24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0208 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_0208  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  424  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3117  hypothetical protein  82.61 
 
 		 205 aa  356  9.999999999999999e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0451  hypothetical protein  58.62 
 
 		 261 aa  221  8e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0518875  normal  0.837787 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0453  hypothetical protein  63.03 
 
 		 221 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0103918  normal  0.212251 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0450  hypothetical protein  55.61 
 
 		 208 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.28845  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1510  hypothetical protein  45.21 
 
 		 217 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.272933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0452  hypothetical protein  53.44 
 
 		 277 aa  170  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0190737  normal  0.524539 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1508  hypothetical protein  53.52 
 
 		 217 aa  164  6.9999999999999995e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal  0.840744 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1509  hypothetical protein  50.7 
 
 		 217 aa  157  9e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.260399  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1511  hypothetical protein  50.7 
 
 		 217 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.468077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0987  hypothetical protein  44.29 
 
 		 173 aa  109  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0988  hypothetical protein  37.06 
 
 		 175 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2703  hypothetical protein  28.43 
 
 		 247 aa  53.9  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21480  hypothetical protein  23.7 
 
 		 184 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000199316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04766  hypothetical protein  33.33 
 
 		 195 aa  52  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02033  hypothetical protein  26.59 
 
 		 182 aa  49.7  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2699  hypothetical protein  33.72 
 
 		 199 aa  48.5  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.782563  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02031  hypothetical protein  27.92 
 
 		 169 aa  48.1  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1331  hypothetical protein  30.72 
 
 		 193 aa  48.1  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.642506 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1608  hypothetical protein  31.91 
 
 		 169 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1582  hypothetical protein  31.91 
 
 		 169 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.781647  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2700  putative lipoprotein  30 
 
 		 192 aa  47.8  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2702  putative lipoprotein  27.39 
 
 		 199 aa  45.8  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21470  hypothetical protein  24.66 
 
 		 192 aa  41.6  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.105143  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>