89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3559 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3559  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 417 aa  793    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3974  major facilitator transporter  53.57 
 
 		 433 aa  326  6e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280222 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1148  major facilitator superfamily MFS_1  51.32 
 
 		 420 aa  305  7e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1721  major facilitator transporter  36.83 
 
 		 432 aa  208  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309946  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16310  putative MFS permease  34.14 
 
 		 413 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1327  major facilitator transporter  35.42 
 
 		 413 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1733  major facilitator superfamily MFS_1  34.17 
 
 		 417 aa  140  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.14636  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3847  major facilitator transporter  34.79 
 
 		 412 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4521  major facilitator transporter  34.79 
 
 		 412 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0504067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4565  major facilitator transporter  36.01 
 
 		 392 aa  135  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.926259  normal  0.817996 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1403  major facilitator transporter  34.42 
 
 		 408 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4133  major facilitator transporter  34.32 
 
 		 405 aa  106  8e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.236743  normal  0.198961 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3381  major facilitator transporter  36.36 
 
 		 466 aa  62  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1846  major facilitator transporter  31.06 
 
 		 388 aa  61.6  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0275429  normal  0.697868 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.33 
 
 		 540 aa  56.6  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2468  major facilitator transporter  24.65 
 
 		 409 aa  56.2  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.68 
 
 		 478 aa  55.1  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497094  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1386  major facilitator transporter  23.59 
 
 		 394 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1589  major facilitator superfamily MFS_1  24.3 
 
 		 389 aa  52  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000189981  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3400  major facilitator superfamily MFS_1  24.8 
 
 		 404 aa  51.6  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0381  major facilitator transporter  35.92 
 
 		 414 aa  51.6  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6826  major facilitator transporter  28.72 
 
 		 523 aa  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2873  major facilitator superfamily MFS_1  24.15 
 
 		 389 aa  51.2  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00211826  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.68 
 
 		 468 aa  50.8  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4203  major facilitator transporter  31.58 
 
 		 506 aa  50.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.318181  normal  0.987085 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1613  major facilitator transporter  29.06 
 
 		 388 aa  50.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0273655 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  24.88 
 
 		 440 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5384  major facilitator transporter  25.79 
 
 		 409 aa  50.4  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2676  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.62 
 
 		 407 aa  50.4  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4552  putative transmembrane efflux protein  33.74 
 
 		 454 aa  50.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.739035  normal  0.395452 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4231  major facilitator superfamily MFS_1  35.54 
 
 		 415 aa  50.1  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0431  major facilitator transporter  24.15 
 
 		 440 aa  49.7  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000529382  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2967  major facilitator transporter  31.76 
 
 		 378 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  33.03 
 
 		 511 aa  49.7  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4030  DNA-cytosine methyltransferase  30.15 
 
 		 455 aa  49.3  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3647  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.9 
 
 		 486 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.04243 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4799  major facilitator transporter  25.55 
 
 		 405 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.896954  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7272  major facilitator transporter  25.54 
 
 		 437 aa  48.9  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1722  major facilitator transporter  27.16 
 
 		 372 aa  48.9  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.36396  normal  0.2591 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1257  major facilitator transporter  32.5 
 
 		 454 aa  48.5  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.281321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3243  major facilitator transporter  27.41 
 
 		 448 aa  47.8  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.12624 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05284  hypothetical protein  24.8 
 
 		 404 aa  47.8  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2370  major facilitator superfamily MFS_1  27.1 
 
 		 474 aa  47.4  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3490  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.9 
 
 		 521 aa  47.8  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0312462 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.83 
 
 		 527 aa  47  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1546  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.88 
 
 		 411 aa  47  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1017  major facilitator superfamily MFS_1  26.95 
 
 		 525 aa  47  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04650  arabinose efflux permease family protein  24.68 
 
 		 405 aa  47  0.0007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.84 
 
 		 478 aa  47  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2692  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.74 
 
 		 411 aa  46.6  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4585  major facilitator transporter  24.48 
 
 		 429 aa  46.6  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.282305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  25.85 
 
 		 435 aa  46.6  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1916  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.56 
 
 		 478 aa  45.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0782092  hitchhiker  0.00395657 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1579  major facilitator superfamily MFS_1  24.6 
 
 		 439 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0385849  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3204  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.77 
 
 		 538 aa  46.2  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  25.17 
 
 		 520 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3322  major facilitator transporter  27.08 
 
 		 408 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0892776 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11276  drug-transport integral membrane protein  38.61 
 
 		 579 aa  46.2  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.201451 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6060  Bcr/CflA family drug resistance transporter  27.97 
 
 		 414 aa  46.2  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3344  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.74 
 
 		 411 aa  46.6  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0616341 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1823  major facilitator superfamily MFS_1  25.14 
 
 		 397 aa  45.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.536913 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2707  major facilitator superfamily MFS_1  24.85 
 
 		 472 aa  45.1  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1251  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  28.85 
 
 		 503 aa  45.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157132  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2780  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.95 
 
 		 399 aa  45.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.118826 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0389  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.67 
 
 		 409 aa  45.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.100227 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2676  major facilitator transporter  24.33 
 
 		 418 aa  45.1  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4607  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.82 
 
 		 522 aa  44.7  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.67 
 
 		 505 aa  44.7  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0360  major facilitator superfamily MFS_1  27.03 
 
 		 413 aa  44.7  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1898  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 424 aa  44.7  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.164459  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.76 
 
 		 545 aa  44.3  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3502  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.57 
 
 		 474 aa  44.3  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4834  major facilitator transporter  36.67 
 
 		 411 aa  43.9  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.891818 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3651  major facilitator transporter  29.8 
 
 		 517 aa  44.3  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7424  major facilitator superfamily MFS_1  37.38 
 
 		 494 aa  43.9  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1765  major facilitator transporter  24.09 
 
 		 471 aa  43.9  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.719018  decreased coverage  0.000452829 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.45 
 
 		 405 aa  43.9  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0907  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 477 aa  43.9  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0239598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.82 
 
 		 646 aa  43.9  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4044  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.82 
 
 		 646 aa  43.9  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.4 
 
 		 478 aa  43.5  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3292  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.47 
 
 		 430 aa  43.5  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1765  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.45 
 
 		 413 aa  43.5  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.236916  hitchhiker  0.00655505 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1498  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  33.92 
 
 		 481 aa  43.5  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0323  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.3 
 
 		 525 aa  43.5  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.853677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3984  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.07 
 
 		 646 aa  43.1  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086459  normal  0.10455 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6469  benzoate transport  29.24 
 
 		 460 aa  43.1  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.22 
 
 		 564 aa  42.7  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2158  major facilitator superfamily transporter  33.75 
 
 		 513 aa  43.1  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.139146  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>