15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5509 on replicon NC_007950
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007950  Bpro_5509  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  295  1e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.292206  normal  0.41712 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5055  hypothetical protein  45.71 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3822  hypothetical protein  47.22 
 
 		 67 aa  70.1  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0619379  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4409  hypothetical protein  50 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4294  hypothetical protein  50 
 
 		 69 aa  65.5  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.402447 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6527  hypothetical protein  44.12 
 
 		 72 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1593  hypothetical protein  44.93 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.069456  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5022  hypothetical protein  44.44 
 
 		 70 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.409216  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1661  hypothetical protein  43.48 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.096246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6239  hypothetical protein  47.62 
 
 		 74 aa  60.8  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.844528  normal  0.528701 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5591  hypothetical protein  45.59 
 
 		 72 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2540  hypothetical protein  41.79 
 
 		 144 aa  60.1  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.616763 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1598  hypothetical protein  40.3 
 
 		 72 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0542229  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5240  hypothetical protein  40.3 
 
 		 72 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.183286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2983  hypothetical protein  38.24 
 
 		 72 aa  48.1  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>