14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1593 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_1593  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  296  5e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.069456  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2540  hypothetical protein  52.38 
 
 
144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.616763 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6239  hypothetical protein  47.89 
 
 
74 aa  70.1  0.000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.844528  normal  0.528701 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5591  hypothetical protein  48.57 
 
 
72 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6527  hypothetical protein  49.3 
 
 
72 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5509  hypothetical protein  44.93 
 
 
146 aa  62  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.292206  normal  0.41712 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3822  hypothetical protein  46.27 
 
 
67 aa  62  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0619379  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1598  hypothetical protein  45.71 
 
 
72 aa  62  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0542229  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5240  hypothetical protein  45.71 
 
 
72 aa  62  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.183286  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1661  hypothetical protein  34.95 
 
 
129 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.096246  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5055  hypothetical protein  43.62 
 
 
135 aa  57.4  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227185  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4294  hypothetical protein  44.29 
 
 
69 aa  50.8  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.402447 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4409  hypothetical protein  41.43 
 
 
141 aa  50.1  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5022  hypothetical protein  41.1 
 
 
70 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.409216  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>