181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4225 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1717  hypothetical protein  41.99 
 
 		 1423 aa  993    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0158292 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2993  protein of unknown function DUF490  36.4 
 
 		 1463 aa  672    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.407315 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2766  hypothetical protein  36.12 
 
 		 1463 aa  667    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.70976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0874  hypothetical protein  33.17 
 
 		 1489 aa  644    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6385  hypothetical protein  38.32 
 
 		 1448 aa  658    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6778  protein of unknown function DUF490  37.38 
 
 		 1530 aa  675    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1002  hypothetical protein  34 
 
 		 1487 aa  646    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19226  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2889  protein of unknown function DUF490  36.13 
 
 		 1441 aa  676    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.913216 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4225  hypothetical protein  100 
 
 		 1428 aa  2723    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.436488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2388  hypothetical protein  36.15 
 
 		 1451 aa  619  1e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130143  normal  0.0161246 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2617  protein of unknown function DUF490  32.32 
 
 		 1424 aa  537  1e-151  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2888  hypothetical protein  33.07 
 
 		 1869 aa  374  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4089  hypothetical protein  31.95 
 
 		 1404 aa  347  1e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2098  hypothetical protein  29.03 
 
 		 1500 aa  346  2e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1520  hypothetical protein  34.36 
 
 		 1538 aa  278  5e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3627  protein of unknown function DUF490  32.97 
 
 		 2140 aa  277  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.1533 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0054  hypothetical protein  36 
 
 		 1578 aa  275  6e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0049  hypothetical protein  27.6 
 
 		 1515 aa  272  2.9999999999999997e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0048  hypothetical protein  27.5 
 
 		 1510 aa  269  2e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3915  protein of unknown function DUF490  32.44 
 
 		 2032 aa  268  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.411951 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2482  hypothetical protein  24.48 
 
 		 1462 aa  231  1e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.915526  normal  0.262243 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1343  hypothetical protein  24.64 
 
 		 1550 aa  227  1e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1183  hypothetical protein  28.6 
 
 		 1276 aa  221  7.999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2845  hypothetical protein  31.04 
 
 		 1276 aa  216  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.862539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2622  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1276 aa  213  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0166  hypothetical protein  32.97 
 
 		 1319 aa  211  1e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4828  hypothetical protein  28.26 
 
 		 1392 aa  187  9e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.470253  normal  0.310225 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3382  protein of unknown function DUF490  31.49 
 
 		 1084 aa  186  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0432  protein of unknown function DUF490  24.58 
 
 		 1448 aa  187  2.0000000000000003e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.883753 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2678  hypothetical protein  27.33 
 
 		 1501 aa  184  7e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0383  hypothetical protein  27.19 
 
 		 1395 aa  181  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1103  hypothetical protein  29.61 
 
 		 1398 aa  180  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2396  hypothetical protein  31.08 
 
 		 1335 aa  174  1e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0244  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1206 aa  172  3e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0413  protein of unknown function DUF490  25.1 
 
 		 1405 aa  171  9e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2200  hypothetical protein  30.97 
 
 		 1396 aa  154  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.339994 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2904  protein of unknown function DUF490  36.46 
 
 		 1937 aa  151  9e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.125236 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1561  hypothetical protein  27.7 
 
 		 1406 aa  149  5e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.222268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1130  hypothetical protein  35.85 
 
 		 1783 aa  147  2e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.455724 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0464  protein of unknown function DUF490  26.28 
 
 		 1550 aa  136  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0070  hypothetical protein  27.29 
 
 		 1270 aa  130  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2645  hypothetical protein  31.89 
 
 		 1362 aa  116  4.0000000000000004e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31690  hypothetical protein  25.63 
 
 		 1221 aa  107  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2695  hypothetical protein  25.6 
 
 		 1221 aa  108  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28850  hypothetical protein  24.97 
 
 		 1232 aa  100  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2893  hypothetical protein  25.61 
 
 		 1224 aa  97.8  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2889  hypothetical protein  25.09 
 
 		 1224 aa  98.2  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.224565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2797  hypothetical protein  25.61 
 
 		 1206 aa  97.1  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.149049 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2809  hypothetical protein  26.27 
 
 		 1377 aa  95.5  7e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0187  hypothetical protein  24.78 
 
 		 1308 aa  93.6  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1625  protein of unknown function DUF490  24.57 
 
 		 1184 aa  92.8  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000031551 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1957  hypothetical protein  24.57 
 
 		 1184 aa  92.8  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0672  hypothetical protein  29.09 
 
 		 1401 aa  90.9  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0830  hypothetical protein  26.74 
 
 		 1256 aa  90.9  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0579081  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1864  hypothetical protein  28.94 
 
 		 1319 aa  89  6e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2396  hypothetical protein  24.88 
 
 		 1223 aa  89  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0434  hypothetical protein  26.05 
 
 		 1265 aa  81.3  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00651214  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0447  hypothetical protein  25.91 
 
 		 1352 aa  80.9  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3980  protein of unknown function DUF490  27.12 
 
 		 1285 aa  80.9  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.556026 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2750  hypothetical protein  24.26 
 
 		 1229 aa  79.7  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478411  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2479  hypothetical protein  24.67 
 
 		 1226 aa  79.7  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.502504 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0371  hypothetical protein  25.6 
 
 		 1262 aa  79  0.0000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2532  hypothetical protein  29.2 
 
 		 1310 aa  78.2  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3646  hypothetical protein  23.95 
 
 		 1224 aa  77.8  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0441929 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0461  hypothetical protein  23.95 
 
 		 1218 aa  77  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2192  protein of unknown function DUF490  27.63 
 
 		 1304 aa  76.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.247605 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1896  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1305 aa  76.3  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.705923  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4471  protein of unknown function DUF490  26.7 
 
 		 1359 aa  75.9  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1593  hypothetical protein  27.88 
 
 		 1292 aa  75.5  0.000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2361  hypothetical protein  25.27 
 
 		 1453 aa  75.1  0.000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.284497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1014  protein of unknown function DUF490  27.21 
 
 		 1443 aa  75.1  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.954334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0505  hypothetical protein  23.98 
 
 		 1273 aa  74.3  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0834  putative signal peptide protein  26.8 
 
 		 1243 aa  74.7  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0654835  normal  0.24318 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2771  hypothetical protein  27.52 
 
 		 1392 aa  73.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.105544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0534  hypothetical protein  29.44 
 
 		 1283 aa  73.9  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0817453  normal  0.113617 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1031  protein of unknown function DUF490  26.72 
 
 		 1426 aa  74.3  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2596  protein of unknown function DUF490  26.75 
 
 		 1304 aa  73.2  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.346321 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0569  pathogenicity protein  23.89 
 
 		 1273 aa  72.8  0.00000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03725  pathogenicity protein  28.04 
 
 		 1285 aa  72.4  0.00000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1796  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1332 aa  72  0.00000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3956  hypothetical protein  26.14 
 
 		 1473 aa  72  0.00000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743785 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1217  hypothetical protein  25.18 
 
 		 1361 aa  72  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0856  hypothetical protein  25.99 
 
 		 1346 aa  72  0.00000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.394645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1443  hypothetical protein  35.61 
 
 		 1304 aa  71.6  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1893  hypothetical protein  32.84 
 
 		 1449 aa  71.2  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0229632 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00780  hypothetical protein  25 
 
 		 1290 aa  71.6  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3484  hypothetical protein  25.53 
 
 		 1435 aa  70.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00155309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2142  hypothetical protein  32.09 
 
 		 1398 aa  70.5  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.048277 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0165  hypothetical protein  26.54 
 
 		 1504 aa  70.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.615752  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1835  hypothetical protein  32.09 
 
 		 1402 aa  70.1  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.242519 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2113  hypothetical protein  32.09 
 
 		 1385 aa  69.7  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0704  protein of unknown function DUF490  25.16 
 
 		 1705 aa  69.7  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0295  protein of unknown function DUF490  24.43 
 
 		 1382 aa  69.3  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.749583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2485  hypothetical protein  29.56 
 
 		 1358 aa  68.9  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2353  hypothetical protein  29.56 
 
 		 1360 aa  68.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.732619  normal  0.322584 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1935  hypothetical protein  31.94 
 
 		 1344 aa  68.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.883664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1902  hypothetical protein  31.94 
 
 		 1341 aa  68.6  0.0000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1928  hypothetical protein  31.94 
 
 		 1344 aa  68.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.764751  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2391  protein of unknown function DUF490  31.94 
 
 		 1344 aa  68.6  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0970282  normal  0.146937 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0399  hypothetical protein  27.35 
 
 		 1258 aa  68.6  0.0000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>