88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1674 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp1674  hypothetical protein  100 
 
 
241 aa  506  9.999999999999999e-143  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1668  hypothetical protein  97.93 
 
 
241 aa  495  1e-139  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1235  spermidine synthase  31.16 
 
 
267 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.265162 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0521  putative spermidine synthase  32 
 
 
247 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0330  putative spermidine synthase  24.48 
 
 
277 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3042  putative spermidine synthase  29.33 
 
 
247 aa  62.8  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.784993  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0615  putative spermidine synthase  29.49 
 
 
248 aa  62.4  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.439002 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3030  spermine synthase  20.32 
 
 
322 aa  62.4  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0913  spermidine synthase-like  25.31 
 
 
253 aa  59.7  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891496  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6553  spermidine synthase-like protein  24.86 
 
 
278 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0180  putative acyl transferase  23.46 
 
 
275 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728763  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1722  spermidine synthase-like protein  23.57 
 
 
289 aa  58.2  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6267  spermidine synthase-like protein  24.86 
 
 
278 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.526143 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2111  spermidine synthase  26.23 
 
 
255 aa  58.2  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0828  spermine synthase  30.85 
 
 
247 aa  55.5  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.547147 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7524  putative spermidine synthase (methyl transferase)  24.88 
 
 
307 aa  55.5  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0334  putative spermidine synthase  23.38 
 
 
257 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.737223  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3323  spermine synthase  27.03 
 
 
247 aa  54.3  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0960  spermidine synthase  27.52 
 
 
247 aa  53.5  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3220  spermine synthase  26.35 
 
 
247 aa  53.1  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0803  spermine synthase  26.35 
 
 
247 aa  53.1  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.449448 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  24.7 
 
 
558 aa  53.1  0.000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2497  hypothetical protein  25.84 
 
 
310 aa  52  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00914951  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5272  spermidine synthase-like protein  22.51 
 
 
281 aa  52  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1622  spermine/spermidine synthase family protein  26.22 
 
 
284 aa  52  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1537  spermine/spermidine synthase family protein  26.22 
 
 
269 aa  52  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11208  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3513  spermine synthase  27.03 
 
 
247 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3636  spermine synthase  27.03 
 
 
261 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3442  Spermine synthase  27.03 
 
 
261 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0114  transferase  26.22 
 
 
276 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0851  spermine synthase  27.03 
 
 
247 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0898  spermine synthase  27.03 
 
 
247 aa  51.2  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0321  putative transferase  23.2 
 
 
264 aa  50.4  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.206732  normal  0.105369 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0150  hypothetical protein  23.2 
 
 
264 aa  50.4  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.825231  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4588  spermidine synthase-like protein  23.33 
 
 
283 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.213578  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1257  transferase  24.53 
 
 
231 aa  50.4  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0927  spermine synthase  28.97 
 
 
247 aa  49.3  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0248  spermine synthase  22.94 
 
 
308 aa  48.9  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.190806  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1223  hypothetical protein  29.03 
 
 
310 aa  48.9  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2143  spermidine synthase-like protein  25.9 
 
 
259 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.122833  normal  0.469239 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2501  hypothetical protein  22.43 
 
 
252 aa  48.1  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1819  putative transferase  23.03 
 
 
235 aa  47.8  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5699  putative spermidine synthase protein  22.45 
 
 
278 aa  48.5  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13386  spermine/spermidine synthase  21.71 
 
 
275 aa  48.5  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2160  hypothetical protein  23.03 
 
 
235 aa  47.8  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0060  spermidine synthase  21.92 
 
 
281 aa  47.8  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1034  hypothetical protein  29.68 
 
 
268 aa  47  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0225297  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2285  putative spermidine synthase  21.95 
 
 
256 aa  46.6  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7063  spermidine synthase-like protein  24.06 
 
 
282 aa  47  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.239263  normal  0.226573 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0336  putative spermidine synthase  23.4 
 
 
274 aa  46.2  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2904  spermidine synthase-like protein  23.88 
 
 
551 aa  46.2  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0936  Spermine synthase  19.15 
 
 
516 aa  46.2  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0791  spermine synthase  28.34 
 
 
247 aa  45.8  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0618517 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2336  hypothetical protein  24.43 
 
 
315 aa  45.8  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.201529  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4663  putative spermidine synthase  22.99 
 
 
271 aa  45.8  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.616274 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1476  hypothetical protein  22.07 
 
 
262 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.251712  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3177  spermidine synthase-like protein  23.13 
 
 
548 aa  45.4  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0726  hypothetical protein  28.69 
 
 
705 aa  45.4  0.0009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2906  putative spermidine synthase  24.74 
 
 
253 aa  45.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6557  spermidine synthase-like protein  23.53 
 
 
278 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339999  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0745  spermine synthase  28.38 
 
 
247 aa  45.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1274  spermidine synthase-like protein  23.53 
 
 
278 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2859  ATP-binding protein  22.9 
 
 
253 aa  44.7  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.409407  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0745  hypothetical protein  28.69 
 
 
705 aa  45.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0941  hypothetical protein  26.29 
 
 
251 aa  44.7  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.330674  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0958  hypothetical protein  27.92 
 
 
364 aa  43.9  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0764125  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1248  hypothetical protein  25.37 
 
 
260 aa  43.9  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06000  hypothetical protein  25.18 
 
 
266 aa  44.3  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1442  hypothetical protein  21.92 
 
 
251 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.280635 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3240  hypothetical protein  26.15 
 
 
255 aa  43.9  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6858  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0899  Spermine synthase  22.96 
 
 
248 aa  43.5  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3323  hypothetical protein  27.63 
 
 
310 aa  43.1  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.810152  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0231  spermidine synthase  21.55 
 
 
334 aa  42.7  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0925  hypothetical protein  25.12 
 
 
291 aa  42.7  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.759797  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2801  spermine synthase  28.92 
 
 
221 aa  42.7  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0155  spermidine synthase  24.24 
 
 
276 aa  42.4  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.164944  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6163  spermidine synthase-like protein  23.53 
 
 
239 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.523417  normal  0.0514114 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3848  hypothetical protein  21.46 
 
 
261 aa  42.4  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0392798  normal  0.107844 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1867  hypothetical protein  21.46 
 
 
251 aa  42.4  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492949  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2749  spermidine synthase  20.96 
 
 
295 aa  42  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.53231 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0932  spermidine synthase-like protein  23.2 
 
 
551 aa  42  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.624044  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5396  hypothetical protein  28.44 
 
 
274 aa  42  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.734141 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2884  spermidine synthase  24.03 
 
 
292 aa  42  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0912  spermidine synthase-like  23.81 
 
 
259 aa  42  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0938  spermidine synthase-like protein  27.63 
 
 
305 aa  42  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0771675  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0995  hypothetical protein  25.24 
 
 
295 aa  42  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.83417 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0860  hypothetical protein  25.12 
 
 
291 aa  42  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.790744  normal  0.441681 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1162  hypothetical protein  27.27 
 
 
309 aa  41.6  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>