18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3323 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3323  hypothetical protein  100 
 
 
159 aa  335  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.232503 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5166  hypothetical protein  76.1 
 
 
161 aa  263  7e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.460168  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3322  hypothetical protein  68.55 
 
 
159 aa  233  9e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.225493 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5165  hypothetical protein  68.59 
 
 
156 aa  230  6e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.608057  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3321  hypothetical protein  65.49 
 
 
151 aa  206  8e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.228769 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3324  hypothetical protein  59.62 
 
 
160 aa  204  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.228769 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2818  hypothetical protein  59.86 
 
 
151 aa  191  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3385  hypothetical protein  48.51 
 
 
135 aa  122  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.816279  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4782  hypothetical protein  48.51 
 
 
135 aa  122  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.887459  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4131  hypothetical protein  52.22 
 
 
100 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.818482 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3325  hypothetical protein  49.15 
 
 
75 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.297001 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2702  putative lipoprotein  31.3 
 
 
199 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1331  hypothetical protein  30.17 
 
 
193 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.642506 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2703  hypothetical protein  29.31 
 
 
247 aa  50.4  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2700  putative lipoprotein  29.31 
 
 
192 aa  50.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1582  hypothetical protein  30 
 
 
169 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.781647  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1608  hypothetical protein  29.03 
 
 
169 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2699  hypothetical protein  28.06 
 
 
199 aa  43.9  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.782563  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>