16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_6213 on replicon NC_007972
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007972  Rmet_6213  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  286  7e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.521083 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1331  hypothetical protein  38.46 
 
 		 193 aa  50.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.642506 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2818  hypothetical protein  40.62 
 
 		 151 aa  50.4  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2702  putative lipoprotein  30.77 
 
 		 199 aa  50.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3322  hypothetical protein  43.64 
 
 		 159 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.225493 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3323  hypothetical protein  42.11 
 
 		 159 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.232503 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5165  hypothetical protein  43.33 
 
 		 156 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.608057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21480  hypothetical protein  40.68 
 
 		 184 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000199316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3321  hypothetical protein  35.94 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.228769 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2700  putative lipoprotein  36.07 
 
 		 192 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2703  hypothetical protein  36.07 
 
 		 247 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04766  hypothetical protein  30.99 
 
 		 195 aa  42  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3324  hypothetical protein  41.86 
 
 		 160 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.228769 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5166  hypothetical protein  46.67 
 
 		 161 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.460168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21470  hypothetical protein  32.31 
 
 		 192 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.105143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2699  hypothetical protein  36.92 
 
 		 199 aa  40  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.782563  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>