14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1722 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1722  major facilitator transporter  100 
 
 		 372 aa  698    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.36396  normal  0.2591 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1810  putative major facilitator superfamily transport protein  39.89 
 
 		 390 aa  172  5.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.521814  normal  0.460294 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1846  major facilitator transporter  36.8 
 
 		 388 aa  156  6e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0275429  normal  0.697868 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1613  major facilitator transporter  38.07 
 
 		 388 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0273655 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0175  major facilitator transporter  30.85 
 
 		 402 aa  144  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2967  major facilitator transporter  38.19 
 
 		 378 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1097  major facilitator transporter  35.29 
 
 		 394 aa  139  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16310  putative MFS permease  31.07 
 
 		 413 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1403  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 408 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3974  major facilitator transporter  28.48 
 
 		 433 aa  53.5  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280222 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4565  major facilitator transporter  32.8 
 
 		 392 aa  52.4  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.926259  normal  0.817996 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1733  major facilitator superfamily MFS_1  27.5 
 
 		 417 aa  47.8  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.14636  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3559  major facilitator superfamily MFS_1  36 
 
 		 417 aa  46.6  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1327  major facilitator transporter  28.83 
 
 		 413 aa  44.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>