More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_3847 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1327  major facilitator transporter  93.95 
 
 		 413 aa  684    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3847  major facilitator transporter  100 
 
 		 412 aa  773    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4521  major facilitator transporter  100 
 
 		 412 aa  773    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0504067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4133  major facilitator transporter  80.94 
 
 		 405 aa  490  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.236743  normal  0.198961 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16310  putative MFS permease  63.8 
 
 		 413 aa  430  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1403  major facilitator transporter  61.89 
 
 		 408 aa  385  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4565  major facilitator transporter  44.23 
 
 		 392 aa  224  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.926259  normal  0.817996 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1733  major facilitator superfamily MFS_1  39.61 
 
 		 417 aa  220  3.9999999999999997e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.14636  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3559  major facilitator superfamily MFS_1  35.05 
 
 		 417 aa  136  7.000000000000001e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3974  major facilitator transporter  34.32 
 
 		 433 aa  119  9e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280222 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1721  major facilitator transporter  32.56 
 
 		 432 aa  117  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309946  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1148  major facilitator superfamily MFS_1  30.45 
 
 		 420 aa  107  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1482  major facilitator superfamily MFS_1  31.38 
 
 		 403 aa  84.7  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000899768  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  28 
 
 		 440 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1846  major facilitator transporter  33.66 
 
 		 388 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0275429  normal  0.697868 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  26.35 
 
 		 435 aa  73.6  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1613  major facilitator transporter  33.16 
 
 		 388 aa  72.8  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0273655 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1708  major facilitator transporter  28.68 
 
 		 423 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.841617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1729  major facilitator transporter  28.68 
 
 		 423 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1776  major facilitator superfamily transporter  28.68 
 
 		 423 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4405  major facilitator transporter  29.81 
 
 		 421 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2967  major facilitator transporter  33.16 
 
 		 378 aa  70.5  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1274  major facilitator superfamily MFS_1  35.06 
 
 		 517 aa  67  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131373  normal  0.0158431 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.14 
 
 		 488 aa  65.5  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  25.46 
 
 		 439 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3580  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  28.74 
 
 		 514 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3242  major facilitator superfamily MFS_1  34.32 
 
 		 401 aa  63.5  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3851  major facilitator superfamily MFS_1  27.65 
 
 		 505 aa  62.4  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  25 
 
 		 439 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1765  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.21 
 
 		 413 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.236916  hitchhiker  0.00655505 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  25 
 
 		 439 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  25 
 
 		 439 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.68 
 
 		 478 aa  60.5  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497094  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2158  major facilitator superfamily transporter  34.23 
 
 		 513 aa  60.5  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.139146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3411  major facilitator transporter  28.66 
 
 		 512 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154206  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5330  major facilitator transporter  28.66 
 
 		 512 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.63801  normal  0.029348 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4956  major facilitator transporter  28.66 
 
 		 512 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0729589 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0722  major facilitator transporter  28.66 
 
 		 512 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.103556  normal  0.139751 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1563  major facilitator transporter  34.03 
 
 		 503 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0965366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3271  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.8 
 
 		 411 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.638949 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4897  major facilitator transporter  29.03 
 
 		 512 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672511  normal  0.0228989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3897  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.23 
 
 		 518 aa  59.7  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0429353 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0322  major facilitator transporter  25.82 
 
 		 390 aa  58.9  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4378  major facilitator transporter  29.03 
 
 		 512 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0749958 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.1 
 
 		 468 aa  59.7  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.3 
 
 		 512 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  23.27 
 
 		 436 aa  59.3  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4762  major facilitator transporter  31.16 
 
 		 514 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3447  major facilitator transporter  30.32 
 
 		 476 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0529  major facilitator superfamily drug efflux transporter  27.8 
 
 		 543 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.794253 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.93 
 
 		 486 aa  57.8  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3488  major facilitator transporter  29.1 
 
 		 469 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36718  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.01 
 
 		 540 aa  58.2  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  24.61 
 
 		 440 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6242  major facilitator superfamily MFS_1  23.99 
 
 		 439 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3663  major facilitator transporter  28.75 
 
 		 512 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.691362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2353  major facilitator transporter  25.66 
 
 		 529 aa  57.4  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.62279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1344  major facilitator transporter  25.12 
 
 		 439 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0248  drug resistance transporter  25.63 
 
 		 387 aa  57.4  0.0000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2098  major facilitator superfamily MFS_1  30.49 
 
 		 466 aa  57  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2172  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.52 
 
 		 524 aa  57.4  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.632286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  27.31 
 
 		 416 aa  57  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  23.7 
 
 		 453 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.16 
 
 		 478 aa  57.4  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05310  arabinose efflux permease family protein  32.39 
 
 		 400 aa  57  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  25.36 
 
 		 386 aa  57  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2213  major facilitator superfamily MFS_1  27.42 
 
 		 515 aa  57  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.927283  normal  0.0909458 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1384  major facilitator transporter  25.12 
 
 		 439 aa  57  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4699  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.82 
 
 		 599 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4290  major facilitator transporter  29.38 
 
 		 476 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700844  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4076  major facilitator transporter  29.38 
 
 		 476 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8828  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.41 
 
 		 458 aa  56.6  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00337993  hitchhiker  0.00204639 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0819  major facilitator family transporter  21.72 
 
 		 393 aa  56.6  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.23042e-52 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1447  major facilitator superfamily MFS_1  25.32 
 
 		 399 aa  55.8  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.320461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1745  RemN protein  29.08 
 
 		 582 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0381  major facilitator transporter  28.76 
 
 		 414 aa  55.8  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17950  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.07 
 
 		 521 aa  55.8  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0956578  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3510  major facilitator transporter  26.87 
 
 		 427 aa  56.2  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.935373  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3545  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.95 
 
 		 490 aa  56.2  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.482074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7927  major facilitator transporter  30.33 
 
 		 409 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.437479  normal  0.239391 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  24.8 
 
 		 453 aa  56.2  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.29 
 
 		 478 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0561  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.82 
 
 		 599 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000151463  hitchhiker  0.00000000000000678179 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4109  MFS family transporter  33.85 
 
 		 501 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.573233  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0461  multidrug resistance protein  28.77 
 
 		 528 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0322246  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0922  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.77 
 
 		 528 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0612097  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.54 
 
 		 509 aa  55.1  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6216  major facilitator transporter  24.31 
 
 		 460 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5712  general substrate transporter  27.93 
 
 		 406 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195276 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3169  major facilitator superfamily MFS_1  25.75 
 
 		 462 aa  55.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115425  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0603  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.65 
 
 		 498 aa  55.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0721  multidrug resistance protein  28.77 
 
 		 528 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000165974  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1722  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 372 aa  55.5  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.36396  normal  0.2591 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1992  multidrug resistance protein  28.77 
 
 		 528 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000335607  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4077  major facilitator superfamily MFS_1  27.49 
 
 		 574 aa  55.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0186  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.77 
 
 		 528 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.69763  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  22.1 
 
 		 451 aa  55.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0189  major facilitator superfamily MFS_1  29.74 
 
 		 415 aa  55.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0033  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.94 
 
 		 541 aa  55.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0460  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.77 
 
 		 528 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>