58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1613 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2967  major facilitator transporter  99.21 
 
 		 378 aa  700    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1613  major facilitator transporter  100 
 
 		 388 aa  728    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0273655 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1846  major facilitator transporter  83.76 
 
 		 388 aa  569  1e-161  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0275429  normal  0.697868 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1810  putative major facilitator superfamily transport protein  51.25 
 
 		 390 aa  276  6e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.521814  normal  0.460294 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1097  major facilitator transporter  46.53 
 
 		 394 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1722  major facilitator transporter  38.31 
 
 		 372 aa  168  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.36396  normal  0.2591 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0175  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 402 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16310  putative MFS permease  33.63 
 
 		 413 aa  72.8  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1403  major facilitator transporter  35.22 
 
 		 408 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4565  major facilitator transporter  31.39 
 
 		 392 aa  61.6  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.926259  normal  0.817996 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3974  major facilitator transporter  27.05 
 
 		 433 aa  62  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280222 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4521  major facilitator transporter  33.16 
 
 		 412 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0504067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3847  major facilitator transporter  33.16 
 
 		 412 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1327  major facilitator transporter  31.63 
 
 		 413 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1721  major facilitator transporter  26.2 
 
 		 432 aa  60.1  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309946  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0744  major facilitator transporter  27.65 
 
 		 433 aa  57.4  0.0000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0364296  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1378  multidrug resistance efflux transporter, putative  26.26 
 
 		 433 aa  55.1  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.993613  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1567  multidrug resistance efflux transporter, putative  26.26 
 
 		 433 aa  55.1  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3559  major facilitator superfamily MFS_1  35.29 
 
 		 417 aa  53.9  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0274  multidrug ABC transporter  26.71 
 
 		 433 aa  52.4  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.351648  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1733  major facilitator superfamily MFS_1  26.98 
 
 		 417 aa  50.4  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.14636  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2570  YD repeat-containing protein  29.63 
 
 		 1565 aa  48.9  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.332337  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2577  YD repeat-containing protein  29.63 
 
 		 1565 aa  48.9  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.328115  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0097  major facilitator superfamily MFS_1  32.61 
 
 		 516 aa  48.9  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3785  major facilitator superfamily MFS_1  28.24 
 
 		 462 aa  48.9  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.664159  normal  0.0826493 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0350  major facilitator superfamily MFS_1  29.92 
 
 		 520 aa  47.4  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.976424  normal  0.915508 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0171  drug resistance transporter,putative, EmrB/QacA subfamily  29.92 
 
 		 534 aa  47.8  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.966244  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3242  major facilitator superfamily MFS_1  34.78 
 
 		 539 aa  46.6  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00325514  normal  0.76951 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0010  multidrug-efflux transporter  26.16 
 
 		 430 aa  46.6  0.0008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1251  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  26.16 
 
 		 503 aa  45.8  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157132  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1085  major facilitator transporter  26.37 
 
 		 454 aa  46.2  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  0.00000502867 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3560  major facilitator transporter  27.43 
 
 		 411 aa  45.8  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0284  hypothetical protein  29.89 
 
 		 391 aa  46.2  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1660  major facilitator superfamily transporter  29.75 
 
 		 510 aa  46.2  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.46395  normal  0.926796 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0410  multidrug-efflux transporter  25.16 
 
 		 433 aa  45.4  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0184  multidrug-efflux transporter  25.47 
 
 		 430 aa  45.4  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000154899  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3274  major facilitator superfamily MFS_1  26.43 
 
 		 454 aa  45.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4418  major facilitator transporter  32.19 
 
 		 407 aa  45.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.39928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4133  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 405 aa  45.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.236743  normal  0.198961 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0818  major facilitator transporter  30.22 
 
 		 429 aa  45.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  24.26 
 
 		 520 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1810  major facilitator superfamily MFS_1  31.03 
 
 		 491 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.174923  hitchhiker  0.00284389 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8779  putative transport protein  33.59 
 
 		 481 aa  44.3  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0366  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.37 
 
 		 461 aa  44.3  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0742092  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4881  major facilitator superfamily MFS_1  31.51 
 
 		 389 aa  44.3  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.164966  normal  0.758142 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1037  major facilitator superfamily MFS_1  25.99 
 
 		 454 aa  43.9  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64750  putative MFS transporter  31.95 
 
 		 446 aa  43.5  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3103  major facilitator transporter  26.11 
 
 		 454 aa  43.5  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.973708  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0245  putative permease  31.86 
 
 		 449 aa  43.5  0.006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0461827  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4927  major facilitator superfamily MFS_1  31.51 
 
 		 389 aa  43.5  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.185526 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4667  major facilitator transporter  34.78 
 
 		 433 aa  43.5  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.207376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3246  major facilitator transporter  26.11 
 
 		 454 aa  43.5  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3066  major facilitator transporter  26.11 
 
 		 456 aa  43.5  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0932  major facilitator transporter  29.28 
 
 		 426 aa  43.5  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0381  major facilitator transporter  30.14 
 
 		 414 aa  43.5  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46251  predicted protein  29.74 
 
 		 564 aa  43.1  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.164515  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1788  major facilitator transporter  34.45 
 
 		 433 aa  43.1  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.158886  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0977  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 503 aa  42.7  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132044 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>