16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1097 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1097  major facilitator transporter  100 
 
 		 394 aa  760    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1810  putative major facilitator superfamily transport protein  54.74 
 
 		 390 aa  354  2e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.521814  normal  0.460294 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2967  major facilitator transporter  46.49 
 
 		 378 aa  246  6e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1613  major facilitator transporter  46.27 
 
 		 388 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0273655 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1846  major facilitator transporter  45.78 
 
 		 388 aa  234  3e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0275429  normal  0.697868 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0175  major facilitator transporter  35.9 
 
 		 402 aa  185  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1722  major facilitator transporter  35.29 
 
 		 372 aa  139  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.36396  normal  0.2591 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4565  major facilitator transporter  41.5 
 
 		 392 aa  73.6  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.926259  normal  0.817996 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16310  putative MFS permease  35.71 
 
 		 413 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1403  major facilitator transporter  36.3 
 
 		 408 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3974  major facilitator transporter  27.81 
 
 		 433 aa  63.2  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280222 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1733  major facilitator superfamily MFS_1  25.57 
 
 		 417 aa  49.7  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.14636  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  28.19 
 
 		 399 aa  44.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  25.57 
 
 		 399 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  25.53 
 
 		 399 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3374  major facilitator superfamily MFS_1  26.15 
 
 		 398 aa  43.1  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000527195  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>