31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1656 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1656  hypothetical protein  100 
 
 		 318 aa  657    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.860571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0111  hypothetical protein  60.19 
 
 		 322 aa  383  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6227  hypothetical protein  58.88 
 
 		 324 aa  381  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0256712  normal  0.704554 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1184  hypothetical protein  59.44 
 
 		 322 aa  373  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.818215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2725  hypothetical protein  57.32 
 
 		 322 aa  371  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.412186  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3659  hypothetical protein  57.68 
 
 		 321 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2449  hypothetical protein  56.53 
 
 		 329 aa  365  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2496  hypothetical protein  58.39 
 
 		 342 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0205  hypothetical protein  56.7 
 
 		 322 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3683  hypothetical protein  57.81 
 
 		 322 aa  360  1e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.121531  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4742  hypothetical protein  59.55 
 
 		 322 aa  358  7e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0601  phage/plasmid-related protein  51.03 
 
 		 342 aa  350  2e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2355  hypothetical protein  52.12 
 
 		 330 aa  342  4e-93  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.78764  normal  0.0271791 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1621  hypothetical protein  51.52 
 
 		 330 aa  338  5.9999999999999996e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0243174 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4304  hypothetical protein  49.03 
 
 		 304 aa  293  2e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.126034  normal  0.2404 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3686  hypothetical protein  46.1 
 
 		 312 aa  261  1e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0862  hypothetical protein  56.25 
 
 		 135 aa  147  3e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.15888  normal  0.663333 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2365  phage/plasmid-related protein  26.75 
 
 		 350 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3551  hypothetical protein  32.3 
 
 		 325 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0949  phage/plasmid-related protein  25.97 
 
 		 350 aa  110  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0643661 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0865  hypothetical protein  47.06 
 
 		 119 aa  109  8.000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.334023  normal  0.973022 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0312  phage/plasmid-related protein  27.62 
 
 		 334 aa  100  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281243  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3609  phage/plasmid-related protein TIGR03299  26.83 
 
 		 395 aa  98.2  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00236551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2980  hypothetical protein  25.89 
 
 		 357 aa  91.7  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9010  phage/plasmid-related protein  24.25 
 
 		 329 aa  87.8  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.188276  normal  0.106896 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2577  hypothetical protein  26.42 
 
 		 335 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1721  hypothetical protein  26.42 
 
 		 335 aa  72  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.117642 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2258  hypothetical protein  25.4 
 
 		 334 aa  66.6  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.369604  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1581  hypothetical protein  24.58 
 
 		 334 aa  67  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1539  hypothetical protein  41.67 
 
 		 100 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5537  hypothetical protein  25.51 
 
 		 344 aa  59.3  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.196835  hitchhiker  0.0000686352 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>