71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_1400 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_1400  hypothetical protein  100 
 
 
272 aa  566  1e-160  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.188272 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4682  hypothetical protein  95.22 
 
 
272 aa  519  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3207  hypothetical protein  92.65 
 
 
272 aa  508  1e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3408  hypothetical protein  91.54 
 
 
272 aa  501  1e-141  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4894  hypothetical protein  91.54 
 
 
272 aa  503  1e-141  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2853  hypothetical protein  91.94 
 
 
273 aa  501  1e-141  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0666809 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1123  hypothetical protein  92.25 
 
 
315 aa  503  1e-141  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1064  hypothetical protein  91.58 
 
 
273 aa  501  1e-141  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0274991 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4802  hypothetical protein  90.81 
 
 
272 aa  498  1e-140  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.722196 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3348  hypothetical protein  91.18 
 
 
272 aa  498  1e-140  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2248  hypothetical protein  90.81 
 
 
272 aa  499  1e-140  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3441  hypothetical protein  80.44 
 
 
272 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3134  hypothetical protein  72.39 
 
 
273 aa  434  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.112064  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1042  protein of unknown function DUF932  73.43 
 
 
273 aa  435  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.995076  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0931  protein of unknown function DUF932  72.76 
 
 
273 aa  420  1e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3354  protein of unknown function DUF932  73.8 
 
 
273 aa  418  1e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2883  hypothetical protein  71.48 
 
 
273 aa  404  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0754  hypothetical protein  67.41 
 
 
273 aa  388  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0045  hypothetical protein  63.06 
 
 
273 aa  365  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0034  hypothetical protein  62.22 
 
 
273 aa  362  3e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4279  hypothetical protein  55.13 
 
 
273 aa  317  2e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219978  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2944  hypothetical protein  52.59 
 
 
275 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.410202  normal  0.63653 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2835  protein of unknown function DUF932  52.59 
 
 
275 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.254935  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2611  protein of unknown function DUF932  53.36 
 
 
274 aa  302  4.0000000000000003e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.30719  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0664  protein of unknown function DUF932  52.22 
 
 
275 aa  302  5.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.865139 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3741  hypothetical protein  52.4 
 
 
276 aa  301  6.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3034  hypothetical protein  52.59 
 
 
275 aa  301  7.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.195535 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2734  hypothetical protein  52.59 
 
 
275 aa  301  7.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1973  hypothetical protein  52.79 
 
 
274 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0679  hypothetical protein  53.16 
 
 
274 aa  301  1e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1477  hypothetical protein  52.03 
 
 
276 aa  301  1e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0468  hypothetical protein  53.36 
 
 
274 aa  300  2e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2321  hypothetical protein  52.59 
 
 
275 aa  299  3e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.555725  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2618  homologue to gene 32 protein of F plasmid  52.4 
 
 
276 aa  298  7e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3535  protein of unknown function DUF932  52.03 
 
 
276 aa  297  1e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2321  hypothetical protein  51.85 
 
 
275 aa  296  2e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000877089  hitchhiker  0.0000215746 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31200  hypothetical protein  54.28 
 
 
274 aa  295  5e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000120267  unclonable  1.6824e-22 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2041  hypothetical protein  50.93 
 
 
273 aa  294  1e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00582058  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0478  hypothetical protein  50.37 
 
 
277 aa  293  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.724029  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1869  protein of unknown function DUF932  53.9 
 
 
274 aa  293  2e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2571  putative F plasmid gene 32-like protein  50.74 
 
 
277 aa  293  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6929  hypothetical protein  51.48 
 
 
275 aa  291  6e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.247635  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0025  hypothetical protein  53.14 
 
 
278 aa  291  6e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000725071  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1782  putative F plasmid gene 32-like protein  50.37 
 
 
277 aa  291  6e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0030  hypothetical protein  52.38 
 
 
278 aa  289  3e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0366118  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1244  hypothetical protein  53.16 
 
 
274 aa  289  4e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0562318 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4158  hypothetical protein  52.59 
 
 
275 aa  288  6e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0629718 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4210  hypothetical protein  52.79 
 
 
274 aa  288  6e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.0000000592317  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2639  hypothetical protein  52.79 
 
 
274 aa  287  1e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.562022  normal  0.0586282 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1276  protein of unknown function DUF932  53.16 
 
 
274 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4995  protein of unknown function DUF932  52.85 
 
 
275 aa  279  3e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0426401  normal  0.148352 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4156  hypothetical protein  50.37 
 
 
275 aa  276  4e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418419  normal  0.860751 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5400  protein of unknown function DUF932  51.71 
 
 
275 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0781  hypothetical protein  48.19 
 
 
295 aa  271  1e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000001098 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1665  putative F plasmid protein  47.1 
 
 
287 aa  270  2e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0729576  normal  0.601822 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7557  hypothetical protein  51.49 
 
 
274 aa  262  4e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0368604 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7306  hypothetical protein  45.56 
 
 
312 aa  244  9e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481789  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3899  hypothetical protein  45.22 
 
 
287 aa  241  9e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3678  hypothetical protein  44.81 
 
 
281 aa  235  5.0000000000000005e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4386  hypothetical protein  43.56 
 
 
316 aa  223  4e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00134743  normal  0.817249 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0001  hypothetical protein  41.63 
 
 
266 aa  219  3e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000235069  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6201  protein of unknown function DUF932  41.37 
 
 
295 aa  214  9e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.571939  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0246  protein of unknown function DUF932  46.15 
 
 
196 aa  168  9e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6482  protein of unknown function DUF932  44.97 
 
 
196 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109206  normal 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7328  protein of unknown function DUF932  44.71 
 
 
197 aa  165  8e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.792728  hitchhiker  0.00281621 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6477  protein of unknown function DUF932  56.1 
 
 
123 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0251  protein of unknown function DUF932  52.03 
 
 
123 aa  136  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7323  protein of unknown function DUF932  50 
 
 
124 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000418502  hitchhiker  0.000715809 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4460  hypothetical protein  31.73 
 
 
288 aa  122  6e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.629717  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1214  hypothetical protein  29.21 
 
 
281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.839406 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4368  hypothetical protein  29.77 
 
 
283 aa  109  6e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>