More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0351 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0351  inner-membrane translocator  100 
 
 		 353 aa  685    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4450  branched chain amino acid ABC transporter permease  51.76 
 
 		 351 aa  247  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0565603 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3204  branched chain amino acid ABC transporter permease  37.96 
 
 		 354 aa  195  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.975304 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3018  inner-membrane translocator  38.1 
 
 		 350 aa  182  7e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.322534 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1562  inner-membrane translocator  41.11 
 
 		 368 aa  181  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5757  inner-membrane translocator  37.99 
 
 		 356 aa  171  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4290  inner-membrane translocator  35.93 
 
 		 357 aa  162  9e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00962699 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2665  inner-membrane translocator  35.83 
 
 		 354 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132153  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3320  inner-membrane translocator  39.09 
 
 		 348 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4183  inner-membrane translocator  38.68 
 
 		 358 aa  149  7e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.708738  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0807  inner-membrane translocator  39.27 
 
 		 352 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1046  inner-membrane translocator  34.83 
 
 		 352 aa  133  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1821  inner-membrane translocator  29.97 
 
 		 382 aa  132  6e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0943  inner-membrane translocator  34.84 
 
 		 351 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4151  inner-membrane translocator  32.84 
 
 		 375 aa  125  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1445  urea ABC transporter, permease protein UrtC  33.43 
 
 		 384 aa  124  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808643 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4363  inner-membrane translocator  30.94 
 
 		 372 aa  123  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.283933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19171  putative membrane protein of urea ABC transport system  28.74 
 
 		 375 aa  120  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.514587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5697  ABC transporter related  33 
 
 		 585 aa  119  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.435877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1308  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  32.12 
 
 		 620 aa  119  9e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.832531  normal  0.97267 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0054  ABC transporter related  32.9 
 
 		 604 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1868  urea ABC transporter, permease protein UrtC  33.05 
 
 		 389 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.514988  normal  0.284901 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2191  urea ABC transporter, permease protein UrtC  33.33 
 
 		 388 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.304741  normal  0.131499 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3819  inner-membrane translocator  35.44 
 
 		 362 aa  116  5e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2304  inner-membrane translocator  30.45 
 
 		 329 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0950  inner-membrane translocator  29.64 
 
 		 377 aa  115  7.999999999999999e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1046  putative membrane protein of urea ABC transport system  28.48 
 
 		 371 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.812032  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1754  ABC transporter related  32.11 
 
 		 621 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3820  inner-membrane translocator  32.8 
 
 		 328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0270491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1839  inner-membrane translocator  32.39 
 
 		 350 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6650  ABC transporter related  31.21 
 
 		 585 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154818  normal  0.0508518 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2864  urea ABC transporter, permease protein UrtC  30.25 
 
 		 385 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2744  urea ABC transporter, permease protein UrtC  31.65 
 
 		 358 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4607  urea ABC transporter, permease protein UrtC  32.19 
 
 		 381 aa  113  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4010  urea ABC transporter, permease protein UrtC  29.44 
 
 		 405 aa  113  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3491  ABC transporter membrane spanning protein (urea/amide)  32.63 
 
 		 386 aa  113  6e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1101  urea ABC transporter, permease protein UrtC  30.77 
 
 		 383 aa  112  8.000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2258  urea ABC transporter, permease protein UrtC  29.64 
 
 		 398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0547  inner-membrane translocator  35.36 
 
 		 337 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1679  inner-membrane translocator  31.4 
 
 		 317 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2618  putative membrane protein of urea ABC transport system  28.17 
 
 		 382 aa  111  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0303421  normal  0.395432 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4103  ABC transporter related  32.06 
 
 		 582 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0128  inner-membrane translocator  29.5 
 
 		 393 aa  110  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0235015 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3700  inner-membrane translocator  31.07 
 
 		 389 aa  110  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.845497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4227  urea ABC transporter, permease protein UrtC  29.71 
 
 		 418 aa  110  5e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.338662  normal  0.246211 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7016  branched chain amino acid ABC transporter permease  30.86 
 
 		 387 aa  109  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.770663 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4189  urea ABC transporter, permease protein UrtC  31.11 
 
 		 391 aa  109  6e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5859  inner-membrane translocator  32.06 
 
 		 342 aa  109  6e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3133  inner-membrane translocator  32.86 
 
 		 322 aa  109  6e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08841  putative membrane protein of urea ABC transport system  28.57 
 
 		 376 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3933  urea ABC transporter, permease protein UrtC  30.59 
 
 		 414 aa  108  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  34.11 
 
 		 652 aa  108  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4428  inner-membrane translocator  31.56 
 
 		 359 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0588  inner-membrane translocator  31.87 
 
 		 359 aa  107  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.98768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2248  putative membrane protein of ABC transport system  30.45 
 
 		 375 aa  106  6e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0827  putative membrane protein of urea ABC transport system  27.67 
 
 		 376 aa  106  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.924507  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4887  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.25 
 
 		 359 aa  106  7e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.599919  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2988  ABC transporter inner-membrane translocator  30.99 
 
 		 390 aa  106  7e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.641521 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3508  inner-membrane translocator  30.77 
 
 		 397 aa  106  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0288069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08861  putative membrane protein of urea ABC transport system  28.44 
 
 		 376 aa  105  8e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1796  inner-membrane translocator  30.57 
 
 		 401 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0666603  normal  0.204182 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3685  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  30.56 
 
 		 393 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.145721 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2999  inner-membrane translocator  29.32 
 
 		 377 aa  105  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.336157  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2332  inner-membrane translocator  33.43 
 
 		 324 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.404854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4900  urea ABC transporter, permease protein UrtC  30.25 
 
 		 359 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153709 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1502  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.95 
 
 		 401 aa  104  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0256757  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0999  inner-membrane translocator  29 
 
 		 403 aa  105  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0212  inner-membrane translocator  31.61 
 
 		 337 aa  104  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2951  inner-membrane translocator  32.34 
 
 		 323 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0213557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2952  inner-membrane translocator  32.42 
 
 		 333 aa  104  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.211647 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2311  inner-membrane translocator  31.76 
 
 		 350 aa  104  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.90856  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2039  ABC transporter permease  33.92 
 
 		 396 aa  104  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.995222  normal  0.266776 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6328  inner-membrane translocator  31.58 
 
 		 320 aa  103  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540674  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3531  inner-membrane translocator  30.45 
 
 		 340 aa  104  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.696528 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3316  urea ABC transporter, permease protein UrtC  30.79 
 
 		 387 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.852064 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2697  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system  29.39 
 
 		 367 aa  104  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.611923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3379  inner-membrane translocator  30.06 
 
 		 367 aa  103  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1990  inner-membrane translocator  30.96 
 
 		 357 aa  103  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.17029 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2618  urea ABC transporter, permease protein UrtC  31.66 
 
 		 382 aa  103  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0436574 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2025  inner-membrane translocator  34.38 
 
 		 339 aa  103  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5902  ABC transporter related  29.55 
 
 		 616 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.656172  normal  0.17892 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4635  urea ABC transporter, permease protein UrtC  30.25 
 
 		 359 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0860819 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0952  urea ABC transporter, permease protein UrtC  30.06 
 
 		 394 aa  103  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2520  inner-membrane translocator  32.07 
 
 		 323 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3164  inner-membrane translocator  32.83 
 
 		 324 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.317947  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0617  inner-membrane translocator  33.66 
 
 		 339 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0657  inner-membrane translocator  33.66 
 
 		 339 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0733  ABC transporter related  32.18 
 
 		 597 aa  102  7e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0699  putative permease transporter transmembrane protein  29.08 
 
 		 378 aa  102  8e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0568286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2987  inner-membrane translocator  32.48 
 
 		 340 aa  102  8e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.465915  normal  0.488268 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3368  ABC transporter related  31.43 
 
 		 593 aa  102  8e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1407  inner-membrane translocator  32.37 
 
 		 332 aa  102  8e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.14353  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1019  ABC transporter related  32.04 
 
 		 594 aa  102  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4062  ABC transporter related  30.38 
 
 		 606 aa  102  9e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2301  inner-membrane translocator  33.02 
 
 		 328 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.281867 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1935  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  26.96 
 
 		 333 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1021  inner-membrane translocator  31.83 
 
 		 384 aa  102  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.744628  normal  0.313599 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1436  inner-membrane translocator  31.29 
 
 		 371 aa  101  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0228  ABC-type branched-chain amino acid transport system permease component-like  30.26 
 
 		 432 aa  101  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.836611 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1620  inner-membrane translocator  31.53 
 
 		 368 aa  101  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.779012 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>