219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3974 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3974  major facilitator transporter  100 
 
 		 433 aa  811    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280222 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3559  major facilitator superfamily MFS_1  52.79 
 
 		 417 aa  324  2e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1148  major facilitator superfamily MFS_1  53.13 
 
 		 420 aa  302  9e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1721  major facilitator transporter  36.95 
 
 		 432 aa  203  5e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309946  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16310  putative MFS permease  35.32 
 
 		 413 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1733  major facilitator superfamily MFS_1  36.19 
 
 		 417 aa  139  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.14636  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4565  major facilitator transporter  37.1 
 
 		 392 aa  125  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.926259  normal  0.817996 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1403  major facilitator transporter  34.82 
 
 		 408 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3847  major facilitator transporter  34.32 
 
 		 412 aa  117  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4521  major facilitator transporter  34.32 
 
 		 412 aa  117  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0504067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1327  major facilitator transporter  33.06 
 
 		 413 aa  110  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4133  major facilitator transporter  31.98 
 
 		 405 aa  97.4  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.236743  normal  0.198961 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0175  major facilitator transporter  26.27 
 
 		 402 aa  67  0.0000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3785  major facilitator superfamily MFS_1  35.54 
 
 		 462 aa  65.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.664159  normal  0.0826493 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1097  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 394 aa  65.5  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.12 
 
 		 478 aa  62.8  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497094  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14760  sugar phosphate permease  37.96 
 
 		 493 aa  61.2  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.19609  normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1093  major facilitator superfamily MFS_1  27.21 
 
 		 406 aa  61.6  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0159699 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2900  hypothetical protein  24.67 
 
 		 399 aa  58.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0031  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.34 
 
 		 483 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.665432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1001  major facilitator transporter  27.82 
 
 		 470 aa  57.8  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.141392  normal  0.0130853 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1916  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.59 
 
 		 478 aa  57  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0782092  hitchhiker  0.00395657 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4231  major facilitator superfamily MFS_1  37.29 
 
 		 415 aa  56.6  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  25.13 
 
 		 448 aa  55.8  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3400  major facilitator superfamily MFS_1  25.63 
 
 		 404 aa  56.2  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0506  membrane transport protein  28.83 
 
 		 446 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.870522  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6917  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.07 
 
 		 463 aa  55.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1997  major facilitator superfamily permease  28.83 
 
 		 458 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4799  major facilitator transporter  25.19 
 
 		 405 aa  55.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.896954  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3166  major facilitator superfamily MFS_1  27.11 
 
 		 406 aa  54.7  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4569  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 		 433 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.0800324 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2967  major facilitator transporter  27.31 
 
 		 378 aa  55.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  25.71 
 
 		 386 aa  54.7  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3490  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.87 
 
 		 521 aa  55.1  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0312462 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4716  major facilitator superfamily MFS_1  24.66 
 
 		 433 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00719513 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  31.21 
 
 		 413 aa  54.7  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2753  hypothetical protein  25.16 
 
 		 399 aa  54.3  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1497  major facilitator transporter  30.49 
 
 		 391 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.449683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2831  putative membrane transport protein  28.22 
 
 		 485 aa  53.9  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.017692  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1560  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.94 
 
 		 401 aa  53.9  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2646  major facilitator transporter  29.39 
 
 		 401 aa  53.9  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.845364  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1767  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  21.15 
 
 		 397 aa  53.9  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2370  major facilitator superfamily MFS_1  22.5 
 
 		 474 aa  53.5  0.000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0250  major facilitator family transporter  29.39 
 
 		 401 aa  53.5  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.290023  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0940  major facilitator family transporter  29.39 
 
 		 401 aa  53.5  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.566015  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0579  major facilitator family transporter  28.22 
 
 		 446 aa  53.5  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.801725  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1433  major facilitator family transporter  29.39 
 
 		 401 aa  53.5  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1630  major facilitator family transporter  29.39 
 
 		 401 aa  53.5  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2092  membrane transport protein  28.22 
 
 		 446 aa  53.5  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2507  major facilitator transporter  29.39 
 
 		 401 aa  53.5  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0286  major facilitator family transporter  29.39 
 
 		 401 aa  53.5  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1644  major facilitator family transporter  28.22 
 
 		 446 aa  53.5  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1722  major facilitator transporter  28.48 
 
 		 372 aa  53.5  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.36396  normal  0.2591 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0691  major facilitator family transporter  28.22 
 
 		 458 aa  53.5  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.358679  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0769  putative sugar transporter  28.22 
 
 		 441 aa  53.1  0.000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  30.67 
 
 		 413 aa  53.1  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4199  major facilitator transporter  24.39 
 
 		 433 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.153637  normal  0.361901 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  28.08 
 
 		 435 aa  53.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0592  major facilitator superfamily MFS_1  26.26 
 
 		 383 aa  52  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179102 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1017  major facilitator superfamily MFS_1  23.08 
 
 		 525 aa  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  23.91 
 
 		 439 aa  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1460  major facilitator superfamily MFS_1  24.25 
 
 		 423 aa  52.4  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  28.24 
 
 		 440 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1613  major facilitator transporter  27.66 
 
 		 388 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0273655 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3502  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.73 
 
 		 474 aa  51.2  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0106  putative cyanate transporter  28.02 
 
 		 399 aa  51.2  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2135  major facilitator superfamily MFS_1  26.27 
 
 		 425 aa  51.2  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3852  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.96 
 
 		 407 aa  50.4  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.64308  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53780  MFS family transporter  27.82 
 
 		 415 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.033353  normal  0.109422 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  28.47 
 
 		 444 aa  50.4  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4707  MFS family transporter  27.82 
 
 		 415 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.759386  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2578  major facilitator superfamily transporter  27.09 
 
 		 426 aa  50.4  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0148068 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1846  major facilitator transporter  26.36 
 
 		 388 aa  50.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0275429  normal  0.697868 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  23.27 
 
 		 399 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1086  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30 
 
 		 531 aa  50.1  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.970713  normal  0.875398 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0381  major facilitator transporter  33.6 
 
 		 414 aa  49.7  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0526  major facilitator family transporter  29.34 
 
 		 503 aa  50.1  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3242  major facilitator superfamily MFS_1  29.37 
 
 		 401 aa  49.7  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.54 
 
 		 545 aa  49.7  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  25.83 
 
 		 381 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4936  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29 
 
 		 409 aa  49.3  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2999  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.14 
 
 		 408 aa  49.3  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.827266  normal  0.0320436 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  32.37 
 
 		 453 aa  49.3  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3004  major facilitator superfamily MFS_1  31.33 
 
 		 408 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.28 
 
 		 474 aa  48.5  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1459  major facilitator superfamily MFS_1  32.28 
 
 		 411 aa  48.9  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.135074  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.68 
 
 		 540 aa  48.9  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  27.71 
 
 		 403 aa  48.5  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0312  major facilitator transporter  27.82 
 
 		 473 aa  48.5  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  25.83 
 
 		 384 aa  48.9  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2151  major facilitator superfamily MFS_1  23.96 
 
 		 426 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.28 
 
 		 475 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1810  putative major facilitator superfamily transport protein  29.4 
 
 		 390 aa  48.1  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.521814  normal  0.460294 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0614  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.56 
 
 		 607 aa  48.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.87 
 
 		 502 aa  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1756  arabinose efflux permease  32.18 
 
 		 516 aa  48.1  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0038  major facilitator superfamily MFS_1  26.11 
 
 		 355 aa  47.8  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1042  putative membrane transport protein  27.43 
 
 		 498 aa  47.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.010302  normal  0.0110823 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4602  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 430 aa  47.8  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0544774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5135  major facilitator transporter  26.58 
 
 		 430 aa  47.4  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.668732  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>