71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2734 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_3034  hypothetical protein  100 
 
 		 275 aa  570  1e-161  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.195535 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2734  hypothetical protein  100 
 
 		 275 aa  570  1e-161  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2944  hypothetical protein  90.91 
 
 		 275 aa  524  1e-148  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.410202  normal  0.63653 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0468  hypothetical protein  89.38 
 
 		 274 aa  511  1e-144  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2611  protein of unknown function DUF932  89.01 
 
 		 274 aa  511  1e-144  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.30719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1477  hypothetical protein  87.36 
 
 		 276 aa  505  9.999999999999999e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3741  hypothetical protein  85.92 
 
 		 276 aa  499  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3535  protein of unknown function DUF932  85.92 
 
 		 276 aa  497  1e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2321  hypothetical protein  85.45 
 
 		 275 aa  494  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.555725  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2618  homologue to gene 32 protein of F plasmid  84.12 
 
 		 276 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0679  hypothetical protein  84 
 
 		 274 aa  478  1e-134  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1973  hypothetical protein  83.27 
 
 		 274 aa  475  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1869  protein of unknown function DUF932  85.09 
 
 		 274 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1244  hypothetical protein  85.09 
 
 		 274 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0562318 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31200  hypothetical protein  84.73 
 
 		 274 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000120267  unclonable  1.6824e-22 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1276  protein of unknown function DUF932  84.73 
 
 		 274 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0664  protein of unknown function DUF932  80 
 
 		 275 aa  464  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.865139 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2835  protein of unknown function DUF932  78.55 
 
 		 275 aa  460  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.254935  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2639  hypothetical protein  83.64 
 
 		 274 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.562022  normal  0.0586282 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2321  hypothetical protein  75.64 
 
 		 275 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000877089  hitchhiker  0.0000215746 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4158  hypothetical protein  76.73 
 
 		 275 aa  437  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0629718 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4156  hypothetical protein  74.91 
 
 		 275 aa  429  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418419  normal  0.860751 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1782  putative F plasmid gene 32-like protein  67.87 
 
 		 277 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4210  hypothetical protein  70.55 
 
 		 274 aa  392  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.0000000592317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0478  hypothetical protein  64.98 
 
 		 277 aa  389  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.724029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2571  putative F plasmid gene 32-like protein  65.34 
 
 		 277 aa  389  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6929  hypothetical protein  64 
 
 		 275 aa  384  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.247635  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2041  hypothetical protein  62.18 
 
 		 273 aa  364  1e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00582058  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7557  hypothetical protein  67.4 
 
 		 274 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0368604 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4995  protein of unknown function DUF932  61.19 
 
 		 275 aa  342  4e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0426401  normal  0.148352 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0034  hypothetical protein  54.55 
 
 		 273 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5400  protein of unknown function DUF932  60.07 
 
 		 275 aa  335  7e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0045  hypothetical protein  54.18 
 
 		 273 aa  333  2e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0025  hypothetical protein  59.85 
 
 		 278 aa  332  3e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000725071  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0030  hypothetical protein  60.29 
 
 		 278 aa  332  4e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0366118  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3441  hypothetical protein  56.09 
 
 		 272 aa  326  3e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0781  hypothetical protein  56.94 
 
 		 295 aa  325  4.0000000000000003e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000001098 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1665  putative F plasmid protein  56.94 
 
 		 287 aa  322  3e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0729576  normal  0.601822 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1042  protein of unknown function DUF932  57.25 
 
 		 273 aa  323  3e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.995076  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3134  hypothetical protein  54.48 
 
 		 273 aa  316  2e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.112064  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0931  protein of unknown function DUF932  55.39 
 
 		 273 aa  315  5e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3354  protein of unknown function DUF932  56.88 
 
 		 273 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0754  hypothetical protein  54.41 
 
 		 273 aa  306  2.0000000000000002e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2883  hypothetical protein  54.41 
 
 		 273 aa  301  6.000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2853  hypothetical protein  54.44 
 
 		 273 aa  299  4e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0666809 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3207  hypothetical protein  54.44 
 
 		 272 aa  297  1e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1123  hypothetical protein  54.48 
 
 		 315 aa  297  1e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1064  hypothetical protein  54.44 
 
 		 273 aa  297  1e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0274991 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4802  hypothetical protein  54.07 
 
 		 272 aa  296  3e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.722196 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4682  hypothetical protein  53.33 
 
 		 272 aa  294  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4894  hypothetical protein  53.33 
 
 		 272 aa  293  2e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2248  hypothetical protein  53.33 
 
 		 272 aa  292  3e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3348  hypothetical protein  53.7 
 
 		 272 aa  293  3e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1400  hypothetical protein  52.59 
 
 		 272 aa  291  1e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.188272 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3408  hypothetical protein  52.59 
 
 		 272 aa  288  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4279  hypothetical protein  49.09 
 
 		 273 aa  288  6e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3899  hypothetical protein  49.25 
 
 		 287 aa  254  9e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7306  hypothetical protein  45.49 
 
 		 312 aa  243  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3678  hypothetical protein  43.88 
 
 		 281 aa  241  1e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6482  protein of unknown function DUF932  62.64 
 
 		 196 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6201  protein of unknown function DUF932  45.23 
 
 		 295 aa  238  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.571939  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4386  hypothetical protein  46.97 
 
 		 316 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00134743  normal  0.817249 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0246  protein of unknown function DUF932  60.34 
 
 		 196 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7328  protein of unknown function DUF932  56.32 
 
 		 197 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.792728  hitchhiker  0.00281621 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0001  hypothetical protein  39.62 
 
 		 266 aa  202  4e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000235069  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6477  protein of unknown function DUF932  69.92 
 
 		 123 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0251  protein of unknown function DUF932  64.23 
 
 		 123 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7323  protein of unknown function DUF932  61.29 
 
 		 124 aa  158  9e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000418502  hitchhiker  0.000715809 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4460  hypothetical protein  38.21 
 
 		 288 aa  149  6e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.629717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4368  hypothetical protein  37.02 
 
 		 283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1214  hypothetical protein  33.97 
 
 		 281 aa  131  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.839406 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>