25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1509 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1509  hypothetical protein  100 
 
 		 217 aa  451  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.260399  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1510  hypothetical protein  91.24 
 
 		 217 aa  418  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.272933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1508  hypothetical protein  85.71 
 
 		 217 aa  366  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal  0.840744 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1511  hypothetical protein  78.8 
 
 		 217 aa  319  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.468077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0208  hypothetical protein  44.68 
 
 		 208 aa  165  5e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0451  hypothetical protein  52.38 
 
 		 261 aa  160  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0518875  normal  0.837787 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3117  hypothetical protein  41.49 
 
 		 205 aa  158  7e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0453  hypothetical protein  53.69 
 
 		 221 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0103918  normal  0.212251 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0450  hypothetical protein  56.29 
 
 		 208 aa  135  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.28845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0452  hypothetical protein  46.49 
 
 		 277 aa  132  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0190737  normal  0.524539 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0987  hypothetical protein  43.82 
 
 		 173 aa  125  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0988  hypothetical protein  39.66 
 
 		 175 aa  98.2  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1331  hypothetical protein  32.89 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.642506 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2702  putative lipoprotein  33.95 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21480  hypothetical protein  30.52 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000199316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2703  hypothetical protein  31.5 
 
 		 247 aa  54.7  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04766  hypothetical protein  29.41 
 
 		 195 aa  54.7  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2700  putative lipoprotein  30.95 
 
 		 192 aa  54.7  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2699  hypothetical protein  33.13 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.782563  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1608  hypothetical protein  41.1 
 
 		 169 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1582  hypothetical protein  41.1 
 
 		 169 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.781647  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02031  hypothetical protein  35.48 
 
 		 169 aa  47.4  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02033  hypothetical protein  33.33 
 
 		 182 aa  46.6  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21470  hypothetical protein  27.41 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.105143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2918  hypothetical protein  34.34 
 
 		 568 aa  41.6  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>