26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_21480 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_21480  hypothetical protein  100 
 
 
184 aa  386  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000199316  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21470  hypothetical protein  73.15 
 
 
192 aa  246  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.105143  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1792  hypothetical protein  34.93 
 
 
177 aa  84.7  7e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1794  hypothetical protein  36.3 
 
 
170 aa  83.2  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1793  hypothetical protein  36.05 
 
 
177 aa  83.2  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04766  hypothetical protein  31.76 
 
 
195 aa  64.3  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1510  hypothetical protein  29.22 
 
 
217 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.272933  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0988  hypothetical protein  25.81 
 
 
175 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0987  hypothetical protein  27.1 
 
 
173 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1511  hypothetical protein  30.71 
 
 
217 aa  57.8  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.468077  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02031  hypothetical protein  31.85 
 
 
169 aa  55.5  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1508  hypothetical protein  29.79 
 
 
217 aa  54.3  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal  0.840744 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1509  hypothetical protein  31.21 
 
 
217 aa  54.3  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.260399  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1582  hypothetical protein  24.67 
 
 
169 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.781647  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1608  hypothetical protein  24.67 
 
 
169 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0208  hypothetical protein  23.7 
 
 
208 aa  52.8  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02033  hypothetical protein  30.37 
 
 
182 aa  52.8  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2702  putative lipoprotein  24.19 
 
 
199 aa  49.7  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2699  hypothetical protein  26.7 
 
 
199 aa  50.1  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.782563  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3117  hypothetical protein  23.12 
 
 
205 aa  49.7  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2703  hypothetical protein  24.67 
 
 
247 aa  49.3  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2700  putative lipoprotein  24.67 
 
 
192 aa  49.3  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0451  hypothetical protein  29.1 
 
 
261 aa  48.5  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0518875  normal  0.837787 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1331  hypothetical protein  25.37 
 
 
193 aa  48.1  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.642506 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0453  hypothetical protein  26.81 
 
 
221 aa  47.8  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0103918  normal  0.212251 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6213  hypothetical protein  40.68 
 
 
143 aa  41.6  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.521083 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>