72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1214 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1214  hypothetical protein  100 
 
 		 281 aa  563  1.0000000000000001e-159  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.839406 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4368  hypothetical protein  67.14 
 
 		 283 aa  379  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4460  hypothetical protein  67.64 
 
 		 288 aa  373  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.629717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0001  hypothetical protein  39.25 
 
 		 266 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000235069  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3899  hypothetical protein  36.94 
 
 		 287 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4386  hypothetical protein  36.19 
 
 		 316 aa  149  7e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00134743  normal  0.817249 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5400  protein of unknown function DUF932  37.45 
 
 		 275 aa  148  9e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1973  hypothetical protein  35.36 
 
 		 274 aa  148  9e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4995  protein of unknown function DUF932  37.45 
 
 		 275 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0426401  normal  0.148352 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2321  hypothetical protein  35.5 
 
 		 275 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.555725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0679  hypothetical protein  35.36 
 
 		 274 aa  145  8.000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1869  protein of unknown function DUF932  36.02 
 
 		 274 aa  145  9e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2041  hypothetical protein  33.46 
 
 		 273 aa  144  1e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00582058  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1244  hypothetical protein  36.02 
 
 		 274 aa  144  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0562318 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31200  hypothetical protein  35.63 
 
 		 274 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000120267  unclonable  1.6824e-22 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2835  protein of unknown function DUF932  35.09 
 
 		 275 aa  144  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.254935  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4210  hypothetical protein  36.7 
 
 		 274 aa  142  5e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.0000000592317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2639  hypothetical protein  35.36 
 
 		 274 aa  142  8e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.562022  normal  0.0586282 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1276  protein of unknown function DUF932  35.63 
 
 		 274 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4279  hypothetical protein  30.74 
 
 		 273 aa  141  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0045  hypothetical protein  30.34 
 
 		 273 aa  140  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0664  protein of unknown function DUF932  34.22 
 
 		 275 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.865139 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1477  hypothetical protein  33.33 
 
 		 276 aa  139  7e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0478  hypothetical protein  33.94 
 
 		 277 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.724029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0034  hypothetical protein  31.84 
 
 		 273 aa  138  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6201  protein of unknown function DUF932  33.59 
 
 		 295 aa  138  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.571939  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2321  hypothetical protein  33.84 
 
 		 275 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000877089  hitchhiker  0.0000215746 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2944  hypothetical protein  33.59 
 
 		 275 aa  136  4e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.410202  normal  0.63653 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3741  hypothetical protein  32.95 
 
 		 276 aa  135  9e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6929  hypothetical protein  31.84 
 
 		 275 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.247635  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0468  hypothetical protein  33.59 
 
 		 274 aa  135  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2611  protein of unknown function DUF932  34.35 
 
 		 274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.30719  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2618  homologue to gene 32 protein of F plasmid  32.95 
 
 		 276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4158  hypothetical protein  34.85 
 
 		 275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0629718 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3535  protein of unknown function DUF932  32.57 
 
 		 276 aa  133  3e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7306  hypothetical protein  33.33 
 
 		 312 aa  132  7.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1782  putative F plasmid gene 32-like protein  32.85 
 
 		 277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2734  hypothetical protein  33.97 
 
 		 275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0025  hypothetical protein  33.45 
 
 		 278 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000725071  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3034  hypothetical protein  33.97 
 
 		 275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.195535 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0030  hypothetical protein  33.45 
 
 		 278 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0366118  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2571  putative F plasmid gene 32-like protein  32.13 
 
 		 277 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3134  hypothetical protein  30.45 
 
 		 273 aa  126  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.112064  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3678  hypothetical protein  32.34 
 
 		 281 aa  125  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4156  hypothetical protein  34.96 
 
 		 275 aa  124  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418419  normal  0.860751 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0781  hypothetical protein  34.08 
 
 		 295 aa  123  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000001098 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1665  putative F plasmid protein  34.07 
 
 		 287 aa  123  4e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0729576  normal  0.601822 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3441  hypothetical protein  30.6 
 
 		 272 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1042  protein of unknown function DUF932  30.68 
 
 		 273 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.995076  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2883  hypothetical protein  32.58 
 
 		 273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7557  hypothetical protein  35.04 
 
 		 274 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0368604 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3354  protein of unknown function DUF932  31.44 
 
 		 273 aa  119  6e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0931  protein of unknown function DUF932  30.83 
 
 		 273 aa  119  6e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4894  hypothetical protein  30.45 
 
 		 272 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1064  hypothetical protein  30.83 
 
 		 273 aa  115  5e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0274991 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1123  hypothetical protein  30.45 
 
 		 315 aa  115  6e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3348  hypothetical protein  30.83 
 
 		 272 aa  115  6e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2248  hypothetical protein  29.43 
 
 		 272 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4802  hypothetical protein  29.7 
 
 		 272 aa  113  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.722196 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2853  hypothetical protein  30.08 
 
 		 273 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0666809 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3207  hypothetical protein  29.7 
 
 		 272 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0754  hypothetical protein  28.47 
 
 		 273 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3408  hypothetical protein  29.32 
 
 		 272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4682  hypothetical protein  29.59 
 
 		 272 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1400  hypothetical protein  29.21 
 
 		 272 aa  108  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.188272 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6482  protein of unknown function DUF932  33.73 
 
 		 196 aa  89  9e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0246  protein of unknown function DUF932  31.36 
 
 		 196 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7328  protein of unknown function DUF932  28.99 
 
 		 197 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.792728  hitchhiker  0.00281621 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6477  protein of unknown function DUF932  37.89 
 
 		 123 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0251  protein of unknown function DUF932  37.89 
 
 		 123 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7323  protein of unknown function DUF932  35.79 
 
 		 124 aa  57  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000418502  hitchhiker  0.000715809 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0283  hypothetical protein  29.2 
 
 		 318 aa  45.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>