14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_5022 on replicon NC_012855
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012855  Rpic12D_5022  hypothetical protein  100 
 
 		 70 aa  144  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.409216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5509  hypothetical protein  44.44 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.292206  normal  0.41712 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1598  hypothetical protein  38.57 
 
 		 72 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0542229  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5240  hypothetical protein  38.57 
 
 		 72 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.183286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6239  hypothetical protein  41.43 
 
 		 74 aa  57  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.844528  normal  0.528701 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1661  hypothetical protein  45.31 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.096246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2540  hypothetical protein  40 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.616763 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3822  hypothetical protein  36.76 
 
 		 67 aa  53.9  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0619379  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5591  hypothetical protein  35.14 
 
 		 72 aa  50.8  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4294  hypothetical protein  32.86 
 
 		 69 aa  49.7  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.402447 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1593  hypothetical protein  41.1 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.069456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6527  hypothetical protein  30 
 
 		 72 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5055  hypothetical protein  37.5 
 
 		 135 aa  47.8  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4409  hypothetical protein  36.62 
 
 		 141 aa  43.9  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>