40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2967 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2967  major facilitator transporter  100 
 
 		 378 aa  708    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1613  major facilitator transporter  99.21 
 
 		 388 aa  700    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0273655 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1846  major facilitator transporter  82.8 
 
 		 388 aa  543  1e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0275429  normal  0.697868 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1810  putative major facilitator superfamily transport protein  51.4 
 
 		 390 aa  273  5.000000000000001e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.521814  normal  0.460294 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1097  major facilitator transporter  46.75 
 
 		 394 aa  258  2e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0175  major facilitator transporter  33.89 
 
 		 402 aa  161  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1722  major facilitator transporter  38.44 
 
 		 372 aa  160  3e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.36396  normal  0.2591 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16310  putative MFS permease  33.03 
 
 		 413 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1403  major facilitator transporter  35.14 
 
 		 408 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3974  major facilitator transporter  27 
 
 		 433 aa  65.1  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280222 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4565  major facilitator transporter  31.39 
 
 		 392 aa  60.8  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.926259  normal  0.817996 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1721  major facilitator transporter  26.2 
 
 		 432 aa  60.8  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309946  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4521  major facilitator transporter  33.16 
 
 		 412 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0504067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3847  major facilitator transporter  33.16 
 
 		 412 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1327  major facilitator transporter  31.63 
 
 		 413 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0744  major facilitator transporter  27.65 
 
 		 433 aa  57.4  0.0000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0364296  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1567  multidrug resistance efflux transporter, putative  26.26 
 
 		 433 aa  54.7  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1378  multidrug resistance efflux transporter, putative  26.26 
 
 		 433 aa  54.7  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.993613  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3559  major facilitator superfamily MFS_1  37.38 
 
 		 417 aa  52.8  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0274  multidrug ABC transporter  26.71 
 
 		 433 aa  52  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.351648  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0097  major facilitator superfamily MFS_1  32.61 
 
 		 516 aa  48.9  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2577  YD repeat-containing protein  28.12 
 
 		 1565 aa  47.8  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.328115  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2570  YD repeat-containing protein  28.12 
 
 		 1565 aa  47.8  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.332337  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0350  major facilitator superfamily MFS_1  29.92 
 
 		 520 aa  47.4  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.976424  normal  0.915508 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0171  drug resistance transporter,putative, EmrB/QacA subfamily  29.92 
 
 		 534 aa  47.4  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.966244  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1733  major facilitator superfamily MFS_1  26.98 
 
 		 417 aa  47  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.14636  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1788  major facilitator transporter  34.19 
 
 		 433 aa  46.6  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.158886  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3560  major facilitator transporter  27.43 
 
 		 411 aa  45.4  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3785  major facilitator superfamily MFS_1  28.24 
 
 		 462 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.664159  normal  0.0826493 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4133  major facilitator transporter  32.46 
 
 		 405 aa  45.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.236743  normal  0.198961 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1085  major facilitator transporter  26.37 
 
 		 454 aa  44.3  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  0.00000502867 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0818  major facilitator transporter  30.22 
 
 		 429 aa  44.7  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3274  major facilitator superfamily MFS_1  26.43 
 
 		 454 aa  44.3  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1037  major facilitator superfamily MFS_1  25.99 
 
 		 454 aa  43.9  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1251  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  26.16 
 
 		 503 aa  43.5  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157132  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64750  putative MFS transporter  31.95 
 
 		 446 aa  43.9  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4418  major facilitator transporter  35.78 
 
 		 407 aa  43.9  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.39928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0010  multidrug-efflux transporter  26.16 
 
 		 430 aa  43.9  0.005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3242  major facilitator superfamily MFS_1  33.91 
 
 		 539 aa  43.5  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00325514  normal  0.76951 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4667  major facilitator transporter  34.78 
 
 		 433 aa  42.7  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.207376  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>