More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2301 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2301  inner-membrane translocator  100 
 
 		 328 aa  635    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.281867 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3647  inner-membrane translocator  37.16 
 
 		 315 aa  183  3e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0606167  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4441  ABC transporter related  36.01 
 
 		 603 aa  181  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1582  inner-membrane translocator  37.04 
 
 		 313 aa  177  3e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1663  inner-membrane translocator  35.33 
 
 		 326 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1097  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.53 
 
 		 315 aa  173  3.9999999999999995e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.701299  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0851  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.62 
 
 		 333 aa  171  2e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.589569  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1618  ABC transporter related  37.02 
 
 		 616 aa  170  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.103337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5640  inner-membrane translocator  37.82 
 
 		 317 aa  168  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0908  inner-membrane translocator  38.41 
 
 		 338 aa  168  1e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.579851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1828  inner-membrane translocator  33.83 
 
 		 331 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000769607  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2128  inner-membrane translocator  36.42 
 
 		 344 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212047  normal  0.208516 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2587  inner-membrane translocator  36.45 
 
 		 317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.629922  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1100  inner-membrane translocator  35.62 
 
 		 343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0111942  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0337  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.11 
 
 		 609 aa  160  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0312  inner-membrane translocator  35.14 
 
 		 326 aa  161  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.950676  normal  0.481983 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3750  ABC transporter related  34.32 
 
 		 603 aa  160  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408417  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3820  inner-membrane translocator  35.35 
 
 		 328 aa  160  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0270491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0897  inner-membrane translocator  34.59 
 
 		 357 aa  159  6e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2886  putative ABC transporter permiase component  34.68 
 
 		 334 aa  158  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0441971 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3618  inner-membrane translocator  33.44 
 
 		 328 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.466346  normal  0.345258 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0115  inner-membrane translocator  34.13 
 
 		 325 aa  156  4e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1849  inner-membrane translocator  33.11 
 
 		 328 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.200349 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1679  inner-membrane translocator  35.92 
 
 		 317 aa  154  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1090  inner-membrane translocator  36.08 
 
 		 359 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.538994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0006  inner-membrane translocator  33.03 
 
 		 344 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.273042  hitchhiker  0.0000215345 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1708  inner-membrane translocator  34.11 
 
 		 348 aa  150  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.550604  normal  0.0112984 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2007  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.44 
 
 		 357 aa  149  5e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551976  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1950  inner-membrane translocator  32.44 
 
 		 328 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1564  inner-membrane translocator  37.88 
 
 		 339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0670  inner-membrane translocator  38.94 
 
 		 335 aa  147  3e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1480  inner-membrane translocator  34.13 
 
 		 407 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4071  inner-membrane translocator  36.57 
 
 		 327 aa  145  9e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2142  inner-membrane translocator  34.71 
 
 		 324 aa  144  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1929  inner-membrane translocator  39.22 
 
 		 318 aa  143  5e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.456236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1673  inner-membrane translocator  34.58 
 
 		 319 aa  142  6e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1532  inner-membrane translocator  31.97 
 
 		 368 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.378741  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1437  inner-membrane translocator  31.97 
 
 		 368 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1500  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 336 aa  140  3.9999999999999997e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.101712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2203  inner-membrane translocator  37.91 
 
 		 302 aa  139  7e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2365  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.11 
 
 		 339 aa  139  8.999999999999999e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.554509  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2283  inner-membrane translocator  32.27 
 
 		 318 aa  139  8.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0801  inner-membrane translocator  35.12 
 
 		 326 aa  137  3.0000000000000003e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.950338 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  33.87 
 
 		 652 aa  135  7.000000000000001e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3368  ABC transporter related  33.01 
 
 		 593 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3519  ABC transporter related  35 
 
 		 643 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.971696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4062  ABC transporter related  33.45 
 
 		 606 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1863  inner-membrane translocator  30.77 
 
 		 321 aa  133  5e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5395  inner-membrane translocator  32.39 
 
 		 463 aa  133  5e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1944  inner-membrane translocator  35.02 
 
 		 297 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3769  ABC transporter related  32.68 
 
 		 593 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.234407 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0143  inner-membrane translocator  34.01 
 
 		 311 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3708  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  34.96 
 
 		 646 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.400523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0366  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 310 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000392686  unclonable  0.0000000558621 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1453  inner-membrane translocator  31.97 
 
 		 366 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.230295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3103  inner-membrane translocator  34.84 
 
 		 354 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1395  inner-membrane translocator  35.38 
 
 		 293 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.7 
 
 		 307 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1906  inner-membrane translocator  34.9 
 
 		 326 aa  129  6e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.257462 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0913  ABC transporter related  34.15 
 
 		 646 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3027  inner-membrane translocator  30.84 
 
 		 393 aa  129  8.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.56847  normal  0.739943 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2167  inner-membrane translocator  35.53 
 
 		 325 aa  129  8.000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0261  inner-membrane translocator  31.75 
 
 		 324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1750  inner-membrane translocator  31.85 
 
 		 452 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.40589  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1319  inner-membrane translocator  35.48 
 
 		 372 aa  128  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2609  inner-membrane translocator  34.8 
 
 		 415 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2128  inner-membrane translocator  32.87 
 
 		 337 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0343  inner-membrane translocator  33.76 
 
 		 470 aa  125  8.000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2363  inner-membrane translocator  35.61 
 
 		 325 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0322104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1836  ABC transporter related  34.01 
 
 		 648 aa  125  9e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0483035  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2082  inner-membrane translocator  30.89 
 
 		 456 aa  124  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0997  inner-membrane translocator  32.65 
 
 		 321 aa  125  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.915307  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1135  inner-membrane translocator  38.49 
 
 		 298 aa  125  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.433507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0361  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 333 aa  125  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6489  inner-membrane translocator  35.59 
 
 		 320 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.635062  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0065  inner-membrane translocator  36.43 
 
 		 282 aa  124  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.123483 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2426  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  32.7 
 
 		 368 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0221  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  35.25 
 
 		 328 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0863  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  35.44 
 
 		 334 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0562534  normal  0.217688 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1602  inner-membrane translocator  33.85 
 
 		 336 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.47347  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4764  inner-membrane translocator  35.1 
 
 		 308 aa  124  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.498502 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1407  inner-membrane translocator  31.53 
 
 		 332 aa  124  3e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.14353  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2395  inner-membrane translocator  34 
 
 		 407 aa  123  4e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1140  inner-membrane translocator  32.54 
 
 		 328 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.129861 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2111  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.12 
 
 		 298 aa  123  4e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3838  inner-membrane translocator  32.41 
 
 		 315 aa  123  5e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.242692  normal  0.204744 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3735  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.31 
 
 		 333 aa  123  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1990  inner-membrane translocator  31.95 
 
 		 315 aa  122  7e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.97086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1821  inner-membrane translocator  31.58 
 
 		 328 aa  122  8e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5993  putative branched-chain amino acid ABC transporter (permease protein)  32.59 
 
 		 323 aa  122  9e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.329288  normal  0.170989 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0835  inner-membrane translocator  31.09 
 
 		 335 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0400978  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3398  inner-membrane translocator  26.48 
 
 		 335 aa  122  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0288037 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1732  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.67 
 
 		 326 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  31.21 
 
 		 562 aa  121  1.9999999999999998e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4795  inner-membrane translocator  32.36 
 
 		 319 aa  120  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.341671  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4055  ABC transporter related  32.96 
 
 		 663 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0610  ABC transporter related  34.33 
 
 		 647 aa  120  4.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3840  inner-membrane translocator  33.43 
 
 		 349 aa  119  4.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0125888  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2271  inner-membrane translocator  34.07 
 
 		 297 aa  119  6e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.900398 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4091  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.9 
 
 		 309 aa  119  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.082194  normal  0.0443848 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>