protein  52.42 
 
 
272 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4894  hypothetical protein  52.79 
 
 
272 aa  290  2e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2883  hypothetical protein  53.56 
 
 
273 aa  287  1e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2248  hypothetical protein  52.42 
 
 
272 aa  286  2e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2853  hypothetical protein  52.96 
 
 
273 aa  286  4e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0666809 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1123  hypothetical protein  52.79 
 
 
315 aa  284  9e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1064  hypothetical protein  52.96 
 
 
273 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0274991 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4802  hypothetical protein  51.67 
 
 
272 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.722196 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3348  hypothetical protein  51.67 
 
 
272 aa  282  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4279  hypothetical protein  48.35 
 
 
273 aa  282  3.0000000000000004e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219978  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1400  hypothetical protein  50.93 
 
 
272 aa  281  6.000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.188272 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3408  hypothetical protein  51.67 
 
 
272 aa  281  9e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3899  hypothetical protein  50.74 
 
 
287 aa  270  2e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4386  hypothetical protein  49.63 
 
 
316 aa  259  4e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00134743  normal  0.817249 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3678  hypothetical protein  45.17 
 
 
281 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6201  protein of unknown function DUF932  45.22 
 
 
295 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.571939  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7306  hypothetical protein  45.56 
 
 
312 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481789  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6482  protein of unknown function DUF932  59.54 
 
 
196 aa  226  4e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109206  normal 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0001  hypothetical protein  42.15 
 
 
266 aa  222  4.9999999999999996e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000235069  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0246  protein of unknown function DUF932  57.23 
 
 
196 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7328  protein of unknown function DUF932  56.65 
 
 
197 aa  207  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.792728  hitchhiker  0.00281621 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6477  protein of unknown function DUF932  60.98 
 
 
123 aa  158  7e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0251  protein of unknown function DUF932  58.54 
 
 
123 aa  153  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7323  protein of unknown function DUF932  60.48 
 
 
124 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000418502  hitchhiker  0.000715809 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4460  hypothetical protein  34.71 
 
 
288 aa  146  3e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.629717  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1214  hypothetical protein  33.46 
 
 
281 aa  144  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.839406 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4368  hypothetical protein  33.21 
 
 
283 aa  138  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>