71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7306 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7306  hypothetical protein  100 
 
 		 312 aa  641    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3678  hypothetical protein  80.22 
 
 		 281 aa  459  9.999999999999999e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0045  hypothetical protein  49.28 
 
 		 273 aa  272  5.000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0034  hypothetical protein  49.64 
 
 		 273 aa  271  9e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3134  hypothetical protein  48 
 
 		 273 aa  260  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.112064  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0781  hypothetical protein  46.48 
 
 		 295 aa  258  1e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000001098 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0931  protein of unknown function DUF932  48.52 
 
 		 273 aa  256  4e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1042  protein of unknown function DUF932  48.52 
 
 		 273 aa  255  7e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.995076  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1665  putative F plasmid protein  45.42 
 
 		 287 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0729576  normal  0.601822 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3441  hypothetical protein  48.16 
 
 		 272 aa  252  6e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0030  hypothetical protein  48.13 
 
 		 278 aa  252  7e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0366118  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1123  hypothetical protein  44.12 
 
 		 315 aa  251  9.000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2853  hypothetical protein  47.78 
 
 		 273 aa  251  1e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0666809 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2321  hypothetical protein  45.68 
 
 		 275 aa  251  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.555725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0468  hypothetical protein  46.57 
 
 		 274 aa  251  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1782  putative F plasmid gene 32-like protein  45.36 
 
 		 277 aa  251  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1064  hypothetical protein  48.15 
 
 		 273 aa  250  2e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0274991 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2944  hypothetical protein  46.04 
 
 		 275 aa  250  3e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.410202  normal  0.63653 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0025  hypothetical protein  47.21 
 
 		 278 aa  249  4e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000725071  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2571  putative F plasmid gene 32-like protein  45.36 
 
 		 277 aa  247  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1477  hypothetical protein  44.44 
 
 		 276 aa  246  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3741  hypothetical protein  44.09 
 
 		 276 aa  246  4e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2611  protein of unknown function DUF932  45.85 
 
 		 274 aa  246  4e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.30719  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2618  homologue to gene 32 protein of F plasmid  44.09 
 
 		 276 aa  246  4e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2835  protein of unknown function DUF932  45.49 
 
 		 275 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.254935  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3354  protein of unknown function DUF932  48.89 
 
 		 273 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3348  hypothetical protein  47.04 
 
 		 272 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3535  protein of unknown function DUF932  44.09 
 
 		 276 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2734  hypothetical protein  45.32 
 
 		 275 aa  243  3e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3034  hypothetical protein  45.32 
 
 		 275 aa  243  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.195535 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4386  hypothetical protein  44.7 
 
 		 316 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00134743  normal  0.817249 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0664  protein of unknown function DUF932  45.13 
 
 		 275 aa  242  5e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.865139 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4802  hypothetical protein  47.04 
 
 		 272 aa  241  1e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.722196 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3408  hypothetical protein  47.04 
 
 		 272 aa  241  2e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6929  hypothetical protein  43.68 
 
 		 275 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.247635  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2321  hypothetical protein  44.04 
 
 		 275 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000877089  hitchhiker  0.0000215746 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4682  hypothetical protein  46.3 
 
 		 272 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3207  hypothetical protein  46.67 
 
 		 272 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4894  hypothetical protein  46.3 
 
 		 272 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0679  hypothetical protein  44.77 
 
 		 274 aa  239  5e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2248  hypothetical protein  46.3 
 
 		 272 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1973  hypothetical protein  43.68 
 
 		 274 aa  238  8e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31200  hypothetical protein  45.85 
 
 		 274 aa  238  9e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000120267  unclonable  1.6824e-22 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4279  hypothetical protein  42.91 
 
 		 273 aa  238  9e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1869  protein of unknown function DUF932  45.85 
 
 		 274 aa  238  1e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1244  hypothetical protein  45.49 
 
 		 274 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0562318 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3899  hypothetical protein  44.25 
 
 		 287 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4210  hypothetical protein  45.49 
 
 		 274 aa  235  7e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.0000000592317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4158  hypothetical protein  44.4 
 
 		 275 aa  235  8e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0629718 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1400  hypothetical protein  45.56 
 
 		 272 aa  235  9e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.188272 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1276  protein of unknown function DUF932  45.49 
 
 		 274 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2883  hypothetical protein  46.67 
 
 		 273 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2639  hypothetical protein  45.13 
 
 		 274 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.562022  normal  0.0586282 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0478  hypothetical protein  42.86 
 
 		 277 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.724029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2041  hypothetical protein  45.56 
 
 		 273 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00582058  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4156  hypothetical protein  45.85 
 
 		 275 aa  229  3e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418419  normal  0.860751 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0754  hypothetical protein  44.36 
 
 		 273 aa  229  4e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4995  protein of unknown function DUF932  43.43 
 
 		 275 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0426401  normal  0.148352 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5400  protein of unknown function DUF932  43.43 
 
 		 275 aa  219  7e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7557  hypothetical protein  44 
 
 		 274 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0368604 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6201  protein of unknown function DUF932  42.76 
 
 		 295 aa  217  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.571939  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0001  hypothetical protein  40 
 
 		 266 aa  202  4e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000235069  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6482  protein of unknown function DUF932  46.63 
 
 		 196 aa  171  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0246  protein of unknown function DUF932  45.08 
 
 		 196 aa  162  9e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7328  protein of unknown function DUF932  43.3 
 
 		 197 aa  152  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.792728  hitchhiker  0.00281621 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4368  hypothetical protein  34.35 
 
 		 283 aa  136  4e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4460  hypothetical protein  35.4 
 
 		 288 aa  135  8e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.629717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1214  hypothetical protein  33.33 
 
 		 281 aa  132  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.839406 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6477  protein of unknown function DUF932  38.84 
 
 		 123 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7323  protein of unknown function DUF932  36.89 
 
 		 124 aa  92.8  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000418502  hitchhiker  0.000715809 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0251  protein of unknown function DUF932  34.43 
 
 		 123 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>