29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2365 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2365  phage/plasmid-related protein  100 
 
 		 350 aa  729    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0949  phage/plasmid-related protein  80.86 
 
 		 350 aa  601  1.0000000000000001e-171  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0643661 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2980  hypothetical protein  61.62 
 
 		 357 aa  461  1e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5537  hypothetical protein  33.06 
 
 		 344 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.196835  hitchhiker  0.0000686352 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3609  phage/plasmid-related protein TIGR03299  29.9 
 
 		 395 aa  137  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00236551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9010  phage/plasmid-related protein  28.41 
 
 		 329 aa  137  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.188276  normal  0.106896 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0312  phage/plasmid-related protein  30.96 
 
 		 334 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281243  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2258  hypothetical protein  29.73 
 
 		 334 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.369604  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1656  hypothetical protein  26.61 
 
 		 318 aa  115  8.999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.860571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1581  hypothetical protein  30.23 
 
 		 334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4304  hypothetical protein  30 
 
 		 304 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.126034  normal  0.2404 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3686  hypothetical protein  28.53 
 
 		 312 aa  110  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3659  hypothetical protein  26.23 
 
 		 321 aa  110  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3683  hypothetical protein  26.2 
 
 		 322 aa  109  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.121531  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0205  hypothetical protein  27.8 
 
 		 322 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2725  hypothetical protein  26.54 
 
 		 322 aa  107  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.412186  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2496  hypothetical protein  28.75 
 
 		 342 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0111  hypothetical protein  26.21 
 
 		 322 aa  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1184  hypothetical protein  26.58 
 
 		 322 aa  100  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.818215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4742  hypothetical protein  27.01 
 
 		 322 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0601  phage/plasmid-related protein  25.08 
 
 		 342 aa  96.3  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6227  hypothetical protein  25.23 
 
 		 324 aa  95.5  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0256712  normal  0.704554 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3551  hypothetical protein  27.16 
 
 		 325 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2355  hypothetical protein  26.38 
 
 		 330 aa  89.4  9e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.78764  normal  0.0271791 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1621  hypothetical protein  25.47 
 
 		 330 aa  87  4e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0243174 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2449  hypothetical protein  26.29 
 
 		 329 aa  78.2  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2577  hypothetical protein  23.14 
 
 		 335 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1721  hypothetical protein  23.72 
 
 		 335 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.117642 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0862  hypothetical protein  28.23 
 
 		 135 aa  47  0.0005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.15888  normal  0.663333 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>