16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3322 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3322  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  335  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.225493 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5165  hypothetical protein  81.29 
 
 		 156 aa  270  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.608057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5166  hypothetical protein  71.7 
 
 		 161 aa  249  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.460168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3323  hypothetical protein  68.55 
 
 		 159 aa  233  9e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.232503 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3324  hypothetical protein  66.88 
 
 		 160 aa  229  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.228769 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3321  hypothetical protein  63.7 
 
 		 151 aa  206  7e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.228769 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2818  hypothetical protein  61.64 
 
 		 151 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4782  hypothetical protein  54.29 
 
 		 135 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.887459  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3385  hypothetical protein  54.29 
 
 		 135 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.816279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4131  hypothetical protein  56.38 
 
 		 100 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.818482 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3325  hypothetical protein  52.73 
 
 		 75 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.297001 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1331  hypothetical protein  28.87 
 
 		 193 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.642506 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04766  hypothetical protein  28.71 
 
 		 195 aa  43.9  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2702  putative lipoprotein  29.13 
 
 		 199 aa  43.9  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6213  hypothetical protein  43.64 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.521083 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2699  hypothetical protein  30.77 
 
 		 199 aa  40.4  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.782563  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>