71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_3408 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_3408  hypothetical protein  100 
 
 		 272 aa  566  1e-160  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4802  hypothetical protein  96.32 
 
 		 272 aa  527  1e-149  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.722196 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2248  hypothetical protein  95.22 
 
 		 272 aa  522  1e-147  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3348  hypothetical protein  94.49 
 
 		 272 aa  518  1e-146  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4894  hypothetical protein  94.49 
 
 		 272 aa  520  1e-146  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1064  hypothetical protein  94.14 
 
 		 273 aa  514  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0274991 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1123  hypothetical protein  94.1 
 
 		 315 aa  513  1e-144  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2853  hypothetical protein  93.77 
 
 		 273 aa  512  1e-144  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0666809 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3207  hypothetical protein  93.38 
 
 		 272 aa  512  1e-144  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1400  hypothetical protein  91.54 
 
 		 272 aa  500  1e-141  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.188272 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4682  hypothetical protein  90.07 
 
 		 272 aa  495  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3441  hypothetical protein  75.65 
 
 		 272 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1042  protein of unknown function DUF932  73.8 
 
 		 273 aa  432  1e-120  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.995076  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3134  hypothetical protein  72.01 
 
 		 273 aa  429  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.112064  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3354  protein of unknown function DUF932  74.54 
 
 		 273 aa  418  1e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0931  protein of unknown function DUF932  72.39 
 
 		 273 aa  413  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2883  hypothetical protein  70.74 
 
 		 273 aa  395  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0754  hypothetical protein  66.3 
 
 		 273 aa  378  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0045  hypothetical protein  62.69 
 
 		 273 aa  361  7.0000000000000005e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0034  hypothetical protein  62.22 
 
 		 273 aa  359  3e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2835  protein of unknown function DUF932  54.07 
 
 		 275 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.254935  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1973  hypothetical protein  53.9 
 
 		 274 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0664  protein of unknown function DUF932  52.96 
 
 		 275 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.865139 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4279  hypothetical protein  52.47 
 
 		 273 aa  303  2.0000000000000002e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2944  hypothetical protein  52.59 
 
 		 275 aa  301  7.000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.410202  normal  0.63653 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3741  hypothetical protein  52.77 
 
 		 276 aa  300  1e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0679  hypothetical protein  53.53 
 
 		 274 aa  300  2e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1477  hypothetical protein  52.03 
 
 		 276 aa  299  4e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3034  hypothetical protein  52.59 
 
 		 275 aa  299  4e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.195535 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2734  hypothetical protein  52.59 
 
 		 275 aa  299  4e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2611  protein of unknown function DUF932  52.99 
 
 		 274 aa  298  5e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.30719  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2618  homologue to gene 32 protein of F plasmid  52.77 
 
 		 276 aa  297  1e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0468  hypothetical protein  52.99 
 
 		 274 aa  296  2e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3535  protein of unknown function DUF932  52.4 
 
 		 276 aa  296  2e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2321  hypothetical protein  52.59 
 
 		 275 aa  296  3e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.555725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1782  putative F plasmid gene 32-like protein  51.47 
 
 		 277 aa  296  4e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2041  hypothetical protein  51.67 
 
 		 273 aa  293  2e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00582058  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2321  hypothetical protein  51.11 
 
 		 275 aa  292  4e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000877089  hitchhiker  0.0000215746 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31200  hypothetical protein  53.9 
 
 		 274 aa  290  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000120267  unclonable  1.6824e-22 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0025  hypothetical protein  52.4 
 
 		 278 aa  290  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000725071  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6929  hypothetical protein  51.48 
 
 		 275 aa  289  3e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.247635  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0478  hypothetical protein  51.1 
 
 		 277 aa  289  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.724029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2571  putative F plasmid gene 32-like protein  50.37 
 
 		 277 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1869  protein of unknown function DUF932  53.53 
 
 		 274 aa  288  6e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0030  hypothetical protein  51.65 
 
 		 278 aa  288  9e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0366118  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1244  hypothetical protein  53.16 
 
 		 274 aa  286  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0562318 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2639  hypothetical protein  53.16 
 
 		 274 aa  287  2e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.562022  normal  0.0586282 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4158  hypothetical protein  51.48 
 
 		 275 aa  283  2.0000000000000002e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0629718 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4210  hypothetical protein  52.79 
 
 		 274 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.0000000592317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1276  protein of unknown function DUF932  53.16 
 
 		 274 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4156  hypothetical protein  51.48 
 
 		 275 aa  279  4e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418419  normal  0.860751 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0781  hypothetical protein  49.28 
 
 		 295 aa  276  3e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000001098 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4995  protein of unknown function DUF932  51.15 
 
 		 275 aa  272  5.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0426401  normal  0.148352 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7557  hypothetical protein  52.43 
 
 		 274 aa  267  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0368604 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5400  protein of unknown function DUF932  50.57 
 
 		 275 aa  266  4e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1665  putative F plasmid protein  46.74 
 
 		 287 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0729576  normal  0.601822 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7306  hypothetical protein  47.04 
 
 		 312 aa  251  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3899  hypothetical protein  46.69 
 
 		 287 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3678  hypothetical protein  45.56 
 
 		 281 aa  238  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0001  hypothetical protein  42.8 
 
 		 266 aa  226  4e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000235069  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4386  hypothetical protein  45.28 
 
 		 316 aa  225  6e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00134743  normal  0.817249 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6201  protein of unknown function DUF932  42.14 
 
 		 295 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.571939  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0246  protein of unknown function DUF932  47.93 
 
 		 196 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6482  protein of unknown function DUF932  47.34 
 
 		 196 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7328  protein of unknown function DUF932  44.12 
 
 		 197 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.792728  hitchhiker  0.00281621 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6477  protein of unknown function DUF932  53.66 
 
 		 123 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0251  protein of unknown function DUF932  51.22 
 
 		 123 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4460  hypothetical protein  32.1 
 
 		 288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.629717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7323  protein of unknown function DUF932  49.19 
 
 		 124 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000418502  hitchhiker  0.000715809 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1214  hypothetical protein  29.32 
 
 		 281 aa  117  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.839406 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4368  hypothetical protein  30.53 
 
 		 283 aa  112  5e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>