244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4565 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4565  major facilitator transporter  100 
 
 		 392 aa  724    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.926259  normal  0.817996 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1733  major facilitator superfamily MFS_1  51.02 
 
 		 417 aa  298  1e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.14636  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16310  putative MFS permease  43.88 
 
 		 413 aa  258  9e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1403  major facilitator transporter  45.43 
 
 		 408 aa  230  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1327  major facilitator transporter  43.39 
 
 		 413 aa  230  4e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3847  major facilitator transporter  44.23 
 
 		 412 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4521  major facilitator transporter  44.23 
 
 		 412 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0504067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4133  major facilitator transporter  41.55 
 
 		 405 aa  180  4e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.236743  normal  0.198961 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3559  major facilitator superfamily MFS_1  35.08 
 
 		 417 aa  152  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3974  major facilitator transporter  36.68 
 
 		 433 aa  141  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280222 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1721  major facilitator transporter  34.56 
 
 		 432 aa  119  7e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309946  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1148  major facilitator superfamily MFS_1  33.58 
 
 		 420 aa  115  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1097  major facilitator transporter  41.5 
 
 		 394 aa  78.2  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1810  putative major facilitator superfamily transport protein  37.25 
 
 		 390 aa  65.9  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.521814  normal  0.460294 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2691  major facilitator family transporter  31.31 
 
 		 454 aa  65.1  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0232907  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1613  major facilitator transporter  31.39 
 
 		 388 aa  64.7  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0273655 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2967  major facilitator transporter  31.39 
 
 		 378 aa  63.9  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6242  major facilitator superfamily MFS_1  37.62 
 
 		 439 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6468  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.52 
 
 		 534 aa  63.5  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1384  major facilitator transporter  39.6 
 
 		 439 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  39.6 
 
 		 439 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1344  major facilitator transporter  39.6 
 
 		 439 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  39.6 
 
 		 439 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  39.6 
 
 		 439 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3877  major facilitator transporter  31.79 
 
 		 464 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  38.61 
 
 		 439 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1274  major facilitator superfamily MFS_1  33.95 
 
 		 517 aa  58.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131373  normal  0.0158431 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0513  major facilitator transporter  32.83 
 
 		 464 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0744  major facilitator transporter  30.28 
 
 		 433 aa  58.2  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0364296  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5472  major facilitator transporter  25.96 
 
 		 437 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1846  major facilitator transporter  31.72 
 
 		 388 aa  57  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0275429  normal  0.697868 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02040  efflux protein, putative  29.48 
 
 		 618 aa  57  0.0000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.239478  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1015  major facilitator superfamily MFS_1  31.28 
 
 		 479 aa  57  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.449105 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1722  major facilitator transporter  31.93 
 
 		 372 aa  56.6  0.0000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.36396  normal  0.2591 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4719  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 464 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.210959 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0484  major facilitator family transporter  30.26 
 
 		 464 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291295 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2726  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.93 
 
 		 500 aa  55.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6215  major facilitator transporter  28.82 
 
 		 417 aa  54.3  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0517  major facilitator transporter  30.26 
 
 		 464 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0921044 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  35.64 
 
 		 440 aa  54.3  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.81 
 
 		 485 aa  54.7  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4340  major facilitator transporter  28.04 
 
 		 480 aa  53.9  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.199167  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5050  general substrate transporter  33.1 
 
 		 465 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243206 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2172  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.46 
 
 		 524 aa  53.1  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.632286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3897  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.01 
 
 		 518 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0429353 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4519  major facilitator transporter  29.74 
 
 		 464 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.301476  normal  0.140313 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.43 
 
 		 478 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3885  major facilitator superfamily MFS_1  37.29 
 
 		 403 aa  52.8  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.37466  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.43 
 
 		 484 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  30.07 
 
 		 440 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2294  major facilitator family transporter  27.55 
 
 		 458 aa  52.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.843575  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  33.53 
 
 		 467 aa  52  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0175  major facilitator transporter  29.45 
 
 		 402 aa  52  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0196  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.01 
 
 		 532 aa  52  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.904476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0995  DNA polymerase III, alpha subunit  31.17 
 
 		 471 aa  52.4  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000812271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2934  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 441 aa  52  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14658  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.88 
 
 		 469 aa  51.6  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1437  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.71 
 
 		 520 aa  52  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0655  major facilitator family transporter  29.74 
 
 		 464 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2796  major facilitator superfamily protein  31.21 
 
 		 493 aa  51.6  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.252662  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.05 
 
 		 646 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2204  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.28 
 
 		 402 aa  51.2  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4044  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.05 
 
 		 646 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02423  major facilitator family transporter  32.03 
 
 		 440 aa  50.8  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.796992  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  29.29 
 
 		 436 aa  50.8  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1255  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  31.07 
 
 		 476 aa  50.8  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.269768 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.97 
 
 		 493 aa  50.8  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3552  major facilitator superfamily MFS_1  30.34 
 
 		 511 aa  50.8  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2392  major facilitator transporter  27.14 
 
 		 450 aa  50.4  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2132  major facilitator transporter  24.56 
 
 		 463 aa  50.4  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0248784 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2256  major facilitator superfamily MFS_1  26.99 
 
 		 504 aa  50.1  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2329  major facilitator transporter  28.4 
 
 		 479 aa  50.4  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.371241  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0184  multidrug-efflux transporter  24.16 
 
 		 430 aa  50.1  0.00006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000154899  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3984  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.5 
 
 		 646 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086459  normal  0.10455 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.36 
 
 		 506 aa  50.1  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.09 
 
 		 478 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1421  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 		 462 aa  50.1  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.756224  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1502  major facilitator family protein  28.1 
 
 		 465 aa  49.3  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0366  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.64 
 
 		 461 aa  49.3  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0742092  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8779  putative transport protein  28.88 
 
 		 481 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3686  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.62 
 
 		 546 aa  49.3  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.455316 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.12 
 
 		 502 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.6 
 
 		 504 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223084 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0410  multidrug-efflux transporter  24.65 
 
 		 433 aa  49.3  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1756  arabinose efflux permease  28.57 
 
 		 516 aa  49.3  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1037  major facilitator superfamily MFS_1  31.69 
 
 		 454 aa  49.7  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.85 
 
 		 486 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3894  major facilitator superfamily MFS_1  28.96 
 
 		 490 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.925451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0138  major facilitator transporter  25.7 
 
 		 391 aa  48.9  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412913  normal  0.0151016 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.85 
 
 		 486 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.85 
 
 		 486 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.85 
 
 		 486 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1378  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.29 
 
 		 520 aa  48.1  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2811  major facilitator superfamily MFS_1  25.13 
 
 		 419 aa  48.5  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.501035  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.85 
 
 		 486 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.85 
 
 		 486 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1413  major facilitator transporter  23.95 
 
 		 479 aa  48.1  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.118786 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17950  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.77 
 
 		 521 aa  48.5  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0956578  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1292  major facilitator transporter  28.1 
 
 		 465 aa  48.5  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.674052  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4562  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.59 
 
 		 506 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.573494  normal  0.0249229 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>