22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_21470 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_21470  hypothetical protein  100 
 
 
192 aa  401  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.105143  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21480  hypothetical protein  68.45 
 
 
184 aa  254  7e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000199316  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1794  hypothetical protein  33.79 
 
 
170 aa  72.8  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1792  hypothetical protein  33.8 
 
 
177 aa  69.7  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1793  hypothetical protein  32.87 
 
 
177 aa  67  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04766  hypothetical protein  31.45 
 
 
195 aa  56.6  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02031  hypothetical protein  26.74 
 
 
169 aa  54.3  0.0000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1582  hypothetical protein  25.69 
 
 
169 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.781647  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1608  hypothetical protein  25.69 
 
 
169 aa  53.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2702  putative lipoprotein  26.32 
 
 
199 aa  51.6  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0988  hypothetical protein  28.47 
 
 
175 aa  51.2  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2703  hypothetical protein  24.14 
 
 
247 aa  50.4  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02033  hypothetical protein  25.58 
 
 
182 aa  50.8  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0987  hypothetical protein  28.47 
 
 
173 aa  50.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1511  hypothetical protein  29.55 
 
 
217 aa  50.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.468077  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2700  putative lipoprotein  24.14 
 
 
192 aa  49.7  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1510  hypothetical protein  28.03 
 
 
217 aa  48.9  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.272933  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1331  hypothetical protein  23.78 
 
 
193 aa  48.1  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.642506 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1509  hypothetical protein  27.08 
 
 
217 aa  45.4  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.260399  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1508  hypothetical protein  35.44 
 
 
217 aa  44.7  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal  0.840744 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2699  hypothetical protein  32.97 
 
 
199 aa  44.7  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.782563  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0208  hypothetical protein  24.66 
 
 
208 aa  41.6  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>