17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5165 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_5165  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  327  5.0000000000000004e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.608057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3322  hypothetical protein  81.29 
 
 		 159 aa  270  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.225493 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5166  hypothetical protein  73.1 
 
 		 161 aa  239  7e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.460168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3323  hypothetical protein  68.59 
 
 		 159 aa  230  5e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.232503 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3321  hypothetical protein  63.95 
 
 		 151 aa  217  5e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.228769 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3324  hypothetical protein  61.69 
 
 		 160 aa  213  9e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.228769 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2818  hypothetical protein  59.86 
 
 		 151 aa  201  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3385  hypothetical protein  50.94 
 
 		 135 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.816279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4782  hypothetical protein  50.94 
 
 		 135 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.887459  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4131  hypothetical protein  52.63 
 
 		 100 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.818482 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3325  hypothetical protein  50.91 
 
 		 75 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.297001 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1331  hypothetical protein  29.9 
 
 		 193 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.642506 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2702  putative lipoprotein  30.93 
 
 		 199 aa  47.4  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4032  hypothetical protein  25 
 
 		 184 aa  43.5  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2699  hypothetical protein  29.9 
 
 		 199 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.782563  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04766  hypothetical protein  27.03 
 
 		 195 aa  42.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6213  hypothetical protein  43.33 
 
 		 143 aa  40.8  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.521083 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>