71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1276 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1276  protein of unknown function DUF932  100 
 
 		 274 aa  566  1e-160  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1244  hypothetical protein  98.54 
 
 		 274 aa  556  1e-157  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0562318 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1869  protein of unknown function DUF932  96.72 
 
 		 274 aa  528  1e-149  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0679  hypothetical protein  93.43 
 
 		 274 aa  529  1e-149  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31200  hypothetical protein  97.08 
 
 		 274 aa  529  1e-149  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000120267  unclonable  1.6824e-22 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2639  hypothetical protein  96.72 
 
 		 274 aa  523  1e-147  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.562022  normal  0.0586282 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1973  hypothetical protein  92.34 
 
 		 274 aa  522  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2321  hypothetical protein  88 
 
 		 275 aa  500  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.555725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1477  hypothetical protein  86.96 
 
 		 276 aa  494  1e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3741  hypothetical protein  85.51 
 
 		 276 aa  488  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2618  homologue to gene 32 protein of F plasmid  84.78 
 
 		 276 aa  485  1e-136  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3535  protein of unknown function DUF932  84.42 
 
 		 276 aa  482  1e-135  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0468  hypothetical protein  84.98 
 
 		 274 aa  481  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2944  hypothetical protein  85.45 
 
 		 275 aa  481  1e-135  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.410202  normal  0.63653 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3034  hypothetical protein  84.73 
 
 		 275 aa  479  1e-134  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.195535 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2734  hypothetical protein  84.73 
 
 		 275 aa  479  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0664  protein of unknown function DUF932  83.64 
 
 		 275 aa  476  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.865139 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2611  protein of unknown function DUF932  83.52 
 
 		 274 aa  473  1e-132  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.30719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2835  protein of unknown function DUF932  81.09 
 
 		 275 aa  464  9.999999999999999e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.254935  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2321  hypothetical protein  77.45 
 
 		 275 aa  442  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000877089  hitchhiker  0.0000215746 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4158  hypothetical protein  78.55 
 
 		 275 aa  437  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0629718 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4156  hypothetical protein  73.82 
 
 		 275 aa  410  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418419  normal  0.860751 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1782  putative F plasmid gene 32-like protein  66.06 
 
 		 277 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4210  hypothetical protein  69.09 
 
 		 274 aa  378  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.0000000592317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2571  putative F plasmid gene 32-like protein  64.26 
 
 		 277 aa  377  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0478  hypothetical protein  63.18 
 
 		 277 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.724029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6929  hypothetical protein  63.64 
 
 		 275 aa  368  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.247635  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2041  hypothetical protein  61.45 
 
 		 273 aa  347  1e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00582058  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7557  hypothetical protein  65.07 
 
 		 274 aa  343  2e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0368604 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0034  hypothetical protein  52.92 
 
 		 273 aa  326  3e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0045  hypothetical protein  52.55 
 
 		 273 aa  324  1e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0025  hypothetical protein  60 
 
 		 278 aa  321  6e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000725071  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0781  hypothetical protein  57.65 
 
 		 295 aa  321  9.000000000000001e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000001098 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3441  hypothetical protein  56.83 
 
 		 272 aa  320  9.999999999999999e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4995  protein of unknown function DUF932  60.75 
 
 		 275 aa  319  3e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0426401  normal  0.148352 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1665  putative F plasmid protein  55.87 
 
 		 287 aa  318  7e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0729576  normal  0.601822 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0030  hypothetical protein  59.34 
 
 		 278 aa  317  9e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0366118  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5400  protein of unknown function DUF932  60.75 
 
 		 275 aa  317  2e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1042  protein of unknown function DUF932  57.46 
 
 		 273 aa  315  6e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.995076  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0931  protein of unknown function DUF932  55.93 
 
 		 273 aa  309  2.9999999999999997e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3134  hypothetical protein  53.68 
 
 		 273 aa  308  6.999999999999999e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.112064  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3354  protein of unknown function DUF932  57.46 
 
 		 273 aa  305  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0754  hypothetical protein  54.98 
 
 		 273 aa  304  9.000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2853  hypothetical protein  54.28 
 
 		 273 aa  294  8e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0666809 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1064  hypothetical protein  54.28 
 
 		 273 aa  292  5e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0274991 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1123  hypothetical protein  54.31 
 
 		 315 aa  291  5e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4802  hypothetical protein  54.65 
 
 		 272 aa  291  6e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.722196 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2883  hypothetical protein  52.79 
 
 		 273 aa  290  1e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3207  hypothetical protein  53.9 
 
 		 272 aa  290  3e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4279  hypothetical protein  50.18 
 
 		 273 aa  289  3e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4894  hypothetical protein  53.9 
 
 		 272 aa  289  4e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2248  hypothetical protein  53.9 
 
 		 272 aa  287  1e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4682  hypothetical protein  53.53 
 
 		 272 aa  287  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1400  hypothetical protein  53.16 
 
 		 272 aa  287  2e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.188272 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3348  hypothetical protein  53.9 
 
 		 272 aa  286  2e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3408  hypothetical protein  53.16 
 
 		 272 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3899  hypothetical protein  50 
 
 		 287 aa  261  6.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7306  hypothetical protein  45.49 
 
 		 312 aa  242  5e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4386  hypothetical protein  47.35 
 
 		 316 aa  240  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00134743  normal  0.817249 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3678  hypothetical protein  43.68 
 
 		 281 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6482  protein of unknown function DUF932  62.07 
 
 		 196 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6201  protein of unknown function DUF932  43.77 
 
 		 295 aa  229  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.571939  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0246  protein of unknown function DUF932  57.47 
 
 		 196 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0001  hypothetical protein  40.54 
 
 		 266 aa  210  2e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000235069  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7328  protein of unknown function DUF932  54.34 
 
 		 197 aa  205  8e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.792728  hitchhiker  0.00281621 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6477  protein of unknown function DUF932  69.92 
 
 		 123 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0251  protein of unknown function DUF932  64.23 
 
 		 123 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4460  hypothetical protein  38.27 
 
 		 288 aa  158  7e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.629717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4368  hypothetical protein  37.55 
 
 		 283 aa  154  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7323  protein of unknown function DUF932  60.48 
 
 		 124 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000418502  hitchhiker  0.000715809 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1214  hypothetical protein  35.63 
 
 		 281 aa  146  4.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.839406 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>