23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0862 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0862  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  283  7e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.15888  normal  0.663333 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2355  hypothetical protein  96.18 
 
 		 330 aa  273  8e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.78764  normal  0.0271791 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1621  hypothetical protein  94.66 
 
 		 330 aa  269  1e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0243174 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3659  hypothetical protein  71.32 
 
 		 321 aa  192  9e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0205  hypothetical protein  68.99 
 
 		 322 aa  189  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2725  hypothetical protein  69.29 
 
 		 322 aa  188  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.412186  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0111  hypothetical protein  67.44 
 
 		 322 aa  187  4e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1184  hypothetical protein  68.7 
 
 		 322 aa  185  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.818215  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2496  hypothetical protein  68.7 
 
 		 342 aa  184  5e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3683  hypothetical protein  65.89 
 
 		 322 aa  181  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.121531  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6227  hypothetical protein  66.67 
 
 		 324 aa  180  7e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0256712  normal  0.704554 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4742  hypothetical protein  67.97 
 
 		 322 aa  179  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0601  phage/plasmid-related protein  65.69 
 
 		 342 aa  177  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2449  hypothetical protein  63.36 
 
 		 329 aa  175  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1656  hypothetical protein  56.25 
 
 		 318 aa  147  7e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.860571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3686  hypothetical protein  52.94 
 
 		 312 aa  127  5.0000000000000004e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4304  hypothetical protein  48.74 
 
 		 304 aa  117  7e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.126034  normal  0.2404 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3609  phage/plasmid-related protein TIGR03299  32.52 
 
 		 395 aa  63.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00236551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3551  hypothetical protein  37.9 
 
 		 325 aa  57.4  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0949  phage/plasmid-related protein  29.41 
 
 		 350 aa  55.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0643661 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1539  hypothetical protein  37.5 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0312  phage/plasmid-related protein  29.77 
 
 		 334 aa  51.2  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281243  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2365  phage/plasmid-related protein  28.23 
 
 		 350 aa  47  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>