17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5166 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008391  Bamb_5166  hypothetical protein  100 
 
 
161 aa  338  2e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.460168  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3323  hypothetical protein  76.1 
 
 
159 aa  263  7e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.232503 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3322  hypothetical protein  71.7 
 
 
159 aa  249  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.225493 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3324  hypothetical protein  70 
 
 
160 aa  240  7.999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.228769 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5165  hypothetical protein  73.1 
 
 
156 aa  239  7.999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.608057  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3321  hypothetical protein  64.38 
 
 
151 aa  212  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.228769 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2818  hypothetical protein  58.9 
 
 
151 aa  197  5e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3385  hypothetical protein  52.1 
 
 
135 aa  137  6e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.816279  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4782  hypothetical protein  52.1 
 
 
135 aa  137  6e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.887459  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4131  hypothetical protein  58.51 
 
 
100 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.818482 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2702  putative lipoprotein  30.08 
 
 
199 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3325  hypothetical protein  44.07 
 
 
75 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.297001 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1331  hypothetical protein  26.02 
 
 
193 aa  50.8  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.642506 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2703  hypothetical protein  24.8 
 
 
247 aa  46.2  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2700  putative lipoprotein  24.19 
 
 
192 aa  43.9  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1608  hypothetical protein  25.6 
 
 
169 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04766  hypothetical protein  27.72 
 
 
195 aa  40.4  0.01  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>