14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_6239 on replicon NC_007972
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007972  Rmet_6239  hypothetical protein  100 
 
 		 74 aa  151  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.844528  normal  0.528701 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6527  hypothetical protein  69.44 
 
 		 72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5591  hypothetical protein  68.06 
 
 		 72 aa  110  9e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1598  hypothetical protein  68.06 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0542229  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5240  hypothetical protein  68.06 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.183286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3822  hypothetical protein  48.48 
 
 		 67 aa  72.8  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0619379  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5055  hypothetical protein  52.24 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1593  hypothetical protein  47.89 
 
 		 147 aa  70.1  0.000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.069456  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1661  hypothetical protein  42.65 
 
 		 129 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.096246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4294  hypothetical protein  44.93 
 
 		 69 aa  65.5  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.402447 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2540  hypothetical protein  44.29 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.616763 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5509  hypothetical protein  45.45 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.292206  normal  0.41712 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5022  hypothetical protein  41.43 
 
 		 70 aa  57  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.409216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4409  hypothetical protein  45.33 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>