13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3324 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3324  hypothetical protein  100 
 
 
160 aa  333  3.9999999999999995e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.228769 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5166  hypothetical protein  70 
 
 
161 aa  240  7e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.460168  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3322  hypothetical protein  66.88 
 
 
159 aa  229  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.225493 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5165  hypothetical protein  61.69 
 
 
156 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.608057  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3323  hypothetical protein  59.62 
 
 
159 aa  204  4e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.232503 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3321  hypothetical protein  62.5 
 
 
151 aa  201  4e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.228769 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2818  hypothetical protein  56.25 
 
 
151 aa  187  7e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4782  hypothetical protein  54.29 
 
 
135 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.887459  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3385  hypothetical protein  54.29 
 
 
135 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.816279  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4131  hypothetical protein  57.45 
 
 
100 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.818482 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3325  hypothetical protein  49.15 
 
 
75 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.297001 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1331  hypothetical protein  31.82 
 
 
193 aa  41.2  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.642506 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2702  putative lipoprotein  26.8 
 
 
199 aa  40.4  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>