15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3321 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3321  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  318  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.228769 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2818  hypothetical protein  75.17 
 
 
151 aa  254  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5165  hypothetical protein  63.95 
 
 
156 aa  217  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.608057  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5166  hypothetical protein  64.38 
 
 
161 aa  212  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.460168  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3322  hypothetical protein  63.7 
 
 
159 aa  206  6e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.225493 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3323  hypothetical protein  65.49 
 
 
159 aa  206  7e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.232503 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3324  hypothetical protein  62.5 
 
 
160 aa  201  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.228769 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4782  hypothetical protein  75.7 
 
 
135 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.887459  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3385  hypothetical protein  75.7 
 
 
135 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.816279  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4131  hypothetical protein  77.32 
 
 
100 aa  169  9e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.818482 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3325  hypothetical protein  45.76 
 
 
75 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.297001 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2702  putative lipoprotein  31.07 
 
 
199 aa  48.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1331  hypothetical protein  30.21 
 
 
193 aa  45.1  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.642506 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2700  putative lipoprotein  27.43 
 
 
192 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2703  hypothetical protein  26.79 
 
 
247 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>