More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1403 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1403  major facilitator transporter  100 
 
 		 408 aa  761    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16310  putative MFS permease  81.8 
 
 		 413 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1327  major facilitator transporter  63.68 
 
 		 413 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3847  major facilitator transporter  62.15 
 
 		 412 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4521  major facilitator transporter  62.15 
 
 		 412 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0504067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4133  major facilitator transporter  58.88 
 
 		 405 aa  333  4e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.236743  normal  0.198961 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4565  major facilitator transporter  45.9 
 
 		 392 aa  231  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.926259  normal  0.817996 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1733  major facilitator superfamily MFS_1  39.66 
 
 		 417 aa  212  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.14636  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3974  major facilitator transporter  35.93 
 
 		 433 aa  133  6.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280222 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3559  major facilitator superfamily MFS_1  34.41 
 
 		 417 aa  129  8.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1721  major facilitator transporter  31.41 
 
 		 432 aa  113  6e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309946  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1148  major facilitator superfamily MFS_1  31.99 
 
 		 420 aa  110  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0175  major facilitator transporter  26.29 
 
 		 402 aa  71.6  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1810  putative major facilitator superfamily transport protein  35.25 
 
 		 390 aa  70.9  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.521814  normal  0.460294 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2967  major facilitator transporter  31.84 
 
 		 378 aa  68.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.02 
 
 		 486 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.02 
 
 		 486 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.02 
 
 		 486 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1613  major facilitator transporter  32.05 
 
 		 388 aa  68.2  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0273655 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.02 
 
 		 486 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.02 
 
 		 486 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.02 
 
 		 486 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6215  major facilitator transporter  24.57 
 
 		 417 aa  67.4  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1514  major facilitator superfamily MFS_1  28.68 
 
 		 393 aa  67  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1274  major facilitator superfamily MFS_1  30.98 
 
 		 517 aa  66.6  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131373  normal  0.0158431 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1722  major facilitator transporter  29.72 
 
 		 372 aa  66.2  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.36396  normal  0.2591 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1846  major facilitator transporter  31.33 
 
 		 388 aa  64.7  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0275429  normal  0.697868 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1097  major facilitator transporter  36.3 
 
 		 394 aa  64.3  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8828  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.52 
 
 		 458 aa  62.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00337993  hitchhiker  0.00204639 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3851  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 		 505 aa  62  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3663  major facilitator transporter  27.74 
 
 		 512 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.691362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2392  major facilitator transporter  29.19 
 
 		 450 aa  62  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0592  major facilitator superfamily MFS_1  30.52 
 
 		 383 aa  60.8  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179102 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4378  major facilitator transporter  27.1 
 
 		 512 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0749958 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1015  major facilitator superfamily MFS_1  32.54 
 
 		 479 aa  60.5  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.449105 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  33.08 
 
 		 503 aa  60.1  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5330  major facilitator transporter  27.1 
 
 		 512 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.63801  normal  0.029348 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3411  major facilitator transporter  27.1 
 
 		 512 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154206  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4897  major facilitator transporter  27.1 
 
 		 512 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672511  normal  0.0228989 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4956  major facilitator transporter  27.1 
 
 		 512 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0729589 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0722  major facilitator transporter  27.1 
 
 		 512 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.103556  normal  0.139751 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.26 
 
 		 487 aa  60.1  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4425  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.33 
 
 		 788 aa  60.1  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0371338  normal  0.193177 
 
 
-
 
NC_002936  DET1502  major facilitator family protein  30.17 
 
 		 465 aa  59.7  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2353  major facilitator transporter  23.42 
 
 		 529 aa  58.9  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.62279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0993  2-ketogluconate/H(+) major facilitator transporter  23.08 
 
 		 440 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.051326  normal  0.375991 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  24.08 
 
 		 432 aa  59.3  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  34.45 
 
 		 439 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4663  major facilitator transporter  31.56 
 
 		 523 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.502876  normal  0.696249 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1292  major facilitator transporter  30.17 
 
 		 465 aa  58.2  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.674052  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4109  MFS family transporter  33.54 
 
 		 501 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.573233  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  35.29 
 
 		 439 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  35.29 
 
 		 439 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  35.29 
 
 		 439 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.06 
 
 		 478 aa  58.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3204  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.67 
 
 		 538 aa  58.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0248  drug resistance transporter  26.96 
 
 		 387 aa  57.4  0.0000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2305  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.59 
 
 		 613 aa  57.8  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2213  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 		 515 aa  57.4  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.927283  normal  0.0909458 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.12 
 
 		 527 aa  57.4  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0529  major facilitator superfamily drug efflux transporter  25.32 
 
 		 543 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.794253 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  34.48 
 
 		 440 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3897  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.53 
 
 		 518 aa  57.4  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0429353 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  24.62 
 
 		 443 aa  57  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1702  major facilitator superfamily MFS_1  31.35 
 
 		 473 aa  56.6  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.254486  normal  0.472051 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.33 
 
 		 478 aa  56.6  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1344  major facilitator transporter  34.21 
 
 		 439 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2158  major facilitator superfamily transporter  28.57 
 
 		 513 aa  56.6  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.139146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2687  major facilitator transporter  32.58 
 
 		 504 aa  56.2  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471726 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2027  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.17 
 
 		 505 aa  55.8  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.585594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1482  major facilitator superfamily MFS_1  28.36 
 
 		 403 aa  56.2  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000899768  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1384  major facilitator transporter  34.21 
 
 		 439 aa  56.2  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7473  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.51 
 
 		 514 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4077  major facilitator superfamily MFS_1  24.67 
 
 		 574 aa  56.2  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2323  transporter transmembrane protein  28.15 
 
 		 521 aa  55.5  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.13437 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3545  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.29 
 
 		 490 aa  55.1  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.482074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  25.11 
 
 		 418 aa  55.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4290  major facilitator transporter  27.33 
 
 		 476 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700844  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5186  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.66 
 
 		 506 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4562  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.66 
 
 		 506 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.573494  normal  0.0249229 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4076  major facilitator transporter  27.33 
 
 		 476 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5673  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.66 
 
 		 506 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00952524 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.12 
 
 		 502 aa  55.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  30.17 
 
 		 507 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02900  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  32.37 
 
 		 448 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278203 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.79 
 
 		 478 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7047  putative transmembrane efflux protein  32.54 
 
 		 492 aa  54.3  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0500177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1130  major facilitator superfamily MFS_1  30.43 
 
 		 491 aa  53.9  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.79 
 
 		 478 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3488  major facilitator transporter  27.01 
 
 		 469 aa  53.9  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0484  hypothetical protein  30.15 
 
 		 400 aa  53.9  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6242  major facilitator superfamily MFS_1  33.64 
 
 		 439 aa  53.9  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  25.77 
 
 		 434 aa  53.9  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3381  major facilitator transporter  28.44 
 
 		 466 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2735  major facilitator transporter  32.05 
 
 		 481 aa  53.5  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127959  normal  0.456843 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2136  major facilitator superfamily MFS_1  30.22 
 
 		 488 aa  53.1  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1486  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.6 
 
 		 482 aa  53.1  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.527824  normal  0.420653 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17950  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.47 
 
 		 521 aa  53.1  0.000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0956578  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0321  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  36.36 
 
 		 448 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.57 
 
 		 468 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73028  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>