More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0837 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0837  inner-membrane translocator  100 
 
 		 359 aa  682    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0271  inner-membrane translocator  76.22 
 
 		 353 aa  478  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0872978  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0768  ABC transporter permease protein  73.12 
 
 		 365 aa  425  1e-118  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.868175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4621  putative ABC transporter (permease protein)  58.95 
 
 		 369 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4475  inner-membrane translocator  57.28 
 
 		 375 aa  333  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.973671 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5657  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  58.73 
 
 		 392 aa  330  3e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.348277  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6456  inner-membrane translocator  56.4 
 
 		 375 aa  324  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.425632  normal  0.0359026 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1168  inner-membrane translocator  58.9 
 
 		 369 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.748447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1369  ABC transporter, inner membrane subunit  61.87 
 
 		 371 aa  305  7e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.30886  normal  0.0719579 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5242  inner-membrane translocator  61.74 
 
 		 371 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1359  ABC transporter, permease protein  58.51 
 
 		 370 aa  292  5e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0852  inner-membrane translocator  51.37 
 
 		 362 aa  282  5.000000000000001e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1116  inner-membrane translocator  53.17 
 
 		 382 aa  281  2e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3025  inner-membrane translocator  57.28 
 
 		 370 aa  279  4e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1702  inner-membrane translocator  52.89 
 
 		 385 aa  225  7e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.122598 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2021  inner-membrane translocator  52.89 
 
 		 385 aa  225  1e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1951  inner-membrane translocator  35.98 
 
 		 373 aa  177  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563372 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1458  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 358 aa  155  1e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0138  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.42 
 
 		 360 aa  154  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.619056  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1120  inner-membrane translocator  34.38 
 
 		 363 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3027  inner-membrane translocator  34.74 
 
 		 357 aa  153  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.722972 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1508  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.98 
 
 		 355 aa  151  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143335  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3165  inner-membrane translocator  32.74 
 
 		 351 aa  151  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.786716  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3691  inner-membrane translocator  32.63 
 
 		 338 aa  150  5e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  31.56 
 
 		 364 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0215  inner-membrane translocator  31.4 
 
 		 355 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.900459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2499  inner-membrane translocator  32.94 
 
 		 369 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.958191  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1792  inner-membrane translocator  32.51 
 
 		 352 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00867144  normal  0.323274 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0796  inner-membrane translocator  32.65 
 
 		 364 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.511311  normal  0.608951 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0422  inner-membrane translocator  28.77 
 
 		 391 aa  145  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.975365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  31.32 
 
 		 352 aa  144  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1632  inner-membrane translocator  31.45 
 
 		 371 aa  144  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0495  inner-membrane translocator  31.6 
 
 		 360 aa  143  4e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0472757 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5273  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  35.6 
 
 		 349 aa  143  5e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3558  ABC transporter, inner membrane subunit  31.27 
 
 		 360 aa  143  5e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.31458  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1787  inner-membrane translocator  29.51 
 
 		 354 aa  143  5e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1148  inner-membrane translocator  29.51 
 
 		 354 aa  143  5e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1987  inner-membrane translocator  35.37 
 
 		 347 aa  143  6e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.426969 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3241  inner-membrane translocator  31.27 
 
 		 360 aa  142  6e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.366513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  28.88 
 
 		 365 aa  142  8e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4443  inner-membrane translocator  34.09 
 
 		 363 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1780  inner-membrane translocator  28.69 
 
 		 357 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1977  inner-membrane translocator  33.72 
 
 		 369 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0018  inner-membrane translocator  28.74 
 
 		 344 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2377  inner-membrane translocator  34.14 
 
 		 369 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.583933  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2174  transmembrane ABC transporter protein  35.86 
 
 		 369 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725821  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0569  ABC transporter, permease protein  32.32 
 
 		 360 aa  139  7.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3631  inner-membrane translocator  31.76 
 
 		 361 aa  139  8.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2962  putative ABC type branched chain amino acid transport system  32.44 
 
 		 361 aa  139  8.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.234681 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1417  inner-membrane translocator  28.74 
 
 		 364 aa  138  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.017685  normal  0.100323 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3944  hypothetical protein  31.27 
 
 		 360 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.121867  normal  0.592217 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1319  inner-membrane translocator  31.43 
 
 		 371 aa  138  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0343  putative ABC sugar transporter, inner membrane subunit  34.73 
 
 		 347 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0750  inner-membrane translocator  28.41 
 
 		 362 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00540188  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5056  inner-membrane translocator  35.71 
 
 		 363 aa  137  4e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0804  putative transmembrane ABC transporter protein  33.43 
 
 		 387 aa  136  7.000000000000001e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0008  ABC transporter, permease protein, putative  33.44 
 
 		 359 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451732  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1119  inner-membrane translocator  37.07 
 
 		 364 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.582837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3236  inner-membrane translocator  33.78 
 
 		 354 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3307  inner-membrane translocator  33.46 
 
 		 347 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1946  permease component of branched-chain amino acid transport system  33.22 
 
 		 349 aa  134  3e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.251355  hitchhiker  0.000358209 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0843  inner-membrane translocator  28.24 
 
 		 344 aa  133  6e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1037  inner-membrane translocator  34.04 
 
 		 360 aa  133  6e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.175409  normal  0.785488 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0820  inner-membrane translocator  28.24 
 
 		 344 aa  133  6e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1901  inner-membrane translocator  31.23 
 
 		 361 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.415582  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3902  inner-membrane translocator  32.36 
 
 		 383 aa  132  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0672  inner-membrane translocator  31.29 
 
 		 366 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3052  inner-membrane translocator  29.46 
 
 		 442 aa  131  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6357  inner-membrane translocator  34.56 
 
 		 349 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15152  normal  0.206957 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0680  inner-membrane translocator  32.42 
 
 		 368 aa  130  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00660304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1692  inner-membrane translocator  29.59 
 
 		 367 aa  130  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.108076  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1926  inner-membrane translocator  32.71 
 
 		 354 aa  130  3e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0125222 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0768  ABC transporter, permease protein, putative  31.63 
 
 		 366 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0534  ABC transporter, permease protein  31.45 
 
 		 358 aa  130  4.0000000000000003e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1408  inner-membrane translocator  24.33 
 
 		 359 aa  129  6e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0027167  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04910  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  33 
 
 		 471 aa  129  6e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0953  inner-membrane translocator  34.69 
 
 		 347 aa  129  6e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.267238  normal  0.301742 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1717  inner-membrane translocator  31.36 
 
 		 361 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.318895  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6178  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 349 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00223379  normal  0.248312 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0505  inner-membrane translocator  29.1 
 
 		 363 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1699  inner-membrane translocator  36.93 
 
 		 363 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0601171 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2059  ABC transporter permease  32.14 
 
 		 363 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.271425 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2786  inner-membrane translocator  36.15 
 
 		 349 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.569125  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2018  inner-membrane translocator  36.39 
 
 		 363 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.345381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2146  inner-membrane translocator  37.42 
 
 		 362 aa  127  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.387266  normal  0.486606 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1302  inner-membrane translocator  33.1 
 
 		 347 aa  127  3e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2167  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  30 
 
 		 367 aa  127  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203557  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1447  inner-membrane translocator  30.33 
 
 		 338 aa  124  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.375364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1764  inner-membrane translocator  34.21 
 
 		 356 aa  123  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.382109  normal  0.473467 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0005  putative ABC transporter, permease protein  31.27 
 
 		 336 aa  123  6e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.226328  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1904  inner-membrane translocator  34.86 
 
 		 364 aa  122  7e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.246976  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1678  inner-membrane translocator  29.59 
 
 		 365 aa  122  8e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1133  inner-membrane translocator  33.14 
 
 		 359 aa  122  8e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.458901 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1290  inner-membrane translocator  30.98 
 
 		 350 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.79178  normal  0.901092 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2136  inner-membrane translocator  34.88 
 
 		 368 aa  122  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334815  normal  0.348757 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0031  inner-membrane translocator  32.52 
 
 		 357 aa  122  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3577  inner-membrane translocator  32.45 
 
 		 360 aa  122  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2844  integral inner-membrane protein  27.58 
 
 		 372 aa  122  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.746022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1925  inner-membrane translocator  30 
 
 		 355 aa  121  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.633833  normal  0.690286 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3177  inner-membrane translocator  28.99 
 
 		 358 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.290387  normal  0.329303 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>