More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1721 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1721  major facilitator transporter  100 
 
 		 432 aa  825    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309946  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3559  major facilitator superfamily MFS_1  38.06 
 
 		 417 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3974  major facilitator transporter  37.63 
 
 		 433 aa  210  5e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280222 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1148  major facilitator superfamily MFS_1  36.07 
 
 		 420 aa  194  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16310  putative MFS permease  31.11 
 
 		 413 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4565  major facilitator transporter  35.43 
 
 		 392 aa  110  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.926259  normal  0.817996 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1733  major facilitator superfamily MFS_1  30.81 
 
 		 417 aa  110  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.14636  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3847  major facilitator transporter  32.1 
 
 		 412 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4521  major facilitator transporter  32.1 
 
 		 412 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0504067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1327  major facilitator transporter  31.12 
 
 		 413 aa  99  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1403  major facilitator transporter  31.44 
 
 		 408 aa  96.3  9e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4133  major facilitator transporter  37.33 
 
 		 405 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.236743  normal  0.198961 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3381  major facilitator transporter  33.73 
 
 		 466 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1916  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.85 
 
 		 478 aa  65.5  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0782092  hitchhiker  0.00395657 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1846  major facilitator transporter  29.81 
 
 		 388 aa  64.7  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0275429  normal  0.697868 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1455  major facilitator transporter  37.4 
 
 		 443 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2578  major facilitator superfamily transporter  36.11 
 
 		 426 aa  62.8  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0148068 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  33.54 
 
 		 467 aa  62  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5012  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 490 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675946  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0175  major facilitator transporter  23.4 
 
 		 402 aa  61.6  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1835  major facilitator superfamily MFS_1  37.14 
 
 		 501 aa  60.8  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0636096  normal  0.396011 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1476  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.99 
 
 		 472 aa  60.5  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.76254  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.57 
 
 		 509 aa  60.1  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0381  major facilitator transporter  36.94 
 
 		 414 aa  60.1  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.04 
 
 		 540 aa  60.1  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 		 493 aa  59.3  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.36 
 
 		 534 aa  58.9  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1810  major facilitator superfamily MFS_1  34.62 
 
 		 491 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.174923  hitchhiker  0.00284389 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1660  major facilitator superfamily transporter  33.81 
 
 		 510 aa  58.5  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.46395  normal  0.926796 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5842  major facilitator transporter  34.96 
 
 		 456 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.09 
 
 		 488 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0031  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.67 
 
 		 483 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.665432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2160  major facilitator transporter  30 
 
 		 433 aa  57.8  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.190844  normal  0.652722 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2967  major facilitator transporter  27.73 
 
 		 378 aa  57.4  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0700  major facilitator superfamily transporter  30 
 
 		 394 aa  57.4  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1613  major facilitator transporter  27.73 
 
 		 388 aa  57  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0273655 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3984  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.36 
 
 		 646 aa  56.6  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086459  normal  0.10455 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.36 
 
 		 646 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.38 
 
 		 478 aa  55.8  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497094  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3819  major facilitator superfamily MFS_1  37.01 
 
 		 458 aa  56.2  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.247868 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4044  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.36 
 
 		 646 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3932  major facilitator superfamily MFS_1  37.01 
 
 		 458 aa  56.2  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.152264 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4168  major facilitator transporter  34.17 
 
 		 474 aa  55.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.55276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3905  major facilitator superfamily MFS_1  24.32 
 
 		 392 aa  54.3  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0803065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2098  major facilitator superfamily MFS_1  30.22 
 
 		 466 aa  54.7  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17950  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.49 
 
 		 521 aa  54.3  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0956578  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3555  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.03 
 
 		 527 aa  53.9  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.93 
 
 		 512 aa  53.9  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3502  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.56 
 
 		 474 aa  53.9  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0248  drug resistance transporter  25 
 
 		 387 aa  53.9  0.000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0907  major facilitator transporter  25.16 
 
 		 477 aa  53.5  0.000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0239598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1529  major facilitator transporter  31.65 
 
 		 476 aa  53.5  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2783  major facilitator transporter  30.04 
 
 		 409 aa  53.5  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.35447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10750  sugar efflux transporter  27.47 
 
 		 396 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.84 
 
 		 508 aa  53.5  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2154  major facilitator family transporter  30.09 
 
 		 400 aa  53.5  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6200  major facilitator superfamily MFS_1  33.18 
 
 		 481 aa  53.5  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.111664  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1017  transporter, putative  32.59 
 
 		 459 aa  52.4  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.525895  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  32.28 
 
 		 520 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.64 
 
 		 478 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.95 
 
 		 522 aa  53.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.36 
 
 		 486 aa  53.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2254  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.31 
 
 		 507 aa  53.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0213589 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.69 
 
 		 505 aa  52.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.51 
 
 		 452 aa  52  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.68 
 
 		 609 aa  52  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.667625  normal  0.81194 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3204  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32 
 
 		 538 aa  52.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1459  major facilitator superfamily MFS_1  32.11 
 
 		 411 aa  51.6  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.135074  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.17 
 
 		 474 aa  51.6  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5951  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 392 aa  52  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0421  arabinose efflux permease  29.63 
 
 		 400 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.14 
 
 		 510 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0980  sugar efflux transporter  27.47 
 
 		 396 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2391  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.4 
 
 		 480 aa  51.6  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.128985  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5967  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 455 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.34 
 
 		 475 aa  51.2  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0992  major facilitator superfamily MFS_1  23.44 
 
 		 475 aa  51.6  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00829704  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  33.61 
 
 		 463 aa  51.6  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0958  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.68 
 
 		 511 aa  51.6  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.026733  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0958  putative transporter  32.59 
 
 		 442 aa  51.6  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4861  major facilitator transporter  31.17 
 
 		 400 aa  51.2  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2203  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  33.33 
 
 		 455 aa  50.8  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190205  normal  0.434224 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5453  major facilitator transporter  31.17 
 
 		 400 aa  51.2  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5409  major facilitator transporter  31.17 
 
 		 400 aa  51.2  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0105986 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0124  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.52 
 
 		 471 aa  50.8  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.55159  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1341  major facilitator superfamily MFS_1  27.49 
 
 		 400 aa  50.8  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.590301  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3144  major facilitator superfamily MFS_1  26.96 
 
 		 411 aa  50.4  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.586682  hitchhiker  0.00799883 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.84 
 
 		 480 aa  50.4  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7424  major facilitator superfamily MFS_1  29.13 
 
 		 494 aa  50.4  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.09 
 
 		 504 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223084 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1421  major facilitator superfamily MFS_1  29.58 
 
 		 462 aa  50.1  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.756224  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4750  major facilitator transporter  28.8 
 
 		 400 aa  50.1  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.70081 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4524  major facilitator superfamily transporter  33.67 
 
 		 450 aa  50.1  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5556  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  50 
 
 		 489 aa  50.1  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0798171  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2473  major facilitator superfamily MFS_1  30.56 
 
 		 400 aa  50.1  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.852555  normal  0.95033 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2769  major facilitator transporter  25.75 
 
 		 401 aa  49.7  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  27.72 
 
 		 404 aa  49.3  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1243  major facilitator superfamily MFS_1  37.66 
 
 		 518 aa  49.3  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2995  major facilitator transporter  31.06 
 
 		 461 aa  49.3  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.35009  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5295  major facilitator transporter  28.4 
 
 		 400 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.445705 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>