20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0452 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0452  hypothetical protein  100 
 
 
277 aa  568  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0190737  normal  0.524539 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0453  hypothetical protein  74.88 
 
 
221 aa  293  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0103918  normal  0.212251 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0451  hypothetical protein  63.72 
 
 
261 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0518875  normal  0.837787 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0450  hypothetical protein  74.04 
 
 
208 aa  260  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.28845  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0208  hypothetical protein  53.44 
 
 
208 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3117  hypothetical protein  55.97 
 
 
205 aa  179  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1510  hypothetical protein  47.57 
 
 
217 aa  166  5e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.272933  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1508  hypothetical protein  52.67 
 
 
217 aa  159  4e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal  0.840744 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1509  hypothetical protein  52 
 
 
217 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.260399  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1511  hypothetical protein  50 
 
 
217 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.468077  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0987  hypothetical protein  38.92 
 
 
173 aa  97.8  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0988  hypothetical protein  35.48 
 
 
175 aa  85.9  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04766  hypothetical protein  32.5 
 
 
195 aa  57.4  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2700  putative lipoprotein  29.41 
 
 
192 aa  53.5  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1608  hypothetical protein  29.41 
 
 
169 aa  52.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1582  hypothetical protein  29.41 
 
 
169 aa  52.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.781647  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2703  hypothetical protein  26.67 
 
 
247 aa  52.8  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1331  hypothetical protein  27.81 
 
 
193 aa  47.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.642506 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2702  putative lipoprotein  27.83 
 
 
199 aa  46.2  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2699  hypothetical protein  28 
 
 
199 aa  45.8  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.782563  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>