More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1733 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1733  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 417 aa  777    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.14636  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4565  major facilitator transporter  51.02 
 
 		 392 aa  306  3e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.926259  normal  0.817996 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16310  putative MFS permease  39.16 
 
 		 413 aa  236  6e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1327  major facilitator transporter  39.76 
 
 		 413 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3847  major facilitator transporter  39.9 
 
 		 412 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4521  major facilitator transporter  39.9 
 
 		 412 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0504067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1403  major facilitator transporter  39.57 
 
 		 408 aa  207  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4133  major facilitator transporter  39.85 
 
 		 405 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.236743  normal  0.198961 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3974  major facilitator transporter  36.6 
 
 		 433 aa  147  5e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280222 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3559  major facilitator superfamily MFS_1  33.73 
 
 		 417 aa  147  5e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1721  major facilitator transporter  30.9 
 
 		 432 aa  117  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309946  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1148  major facilitator superfamily MFS_1  30.54 
 
 		 420 aa  105  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  24.86 
 
 		 440 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2516  major facilitator transporter  25.36 
 
 		 354 aa  63.5  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128628  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1722  major facilitator transporter  28.27 
 
 		 372 aa  63.2  0.000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.36396  normal  0.2591 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1482  major facilitator superfamily MFS_1  27.98 
 
 		 403 aa  62.4  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000899768  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1097  major facilitator transporter  27.89 
 
 		 394 aa  62.4  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1810  putative major facilitator superfamily transport protein  25.86 
 
 		 390 aa  60.8  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.521814  normal  0.460294 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4405  major facilitator transporter  25.41 
 
 		 421 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1708  major facilitator transporter  25.69 
 
 		 423 aa  60.8  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.841617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1729  major facilitator transporter  25.69 
 
 		 423 aa  60.8  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1776  major facilitator superfamily transporter  25.69 
 
 		 423 aa  60.8  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1613  major facilitator transporter  28.44 
 
 		 388 aa  57.8  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0273655 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2305  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.41 
 
 		 613 aa  57  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10798  multi-drug resistance integral membrane efflux protein emrB  34.78 
 
 		 540 aa  56.6  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0849  sugar transporter  27.07 
 
 		 472 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2988  arabinose-proton symporter  27.07 
 
 		 472 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.993393  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3162  arabinose-proton symporter  27.07 
 
 		 472 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.839771  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8779  putative transport protein  30.72 
 
 		 481 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3021  arabinose-proton symporter  27.07 
 
 		 472 aa  55.8  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02689  arabinose transporter  27.07 
 
 		 472 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 		 435 aa  55.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0603  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.31 
 
 		 498 aa  55.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1653  major facilitator superfamily MFS_1  26 
 
 		 392 aa  55.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0146262  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02650  hypothetical protein  27.07 
 
 		 472 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1344  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 439 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1384  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 439 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2989  arabinose-proton symporter  27.07 
 
 		 472 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0609314 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0874  sugar transporter  27.07 
 
 		 472 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  30.83 
 
 		 440 aa  54.7  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2967  major facilitator transporter  28.44 
 
 		 378 aa  54.7  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1950  major facilitator transporter  24.84 
 
 		 461 aa  54.7  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6242  major facilitator superfamily MFS_1  33 
 
 		 439 aa  54.7  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  34.31 
 
 		 439 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  34.31 
 
 		 439 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  34.31 
 
 		 439 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17950  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.93 
 
 		 521 aa  54.7  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0956578  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2256  major facilitator superfamily MFS_1  23.89 
 
 		 504 aa  54.3  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6468  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.3 
 
 		 534 aa  54.3  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  26.3 
 
 		 426 aa  53.9  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1833  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.72 
 
 		 564 aa  53.9  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0281974  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4110  arabinose-proton symporter  26.64 
 
 		 472 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000412167 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6143  major facilitator transporter  30.83 
 
 		 437 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.645469  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3304  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  24.62 
 
 		 412 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0252324 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  33.05 
 
 		 439 aa  53.5  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04650  arabinose efflux permease family protein  26.9 
 
 		 405 aa  53.1  0.000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2718  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.94 
 
 		 467 aa  53.1  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.815638  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1772  major facilitator transporter  32.1 
 
 		 456 aa  53.1  0.000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2055  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  26.62 
 
 		 401 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.205311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  31.62 
 
 		 436 aa  53.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4092  major facilitator superfamily MFS_1  28.62 
 
 		 396 aa  53.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.156772 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1846  major facilitator transporter  26.75 
 
 		 388 aa  52.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0275429  normal  0.697868 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3490  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 		 521 aa  52.8  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0312462 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2353  major facilitator transporter  24.02 
 
 		 529 aa  53.1  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.62279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0175  major facilitator transporter  27.33 
 
 		 402 aa  52  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0673  major facilitator transporter  29.44 
 
 		 481 aa  52  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0290  major facilitator superfamily MFS_1  32.5 
 
 		 535 aa  52  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.344355 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0033  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.69 
 
 		 541 aa  52.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1745  RemN protein  26.9 
 
 		 582 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5160  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.61 
 
 		 509 aa  51.2  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3885  major facilitator superfamily MFS_1  32.5 
 
 		 403 aa  51.2  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.37466  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1035  major facilitator transporter  31.25 
 
 		 456 aa  51.6  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.46638  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0842  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.06 
 
 		 493 aa  51.2  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2158  major facilitator superfamily transporter  30.13 
 
 		 513 aa  51.6  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.139146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2421  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.62 
 
 		 416 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.300177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0227  major facilitator superfamily MFS_1  24.05 
 
 		 390 aa  51.2  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000142544  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2493  major facilitator transporter  31.91 
 
 		 420 aa  50.8  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.995351  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3254  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.56 
 
 		 579 aa  51.2  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0974  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.79 
 
 		 534 aa  50.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760021 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0909  major facilitator transporter  32.5 
 
 		 456 aa  50.4  0.00005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.672072 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1058  major facilitator transporter  30.94 
 
 		 471 aa  50.4  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.111803  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0196  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.27 
 
 		 532 aa  50.8  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.904476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3897  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.01 
 
 		 518 aa  50.4  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0429353 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1274  major facilitator superfamily MFS_1  26.07 
 
 		 517 aa  50.4  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131373  normal  0.0158431 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.86 
 
 		 506 aa  50.4  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3184  L-arabinose/proton symport protein  25.75 
 
 		 472 aa  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1972  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.63 
 
 		 510 aa  50.1  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073103  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1086  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.79 
 
 		 531 aa  50.1  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.970713  normal  0.875398 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  27.82 
 
 		 426 aa  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3247  L-arabinose/proton symport protein  25.75 
 
 		 472 aa  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138124 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3232  L-arabinose/proton symport protein  25.75 
 
 		 472 aa  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852071  hitchhiker  0.0000142975 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3166  L-arabinose/proton symport protein  25.75 
 
 		 472 aa  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3348  L-arabinose/proton symport protein  25.75 
 
 		 472 aa  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2113  major facilitator transporter  24.24 
 
 		 509 aa  50.1  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117023  decreased coverage  0.00370364 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.63 
 
 		 534 aa  50.1  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3294  sugar transporter  26.73 
 
 		 471 aa  50.1  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.534261 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6465  transporter  28.67 
 
 		 484 aa  50.1  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.265131  normal  0.0861324 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0726  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.63 
 
 		 527 aa  49.7  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2096  multidrug resistance protein  27.63 
 
 		 528 aa  49.7  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000633213  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1831  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.63 
 
 		 527 aa  49.7  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>