24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1792 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_1792  hypothetical protein  100 
 
 
177 aa  363  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1793  hypothetical protein  92.09 
 
 
177 aa  284  5e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1794  hypothetical protein  80.23 
 
 
170 aa  244  4e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21480  hypothetical protein  39.46 
 
 
184 aa  100  8e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000199316  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21470  hypothetical protein  37.06 
 
 
192 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.105143  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1331  hypothetical protein  30.6 
 
 
193 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.642506 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2700  putative lipoprotein  30.9 
 
 
192 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04766  hypothetical protein  35.97 
 
 
195 aa  61.2  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2703  hypothetical protein  30.51 
 
 
247 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1582  hypothetical protein  32.41 
 
 
169 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.781647  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1608  hypothetical protein  32.41 
 
 
169 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2702  putative lipoprotein  28.5 
 
 
199 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1510  hypothetical protein  29.94 
 
 
217 aa  51.2  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.272933  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1509  hypothetical protein  29.53 
 
 
217 aa  49.3  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.260399  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0451  hypothetical protein  28.12 
 
 
261 aa  48.1  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0518875  normal  0.837787 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02033  hypothetical protein  29.3 
 
 
182 aa  47.8  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1511  hypothetical protein  27.69 
 
 
217 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.468077  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02031  hypothetical protein  29.3 
 
 
169 aa  46.2  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0988  hypothetical protein  26.75 
 
 
175 aa  45.8  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0453  hypothetical protein  26.12 
 
 
221 aa  45.1  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0103918  normal  0.212251 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0987  hypothetical protein  25.48 
 
 
173 aa  44.7  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0208  hypothetical protein  25.37 
 
 
208 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2699  hypothetical protein  31.47 
 
 
199 aa  43.9  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.782563  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3117  hypothetical protein  22.66 
 
 
205 aa  41.2  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>