29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2980 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2980  hypothetical protein  100 
 
 
357 aa  744    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2365  phage/plasmid-related protein  61.62 
 
 
350 aa  461  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0949  phage/plasmid-related protein  61.06 
 
 
350 aa  456  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0643661 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5537  hypothetical protein  31.4 
 
 
344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.196835  hitchhiker  0.0000686352 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9010  phage/plasmid-related protein  30 
 
 
329 aa  133  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.188276  normal  0.106896 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0312  phage/plasmid-related protein  29.43 
 
 
334 aa  124  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281243  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2258  hypothetical protein  30.86 
 
 
334 aa  122  8e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.369604  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3609  phage/plasmid-related protein TIGR03299  30.72 
 
 
395 aa  122  9e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00236551  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4304  hypothetical protein  30.34 
 
 
304 aa  112  9e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.126034  normal  0.2404 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1581  hypothetical protein  33.53 
 
 
334 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2496  hypothetical protein  29.02 
 
 
342 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3686  hypothetical protein  27.54 
 
 
312 aa  103  7e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4742  hypothetical protein  28.84 
 
 
322 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0601  phage/plasmid-related protein  26.23 
 
 
342 aa  97.4  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1184  hypothetical protein  27.95 
 
 
322 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.818215  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3683  hypothetical protein  25.38 
 
 
322 aa  93.2  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.121531  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2725  hypothetical protein  25.46 
 
 
322 aa  90.1  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.412186  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1656  hypothetical protein  25.54 
 
 
318 aa  89.7  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.860571  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3551  hypothetical protein  26.92 
 
 
325 aa  89.4  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0111  hypothetical protein  25.66 
 
 
322 aa  85.9  9e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0205  hypothetical protein  26.07 
 
 
322 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3659  hypothetical protein  25.38 
 
 
321 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6227  hypothetical protein  24.69 
 
 
324 aa  84.7  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0256712  normal  0.704554 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2355  hypothetical protein  26.28 
 
 
330 aa  78.6  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.78764  normal  0.0271791 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2449  hypothetical protein  27.67 
 
 
329 aa  77.4  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2577  hypothetical protein  23.12 
 
 
335 aa  69.7  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1621  hypothetical protein  24.92 
 
 
330 aa  68.6  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0243174 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1721  hypothetical protein  21.1 
 
 
335 aa  63.9  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.117642 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3270  hypothetical protein  21.82 
 
 
356 aa  50.1  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.336359  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>