286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4516 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4516  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 432 aa  889    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1879  extracellular solute-binding protein  25.65 
 
 		 453 aa  82.4  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.909678  normal  0.114435 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2703  extracellular solute-binding protein family 1  21.76 
 
 		 450 aa  81.3  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263225  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0405  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  27.46 
 
 		 438 aa  78.2  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1090  extracellular solute-binding protein family 1  27.6 
 
 		 436 aa  78.2  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.667729  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1846  extracellular solute-binding protein family 1  25.34 
 
 		 425 aa  75.5  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169612  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4213  extracellular solute-binding protein family 1  23.89 
 
 		 426 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.215316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4174  extracellular solute-binding protein family 1  23.89 
 
 		 426 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  25.06 
 
 		 504 aa  70.9  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1812  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  23.1 
 
 		 430 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  25.76 
 
 		 459 aa  68.6  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1520  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  22.96 
 
 		 430 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6765  extracellular solute-binding protein family 1  22.87 
 
 		 419 aa  67.8  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0074  extracellular solute-binding protein  24.76 
 
 		 429 aa  67.8  0.0000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3567  ABC transporter substrate binding protein (sorbitol)  25.89 
 
 		 439 aa  67.8  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  22.61 
 
 		 432 aa  67.4  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2417  transcriptional regulator, ABC transporter  23.02 
 
 		 421 aa  67.4  0.0000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0335393 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0385  extracellular solute-binding protein family 1  25.12 
 
 		 410 aa  67  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0354  extracellular solute-binding protein  21.45 
 
 		 419 aa  67  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188589  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1619  extracellular solute-binding protein  22.62 
 
 		 450 aa  66.6  0.0000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6904  extracellular solute-binding protein family 1  27.54 
 
 		 404 aa  67  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000382644  hitchhiker  0.00751503 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2365  extracellular solute-binding protein family 1  24.03 
 
 		 416 aa  66.6  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.618021 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2293  extracellular solute-binding protein family 1  25.93 
 
 		 425 aa  66.6  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0656119  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2336  extracellular solute-binding protein family 1  22.69 
 
 		 430 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.193691  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  24.33 
 
 		 415 aa  65.9  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01287  predicted sugar transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  22.69 
 
 		 430 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1425  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  22.69 
 
 		 430 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2315  extracellular solute-binding protein  22.69 
 
 		 430 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.62001  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01298  hypothetical protein  22.69 
 
 		 430 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3465  extracellular solute-binding protein  26.33 
 
 		 411 aa  65.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5852  extracellular solute-binding protein family 1  22.16 
 
 		 419 aa  64.3  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  31.17 
 
 		 414 aa  63.9  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2553  extracellular solute-binding protein family 1  21.72 
 
 		 432 aa  63.9  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.964139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  25.97 
 
 		 422 aa  63.5  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0915  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  25.64 
 
 		 443 aa  63.5  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.779259 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0501  extracellular solute-binding protein family 1  22.77 
 
 		 433 aa  61.2  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000488029  hitchhiker  0.0000184856 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3483  extracellular solute-binding protein  26.27 
 
 		 417 aa  60.8  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4468  extracellular solute-binding protein  25.13 
 
 		 436 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3674  ABC sugar transporter, periplasmic binding protein  23.77 
 
 		 404 aa  60.5  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0069  twin-arginine translocation pathway signal  23.7 
 
 		 432 aa  60.5  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  23.49 
 
 		 417 aa  60.1  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  23.34 
 
 		 422 aa  60.1  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0108  twin-arginine translocation pathway signal  22.79 
 
 		 435 aa  59.7  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.77402 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  24.06 
 
 		 411 aa  59.3  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  32.68 
 
 		 406 aa  59.7  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3246  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 		 440 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00178427  normal  0.716937 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  29.93 
 
 		 415 aa  59.3  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2420  extracellular solute-binding protein  21.74 
 
 		 420 aa  59.7  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.228974 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  26.11 
 
 		 420 aa  58.9  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3409  extracellular solute-binding protein  24.84 
 
 		 404 aa  59.3  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.280364  normal  0.614723 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2925  putative maltose/mannitol ABC transporter binding protein subunit  24.14 
 
 		 436 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.732093  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  25.68 
 
 		 410 aa  58.9  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  24.55 
 
 		 419 aa  58.9  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3591  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 421 aa  58.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.317951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1494  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.36 
 
 		 438 aa  58.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3771  extracellular solute-binding protein  23.95 
 
 		 421 aa  57.8  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4016  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  24.53 
 
 		 437 aa  57.8  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2164  extracellular solute-binding protein  21.99 
 
 		 430 aa  57.8  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0845615 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0954  extracellular solute-binding protein  24.62 
 
 		 397 aa  57.4  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.233769  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0381  extracellular solute-binding protein family 1  27.56 
 
 		 445 aa  57.4  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.491759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  24.05 
 
 		 414 aa  57.4  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  28.76 
 
 		 427 aa  56.6  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0186  extracellular solute-binding protein  25.44 
 
 		 397 aa  57  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3575  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  24.53 
 
 		 437 aa  56.6  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3709  extracellular solute-binding protein  24.53 
 
 		 437 aa  56.6  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  29.94 
 
 		 424 aa  56.6  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0116  extracellular solute-binding protein  26.64 
 
 		 420 aa  56.6  0.0000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  26.24 
 
 		 416 aa  56.6  0.0000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0063  extracellular solute-binding protein family 1  29.8 
 
 		 475 aa  56.6  0.0000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0118  extracellular solute-binding protein  26.64 
 
 		 420 aa  56.6  0.0000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  33.55 
 
 		 419 aa  56.2  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.033461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  24.37 
 
 		 430 aa  56.2  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4693  extracellular solute-binding protein family 1  28 
 
 		 457 aa  55.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.363745 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34420  putative binding protein component of ABC maltose/mannitol transporter  24.19 
 
 		 436 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000870468  normal  0.425479 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4325  extracellular solute-binding protein family 1  24.24 
 
 		 454 aa  56.2  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1524  extracellular solute-binding protein family 1  22.54 
 
 		 439 aa  55.8  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0323  family 1 extracellular solute-binding protein  20.6 
 
 		 432 aa  55.5  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0091  ABC sorbitol/mannitol transporter, periplasmic binding protein  23.59 
 
 		 436 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.126585  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4930  extracellular solute-binding protein family 1  27.14 
 
 		 419 aa  55.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.265943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  22.88 
 
 		 399 aa  55.5  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1604  extracellular solute-binding protein  21.52 
 
 		 425 aa  55.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1727  extracellular solute-binding protein  23.59 
 
 		 436 aa  55.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0940  extracellular solute-binding protein family 1  25.36 
 
 		 441 aa  55.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.558741 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0361  extracellular solute-binding protein  26.12 
 
 		 444 aa  54.7  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.678366  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1371  extracellular solute-binding protein family 1  23.43 
 
 		 438 aa  54.3  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0152  putative sugar-binding protein  26.22 
 
 		 436 aa  54.3  0.000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3128  extracellular solute-binding protein family 1  25.91 
 
 		 450 aa  54.3  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0477771 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3566  extracellular solute-binding protein family 1  29.61 
 
 		 426 aa  54.7  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2950  extracellular solute-binding protein  23.94 
 
 		 435 aa  53.9  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.110397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1681  extracellular solute-binding protein  24.13 
 
 		 436 aa  53.9  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.901925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3459  extracellular solute-binding protein family 1  33.59 
 
 		 458 aa  53.9  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.725469  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1454  extracellular solute-binding protein family 1  22.95 
 
 		 445 aa  53.9  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  24.25 
 
 		 411 aa  53.5  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2463  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 437 aa  53.5  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3450  extracellular solute-binding protein family 1  24.66 
 
 		 436 aa  53.1  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3838  extracellular solute-binding protein  28.93 
 
 		 420 aa  52.8  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.754768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04610  extracellular solute-binding protein family 1  20.78 
 
 		 431 aa  53.1  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  28.9 
 
 		 420 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  24.07 
 
 		 366 aa  53.1  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  25.47 
 
 		 410 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>