More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3000 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_3000  NLP/P60 protein  100 
 
 		 463 aa  888    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.487438  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2110  NLP/P60 protein  38.95 
 
 		 491 aa  201  1.9999999999999998e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0361918  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0613  NLP/P60 protein  56.15 
 
 		 502 aa  145  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.322284 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32150  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  52.59 
 
 		 475 aa  142  9e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191937  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0694  NLP/P60 protein  45.83 
 
 		 453 aa  109  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.427421 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2144  NLP/P60 protein  48.54 
 
 		 374 aa  106  7e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  43.65 
 
 		 394 aa  102  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  46.36 
 
 		 388 aa  99.4  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8441  NLP/P60 protein  41.91 
 
 		 422 aa  99.4  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.150929 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0198  NLP/P60 protein  41.13 
 
 		 458 aa  98.6  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.193606 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  45.37 
 
 		 388 aa  97.8  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  42.02 
 
 		 329 aa  98.2  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  42.45 
 
 		 374 aa  97.1  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0586  NLP/P60 protein  38.74 
 
 		 432 aa  94.7  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  41.44 
 
 		 438 aa  94  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4498  NLP/P60 protein  47.37 
 
 		 398 aa  93.6  6e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  44.14 
 
 		 452 aa  93.6  7e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  46.02 
 
 		 308 aa  93.6  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3958  NLP/P60 protein  37.93 
 
 		 323 aa  92.4  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.068937  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2296  NLP/P60 protein  39.39 
 
 		 625 aa  92  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000910624  hitchhiker  0.00399846 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0889  NLP/P60 protein  40.34 
 
 		 337 aa  92.4  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1427  NLP/P60 protein  40.5 
 
 		 301 aa  91.3  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  43.97 
 
 		 345 aa  90.9  5e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4520  NLP/P60 protein  38.46 
 
 		 472 aa  90.5  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2451  NLP/P60  36.65 
 
 		 475 aa  90.1  7e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.629046  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2496  NLP/P60 protein  36.65 
 
 		 475 aa  90.1  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2488  NLP/P60 protein  36.65 
 
 		 475 aa  90.1  7e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  44.23 
 
 		 306 aa  89.4  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3579  NLP/P60 protein  38.62 
 
 		 323 aa  89.4  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1696  NLP/P60  42.28 
 
 		 302 aa  88.6  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.033206  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4511  NLP/P60 protein  40 
 
 		 388 aa  88.6  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.307006  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9181  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  41.03 
 
 		 531 aa  88.2  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28410  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  41.94 
 
 		 378 aa  86.3  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3076  NLP/P60 protein  41.46 
 
 		 231 aa  86.3  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  40.83 
 
 		 331 aa  85.5  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  38.84 
 
 		 333 aa  85.5  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1440  NLP/P60  40 
 
 		 467 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51506  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8582  NLP/P60 protein  42.59 
 
 		 180 aa  85.9  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0901428  normal  0.349112 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11506  invasion protein  39.02 
 
 		 472 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0747167 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1458  NLP/P60 protein  40 
 
 		 467 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.614878  normal  0.41084 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2555  NLP/P60 protein  41.46 
 
 		 199 aa  85.5  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4564  NLP/P60 protein  40.8 
 
 		 467 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.057013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5879  NLP/P60 protein  41.41 
 
 		 333 aa  84.3  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3663  NLP/P60 protein  32.69 
 
 		 479 aa  84.3  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.24038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3074  NLP/P60 protein  46.23 
 
 		 116 aa  84  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2140  NLP/P60 protein  37.23 
 
 		 427 aa  83.6  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000576124  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  44.33 
 
 		 230 aa  83.6  0.000000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  44.55 
 
 		 236 aa  83.2  0.000000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  35.86 
 
 		 269 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2747  NLP/P60 protein  35.77 
 
 		 478 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.552726  normal  0.486637 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3656  NLP/P60 protein  39.2 
 
 		 469 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2139  NLP/P60 protein  45 
 
 		 374 aa  82  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.606148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2839  NLP/P60 protein  38.4 
 
 		 469 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.239503 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5292  NLP/P60 protein  38.4 
 
 		 469 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.308075  normal  0.186714 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5716  NLP/P60 protein  38.4 
 
 		 469 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0895  NLP/P60 protein  38.4 
 
 		 469 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  39.81 
 
 		 162 aa  81.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  37.01 
 
 		 319 aa  81.6  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6766  NLP/P60 protein  41.41 
 
 		 350 aa  81.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1561  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  39.81 
 
 		 337 aa  81.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.308616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  37.58 
 
 		 1048 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2843  NLP/P60 protein  37.91 
 
 		 256 aa  80.9  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.676167 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2333  NLP/P60 protein  35.88 
 
 		 432 aa  80.5  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554645  normal  0.0124113 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  42.59 
 
 		 340 aa  80.1  0.00000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  40.74 
 
 		 204 aa  80.1  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2747  NLP/P60 protein  40.16 
 
 		 327 aa  80.1  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.347637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5324  NLP/P60 protein  38.16 
 
 		 256 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  35.17 
 
 		 269 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5288  NLP/P60 protein  37.25 
 
 		 257 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.181073 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5687  NLP/P60 protein  38.16 
 
 		 256 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.444646 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5720  NLP/P60 protein  37.25 
 
 		 257 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3652  NLP/P60 protein  37.25 
 
 		 257 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.387493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2750  NLP/P60 protein  41.96 
 
 		 190 aa  79  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.841293 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8562  NLP/P60 protein  43.75 
 
 		 373 aa  79  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0614213  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  36.55 
 
 		 307 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11930  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  39.26 
 
 		 176 aa  78.2  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.39384 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0696  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  43.4 
 
 		 300 aa  77.8  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4557  NLP/P60 protein  40 
 
 		 248 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  39.68 
 
 		 342 aa  77.8  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  42.11 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0902  NLP/P60 protein  37.24 
 
 		 256 aa  77.4  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2686  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  37.5 
 
 		 330 aa  77.4  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377535  normal  0.257604 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  40.19 
 
 		 417 aa  77.4  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2096  NLP/P60 protein  47.31 
 
 		 375 aa  77.4  0.0000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.685486  normal  0.535161 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  29.22 
 
 		 257 aa  77  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8043  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  39.42 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0570  NLP/P60 protein  39.62 
 
 		 160 aa  77  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  39.84 
 
 		 340 aa  76.6  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1447  NLP/P60  36.88 
 
 		 256 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.397182  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  39.25 
 
 		 335 aa  76.3  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1465  NLP/P60 protein  36.88 
 
 		 256 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.589531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3688  NLP/P60 protein  36.84 
 
 		 248 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  38.94 
 
 		 235 aa  75.5  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6731  NLP/P60 protein  44.76 
 
 		 308 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00865661  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  41.24 
 
 		 273 aa  75.5  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1072  NLP/P60 protein  36.69 
 
 		 393 aa  75.1  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.191144  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  36.36 
 
 		 337 aa  75.5  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2872  NLP/P60 protein  37.5 
 
 		 164 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  37.23 
 
 		 232 aa  74.7  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5004  NLP/P60 protein  39.25 
 
 		 347 aa  75.1  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.549544  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>